本公開一般涉及使用能夠以hla不可知(hla-agnostic)的方式激活t細胞的修飾抗原呈遞細胞(“增強型apc”)來治療受試者的hpv相關(guān)癌癥的方法，及其劑量和方案。

背景技術(shù)：

1、人乳頭瘤病毒(hpv)是一種感染許多人的病毒。事實上，超過75％的女性和男性會在一生中的某個時刻被感染。雖然大多數(shù)hpv感染都是亞臨床性的，不會引起任何身體癥狀，但在一些人中，感染可能會導(dǎo)致稱為乳頭狀瘤的生長，甚至可能會導(dǎo)致宮頸癌、外陰癌、陰道癌、陰莖癌、口咽癌和肛門癌。具體來說，hpv16和hpv18已知會導(dǎo)致約70％的宮頸癌病例。目前尚無針對hpv本身的治療方法。目前的治療方案通常旨在治療可能與hpv感染相關(guān)的各種病痛。雖然疫苗(例如，)已獲批準，但其本質(zhì)上僅起預(yù)防作用，且并非沒有副作用。因此，需要新的hpv感染替代治療方案。

2、本文引用的所有參考文獻，包括專利申請和出版物，均通過引用整體并入。專利公布wo?2013/059343、wo?2015/023982、wo?2016/070136、wo2017041050、wo2017008063、wo2017/192785、wo?2017/192786、wo?2019/178005、wo?2019/178006、wo?2020/072833、wo2020/154696和wo?2020/176789、us?20180142198和us?20180201889特此通過引用整體明確并入。

技術(shù)實現(xiàn)思路

1、本文提供了一種用于治療有需要的受試者中的人乳頭瘤病毒(hpv)相關(guān)癌癥的方法，所述方法包括向受試者施用包含修飾的抗原呈遞細胞(“增強型apc”)的組合物，其中增強型apc包含hpv抗原并且能夠以hla不可知的方式激活t細胞。在一些方面，所述方法還包括向受試者施用免疫檢查點抑制劑。本文還提供了一種用于治療有需要的受試者中的人乳頭瘤病毒(hpv)相關(guān)癌癥的方法，所述方法包括向受試者施用(i)包含修飾的抗原呈遞細胞(“增強型apc”)的組合物，其中增強型apc包含hpv抗原并且能夠以hla不可知的方式激活t細胞，和(ii)免疫檢查點抑制劑。

2、在一些方面，增強型apc包括t細胞、b細胞、nk細胞、單核細胞或其組合。在一些方面，hpv抗原包括hpv-16抗原或hpv-18抗原。在一些方面，hpv抗原包括源自hpv?e6和/或hpve7的肽。在一些方面，hpv抗原包括源自hpv?e6的肽和源自hpv?e7的肽。在一些方面，源自hpv?e6和/或hpv?e7的肽是全長e6和/或e7。在一些方面，hpv抗原包含seq?id?no:14-17中任一個所示的氨基酸序列。在一些方面，hpv抗原包含含有seq?id?no:14所示的氨基酸序列的第一抗原和含有seq?id?no:15所示的氨基酸序列的第二抗原。在一些方面，hpv抗原包含含有seq?id?no:16所示的氨基酸序列的第一抗原和含有seq?id?no:17所示的氨基酸序列的第二抗原。

3、在一些方面，與相應(yīng)的未修飾apc(“參考apc”)相比，增強型apc表現(xiàn)出共刺激分子的表達增加。在一些方面，共刺激分子包括cd86。在一些方面，與相應(yīng)的未修飾apc(“參考apc”)相比，增強型apc表現(xiàn)出細胞因子的表達增加。在一些方面，細胞因子包括膜結(jié)合細胞因子。在一些方面，細胞因子包括il-2、il-12或兩者。

4、在一些方面，增強型apc已通過以下方式制備：使包含輸入apc的細胞懸浮液穿過細胞變形收縮部，從而在apc中引起擾動，使得編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸在與apc接觸時通過擾動進入apc，從而產(chǎn)生增強型apc。在一些方面，包含輸入apc的細胞懸浮液已與編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸組合培養(yǎng)，使得編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸與輸入apc接觸。在一些方面，編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸是mrna。在一些方面，細胞變形收縮部的直徑為約4.2μm至約6μm或約4.2μm至約4.8μm。

5、在本文提供的任何方法中，在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中進行調(diào)節(jié)。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約2小時至約10小時。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約3小時至約6小時。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約4小時。在一些方面，增強型apc已在約37℃的包含佐劑的培養(yǎng)基中進行調(diào)節(jié)。在一些方面，佐劑包括cpg寡脫氧核苷酸(odn)、lps、ifn-α、sting激動劑、rig-i激動劑、聚i:c、r837、r848、tlr3激動劑、tlr4激動劑或tlr?9激動劑。在一些方面，佐劑是odn。

6、對于本文提供的包括施用免疫檢查點抑制劑的任何方法，在一些方面，免疫檢查點抑制劑包括ctla-4的拮抗劑和/或pd-1/pd-l1的拮抗劑。在一些方面，免疫檢查點抑制劑是pd-1/pd-l1的拮抗劑。在一些方面，pd-1/pd-l1的拮抗劑是結(jié)合pd-1的抗體或結(jié)合pd-l1的抗體。在一些方面，ctla-4的拮抗劑是結(jié)合ctla-4的抗體。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是帕博利珠單抗(pembrolizumab)。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是納武利尤單抗(nivolumab)。在一些方面，結(jié)合pd-l1的抗體是阿替利珠單抗(atezolizumab)。在一些方面，結(jié)合ctla-4的抗體是伊匹木單抗(ipilimumab)。

7、本文提供了一種用于治療有需要的受試者中的hpv+復(fù)發(fā)性、局部晚期或轉(zhuǎn)移性腫瘤的方法，所述方法包括向受試者施用包含修飾的抗原呈遞細胞(“增強型apc”)的組合物，其中增強型apc包含hpv抗原并且能夠以hla不可知的方式激活t細胞。

8、對于此種方法，在一些方面，增強型apc包括t細胞、b細胞、nk細胞、單核細胞或其組合。在一些方面，hpv抗原包括hpv-16抗原或hpv-18抗原。在一些方面，hpv抗原包括源自hpv?e6和/或hpv?e7的肽。在一些方面，hpv抗原包括源自hpv?e6的肽和源自hpv?e7的肽。在一些方面，源自hpv?e6和/或hpv?e7的肽是全長e6和/或e7。在一些方面，hpv抗原包含seqid?no:14-17中任一個所示的氨基酸序列。在一些方面，hpv抗原包含含有seq?id?no:14所示的氨基酸序列的第一抗原和含有seq?id?no:15所示的氨基酸序列的第二抗原。在一些方面，hpv抗原包含含有seq?id?no:16所示的氨基酸序列的第一抗原和含有seq?id?no:17所示的氨基酸序列的第二抗原。

9、在一些方面，與相應(yīng)的未修飾apc(“參考apc”)相比，增強型apc表現(xiàn)出共刺激分子的表達增加。在一些方面，共刺激分子包括cd86。在一些方面，與相應(yīng)的未修飾apc(“參考apc”)相比，增強型apc表現(xiàn)出細胞因子的表達增加。在一些方面，細胞因子包括膜結(jié)合細胞因子。在一些方面，細胞因子包括il-2、il-12或兩者。

10、在一些方面，增強型apc已通過以下方式制備：使包含輸入apc的細胞懸浮液穿過細胞變形收縮部，從而在apc中引起擾動，使得編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸在與apc接觸時通過擾動進入apc，從而產(chǎn)生增強型apc。在一些方面，包含輸入apc的細胞懸浮液已與編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸組合培養(yǎng)，使得編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸與輸入apc接觸。

11、在一些方面，編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和/或編碼細胞因子的核酸是mrna。在一些方面，細胞變形收縮部的直徑為約4.2μm至約6μm或約4.2μm至約4.8μm。

12、在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中進行調(diào)節(jié)。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約2小時至約10小時。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約3小時至約6小時。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約4小時。在一些方面，增強型apc已在約37℃的包含佐劑的培養(yǎng)基中進行調(diào)節(jié)。在一些方面，佐劑包括cpg寡脫氧核苷酸(odn)、lps、ifn-α、sting激動劑、rig-i激動劑、聚i:c、r837、r848、tlr3激動劑、tlr4激動劑或tlr?9激動劑。在一些方面，佐劑是odn。

13、對于上述任何方法，在一些方面，包含增強型apc的組合物與免疫檢查點抑制劑組合施用。在一些方面，一種或多種免疫檢查點抑制劑包括ctla-4的拮抗劑和/或pd-1/pd-l1的拮抗劑。在一些方面，免疫檢查點抑制劑是pd-1/pd-l1的拮抗劑。在一些方面，pd-1/pd-l1的拮抗劑是結(jié)合pd-1的抗體或結(jié)合pd-l1的抗體。在一些方面，ctla-4的拮抗劑是結(jié)合ctla-4的抗體。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是帕博利珠單抗。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是納武利尤單抗。在一些方面，結(jié)合pd-l1的抗體是阿替利珠單抗。在一些方面，結(jié)合ctla-4的抗體是伊匹木單抗。

14、在一些方面，可使用本文提供的方法治療的受試者是人。在一些方面，所述受試者對人乳頭瘤病毒16型(hpv16+)呈陽性。在一些方面，hpv相關(guān)癌癥和/或hpv+腫瘤包括宮頸癌、肛門癌、外陰癌、陰道癌、陰莖癌或口咽癌。

15、對于本文提供的任何治療方法，在一些方面，包含增強型apc的組合物以約0.25×106個細胞/kg至約7.50×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約0.5×106個細胞/kg至約5.0×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約0.5×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約2.5×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約5.0×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約0.25×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約1.25×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約3.25×106個細胞/kg的量施用。在一些方面，包含增強型apc的組合物以約7.5×106個細胞/kg的量施用。

16、對于本文提供的任何治療方法，在一些方面，包含增強型apc的組合物通過靜脈內(nèi)施用。當所述方法包括施用免疫檢查點抑制劑時，在一些方面，免疫檢查點抑制劑通過靜脈內(nèi)、口服或皮下施用。在一些方面，免疫檢查點抑制劑通過靜脈內(nèi)施用。

17、在一些方面，帕博利珠單抗以約10mg至約400mg的量施用。在一些方面，帕博利珠單抗以約200mg至約400mg的量施用。在一些方面，帕博利珠單抗以約200mg的量施用。

18、在一些方面，納武利尤單抗以約15mg至約500mg的量施用。在一些方面，納武利尤單抗以約240mg至約480mg的量施用。在一些方面，納武利尤單抗以約360mg的量施用。

19、在一些方面，阿替利珠單抗以約75mg至約1700mg的量施用。在一些方面，阿替利珠單抗以約840mg至約1680mg的量施用。在一些方面，阿替利珠單抗以約1200mg的量施用。

20、在一些方面，伊匹木單抗以約1mg/kg至約10mg/kg的量施用。在一些方面，伊匹木單抗以約1mg/kg至約3mg/kg的量施用。

21、對于本文提供的任何治療方法，在一些方面，在三周周期的第1天施用包含增強型apc的組合物。在一些方面，進一步在第一個三周周期的第2天施用包含增強型apc的組合物。在一些方面，在每個三周周期的第1天施用約0.25×106個細胞/kg、約0.5×106個細胞/kg、約1.25×106個細胞/kg、約2.5×106個細胞/kg、約3.25×106個細胞/kg、約5.0×106個細胞/kg或約7.50×106個細胞/kg。在一些方面，在第一個三周周期的第2天施用約0.25×106個細胞/kg、約0.5×106個細胞/kg、約1.25×106個細胞/kg、約2.5×106個細胞/kg、約3.25×106個細胞/kg、約5.0×106個細胞/kg或約7.50×106個細胞/kg。

22、在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體、結(jié)合pd-l1的抗體和/或結(jié)合ctla-4的抗體每三周周期施用一次。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體在三周周期的第1天施用。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體在第一個三周周期的第8天施用。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體在第一個三周周期的第8天和每個后續(xù)三周周期的第1天施用。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體在第三個三周周期的第1天施用。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體在第三個三周周期的第1天和每個后續(xù)三周周期的第1天施用。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是帕博利珠單抗，其中帕博利珠單抗以約200mg的量施用。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是納武利尤單抗，其中納武利尤單抗以約360mg的量施用。在一些方面，結(jié)合ctla-4的抗體在每個三周周期的第1天施用。在一些方面，結(jié)合ctla-4的抗體每兩個三周周期施用一次。在一些方面，結(jié)合ctla-4的抗體是伊匹木單抗，其中伊匹木單抗以約3mg/kg的劑量施用。在一些方面，結(jié)合pd-l1的抗體在第一個三周周期的第8天和每個后續(xù)周期的第1天施用。在一些方面，結(jié)合pd-l1的抗體是阿替利珠單抗，其中阿替利珠單抗以約1200mg的劑量施用。

23、對于本文提供的任何治療方法，在一些方面，將包含增強型apc的組合物施用至受試者至少約3個月、6個月、9個月、12個月、15個月、18個月、21個月或24個月。

24、在一些方面，包含增強型apc的組合物包含：(a)約5×106個增強型apc至約1x109個增強型apc，(b)濃度為約40％至約95％(重量/重量)的冷凍保存培養(yǎng)基，(c)濃度為約25％至約35％(重量/重量)的低溫保存培養(yǎng)基，和(d)濃度為15％至約25％(重量/重量)的人血清白蛋白溶液，其中組合物的ph為約ph?6.0至約ph?8.5。在一些方面，包含增強型apc的組合物包含：(a)約8.1×107個增強型apc，(b)濃度為約50％(重量/重量)的冷凍保存培養(yǎng)基，(c)濃度為約30％(重量/重量)的低溫保存培養(yǎng)基，和(d)濃度為20％(重量/重量)的人血清白蛋白溶液，其中組合物的ph為約ph?7.0至約ph?7.9。在一些方面，包含增強型apc的組合物包含：(a)約1.05×108個增強型apc，(b)濃度為約50％(重量/重量)的冷凍保存培養(yǎng)基，(c)濃度為約30％(重量/重量)的低溫保存培養(yǎng)基，和(d)濃度為20％(重量/重量)的人血清白蛋白溶液，其中組合物的ph為約ph?7.0至約ph?7.9。

25、對于本文提供的任何方法，在一些方面，包含增強型apc的組合物包含約1×106個增強型apc/ml至約1x108個增強型apc/ml。在一些方面，包含增強型apc的組合物包含約8.5×106個增強型apc/ml。在一些方面，包含增強型apc的組合物包含約1.1×107個增強型apc/ml。

26、在一些方面，冷凍保存培養(yǎng)基是cs10。在一些方面，低溫保存培養(yǎng)基是frs。

27、本文提供了一種用于治療有需要的受試者中的人乳頭瘤病毒(hpv)相關(guān)癌癥的方法，所述方法包括：向受試者施用：(i)包含修飾的抗原呈遞細胞(“增強型apc”)的組合物，其中增強型apc包含hpv?e6和/或hpv?e7抗原、cd86、膜結(jié)合白細胞介素-2(“mbil-2”)和膜結(jié)合白細胞介素-12(“mbil-12”)，其中增強型apc能夠以hla不可知的方式激活t細胞，和(ii)pd-1的拮抗劑。本文還提供了一種用于治療有需要的受試者中的hpv+復(fù)發(fā)性、局部晚期或轉(zhuǎn)移性腫瘤的方法，所述方法包括施用包含修飾的抗原呈遞細胞(“增強型apc”)的組合物，其中增強型apc包含hpv?e6和/或hpv?e7抗原、cd86、膜結(jié)合白細胞介素-2(“mbil-2”)和膜結(jié)合白細胞介素-12(“mbil-12”)，并且其中增強型apc能夠以hla不可知的方式激活t細胞。

28、在一些方面，包含增強型apc的組合物與pd-1的拮抗劑組合施用。在一些方面，pd-1的拮抗劑是結(jié)合pd-1的抗體。在一些方面，結(jié)合pd-1的抗體是帕博利珠單抗。

29、在一些方面，增強型apc已通過以下方式制備：使包含輸入apc的細胞懸浮液穿過細胞變形收縮部，從而在apc中引起擾動，使得編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和編碼細胞因子的核酸在與apc接觸時通過擾動進入apc，從而產(chǎn)生增強型apc。在一些方面，包含輸入apc的細胞懸浮液已與編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和編碼細胞因子的核酸組合培養(yǎng)，使得編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和編碼細胞因子的核酸與輸入apc接觸。

30、在一些方面，編碼抗原的核酸、編碼共刺激分子的核酸和編碼細胞因子的核酸是mrna。在一些方面，細胞變形收縮部的直徑為約4.2μm至約6μm或約4.2μm至約4.8μm。

31、在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中進行調(diào)節(jié)。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約2小時至約10小時。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約3小時至約6小時。在一些方面，增強型apc已在包含佐劑的培養(yǎng)基中調(diào)節(jié)約4小時。在一些方面，增強型apc已在約37℃的包含佐劑的培養(yǎng)基中進行調(diào)節(jié)。在一些方面，佐劑包括cpg寡脫氧核苷酸(odn)、lps、ifn-α、sting激動劑、rig-i激動劑、聚i:c、r837、r848、tlr3激動劑、tlr4激動劑或tlr?9激動劑。在一些方面，佐劑是odn。