一種砂梨基因檢測芯片的制作方法
【專利摘要】一種砂梨基因檢測芯片,包括砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列,其特征在于,砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列排列于帶正電荷硅烷化材料膜層上,至少有4個陣列,一個陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測探針,一個陣列可檢測一個品種;砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列又貼在基片上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測芯片。
【專利說明】—種砂梨基因檢測芯片
【技術領域】
[0001]本實用新型涉及一種基因芯片,特別是一種砂梨S基因cDNA檢測芯片的結構,主要用于對砂梨品種的基因組DNA進行PCR-RFLP系統檢測和DNA序列分析。
【背景技術】
[0002]砂梨是重要的經濟樹種,但砂梨與絕大多數梨品種一樣,自花授粉結實率極低,有的甚至不結實,表現出典型的配子體自交不親和性,當不同品種異花授粉時,自交不親和基因型相同也會出現結實率低或不結實,這種現象在遺傳學上也歸屬于自交不親和現象;自交不親和性的本質是成熟雌蕊分泌的一種RNase抑制其相同S基因型花粉在柱頭;因此現在很多研究梨的都在研究梨的S基因,在生產和育種上也需鑒定品種的S基因犁以確定品種間的親和性。在研究梨的S基因往往都是會通過基因芯片來進行;基因芯片(genechip)(又稱DNA芯片、生物芯片)通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置的核酸探針產生互補匹配時,通過確定熒光強度最強的探針位置,獲得一組序列完全互補的探針序列。據此可重組出靶核酸的序列。但現有的用于檢測砂梨S基因cDNA檢測芯片都是單個獨立的基因芯片,這樣在進行檢測時需要準備很多單個的基因芯片,可由于基因芯片本身比較小,因此很難以把握,一不小心就會使基因芯片出現故障,因此很有必要對此加以改進。通過國內專利文獻檢索發現有一些相關的文獻報道,與本實用新型有關的主要有以下一些:
[0003]1、專利號為CN201220371254.0,名稱為“基因芯片”的實用新型專利,該專利公開了一種基因芯片。本實用新型技術方案是芯片窗口中的基片的層級依次是上層為膜,下層為背襯層,膜采用的是尼龍膜,背襯層,為合成樹脂膠粘劑。本實用新型解決了現有的檢測各種疾病的生物芯片王要為蛋白芯片的缺陷。
[0004]2、專利號為CN201310166271.X,名稱為“一種電化學基因芯片”的發明新型專利,該專利公開了一種一種電化學基因芯片。其包括流體腔、通道模塊、與通道模塊相貼合的探針電路板,通道模塊上設有微流槽,通道模塊與探針電路板貼合后通過微流槽和探針電路板表面相接觸形成微流管道,流體腔與微流管道相通,探針電路板上沿著微流管道設有用于為電化學伏安掃描提供基準參考電壓的參考電極、用于連通電化學激勵電路的輔助電極和用于連接檢測電路的工作電極,工作電極上固定有單分子層和DNA捕獲探針。
[0005]3、專利號為CN200720071634.1,名稱為“一種基因芯片”的實用新型專利,該專利公開了一種方便經濟的組合型基因芯片,涉及生物芯片技術和體外臨床診斷檢測【技術領域】,由載體和覆蓋在載體上有鏤空反應區的粘性膜組合而成。
[0006]上述這些專利雖然涉及到了基因芯片,可仔細分析可以看出,這些基因芯片都不是砂梨S基因CDNA檢測芯片,更沒有提出如何解決多個檢測芯片的排列問題。
實用新型內容
[0007]本實用新型的目的在于針對現有砂梨S基因cDNA檢測芯片所存在的不足,提供一種新型的砂梨S基因cDNA檢測芯片,該種砂梨S基因cDNA檢測芯片可以將多個檢測芯片組合起來,且具有很好的使用效果。
[0008]為了實現上述目的,本實用新型所采取的技術措施是:一種砂梨基因檢測芯片,包括砂梨S基因CDNA檢測探針點陣陣列,砂梨S基因CDNA檢測探針點陣陣列排列于帶正電荷硅烷化材料膜層上,至少有4個陣列,一個陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測探針,一個陣列可檢測一個品種;砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列又貼在基片上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測芯片。
[0009]進一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列是粘貼在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
[0010]進一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列是對稱排列在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
[0011]進一步地,所述的帶正電荷硅烷化材料膜層被覆于基片上,基片的表面為玻片片基表面,片基表面被氨基修飾,帶正電荷,與CDNA上帶負電荷的磷酸基以離子鍵結合,將砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列牢固地固定于基片上。
[0012]進一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列的每個陣列均含有200個陣點,每個陣點就是具有一定濃度的固定于基片上的特異的檢測探針,砂梨S基因cDNA檢測芯片的每個陣列包含45個S基因特異的cDNA檢測探針,每個探針在陣列中點樣重復4次,2個無關基因(與S基因同源性極低的基因),2個管家基因(在梨的葉中表達穩定的基因)作為對照,其片段長度與S基因特異片段長度一致,在芯片陣列中點樣各重復4次,空白點樣重復4次。
[0013]本實用新型的優點在于,通過將砂梨S基因cDNA特異檢測探針點陣陣列排列于帶正電荷膜層上,通過砂梨基因檢測芯片與未知S基因型砂梨品種的葉cDNA雜交可鑒定該品種的S基因和S基因型,一個陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測探針,通過與未知S基因型砂梨品種的葉cDNA雜交可鑒定該品種的S基因和S基因型,一個陣列可檢測一個品種;可以實現一個芯片檢測多個品種,這樣可以大大減少芯片的個數,提高檢測效率。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0014]圖1,本實用新型的結構示意圖。
【具體實施方式】
[0015]下面將結合附圖和實施例對本實用新型做進一步的描述。
[0016]通過附圖可以看出本實用新型為一種一種砂梨基因檢測芯片,包括砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列3,砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列3排列于帶正電荷硅烷化材料膜2上,至少有4個陣列,一個陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測探針,一個陣列可檢測一個品種;砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列3又貼在基片I上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測芯片4。
[0017]進一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列3是粘貼在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
[0018]進一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列是對稱排列在帶正電荷硅烷化材料膜層2上的。
[0019]進一步地,所述的帶正電荷硅烷化材料膜層2被覆于基片I上,基片I的表面為玻片片基表面,片基表面被氨基修飾,帶正電荷,與cDNA上帶負電荷的磷酸基以離子鍵結合,將砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列牢固地固定于基片上。
[0020]進一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列3的每個陣列均含有200個陣點,每個陣點就是具有一定濃度的固定于基片上的特異的檢測探針,砂梨S基因cDNA檢測芯片的每個陣列包含45個S基因特異的cDNA檢測探針,每個探針在陣列中點樣重復4次,2個無關基因(與S基因同源性極低的基因),2個管家基因(在梨的葉中表達穩定的基因)作為對照,其片段長度與S基因特異片段長度一致,在芯片陣列中點樣各重復4次,空白點樣重復4次。
【權利要求】
1.一種砂梨基因檢測芯片,包括砂梨S基因CDNA檢測探針點陣陣列,其特征在于,砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列排列于帶正電荷硅烷化材料膜層上,至少有4個陣列,一個陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測探針,一個陣列可檢測一個品種;所述的帶正電荷硅烷化材料膜層被覆于基片上,基片的表面為玻片片基表面,片基表面被氨基修飾,帶正電荷,與cDNA上帶負電荷的磷酸基以離子鍵結合,將砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列牢固地固定于基片上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測芯片。
2.如權利要求1所述的砂梨基因檢測芯片,其特征在于,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列是粘貼在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
3.如權利要求1所述的砂梨基因檢測芯片,其特征在于,所述的砂梨S基因cDNA檢測探針點陣陣列是對稱排列在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
【文檔編號】C12M1/34GK204097484SQ201320647212
【公開日】2015年1月14日 申請日期:2013年10月21日 優先權日:2013年10月21日
【發明者】江南, 譚曉風 申請人:湖南工業大學