本發明涉及動物遺傳工程領域,特別是涉及一種靶向敲除app基因的sgrna及其應用。
背景技術:
1、非洲豬瘟是由非洲豬瘟病毒引起的一種急性、熱性、高接觸性傳染病,已被證明對全球豬肉行業造成破壞性影響;通常表現為全身出血、神經癥狀和呼吸困難等臨床癥狀,且發病時間短,致死率高。非洲豬瘟病毒(african?swine?fever?virus,asfv)是非洲豬瘟病毒科(asfarviridae)和非洲豬瘟病毒屬(asfivirus)的唯一成員,是一種大型雙鏈dna蟲媒病毒。非洲豬瘟的主要傳染源是感染豬和帶毒豬,受感染的組織、血液、豬的分泌物和排泄物中都含有病毒,病毒可附著在飼料、運輸車等物體進行傳播,除直接接觸傳播外,asfv還能通過蜱蟲進行傳播。
2、目前認為asfv的入侵途徑主要有網格蛋白介導的內吞途徑(cme)和巨胞飲途徑。有報道指出cd163是asfv入侵的受體。但popescu等的研究表明該受體在某些情況下對于asfv感染不是必需的。因此參與病毒進入細胞的受體身份目前仍未知的,對抗病育種的開展造成極大的困擾。
3、病毒蛋白pe248r位于病毒內膜,其參與asfv進入早期進程。asfv通過cme或巨胞飲途徑進入到細胞,需要從內吞途徑形成的內體中脫膜并被釋放到胞質中。asfv脫膜涉及多囊泡晚期內體中病毒體外層(外膜和蛋白衣殼)的損失,以及內膜與內體的后期融合,從而將裸核釋放到細胞質中。其中pe248r與病毒的脫膜密切相關。rodríguez等使用pe248r缺陷病毒顆粒進行研究,其發現pe248r缺陷病毒的感染力至少降低了100倍,而pe248r蛋白的缺失既不影響病毒的結合,也不影響病毒的內化,但沒有引起細胞病變,并能使早期和晚期的基因表達受到損害,這表明該蛋白對于病毒的感染和早期進入是必需的。而近期的研究也指出該蛋白參與內膜與多囊泡內體膜的融合,是核釋放關鍵因素。
4、app基因常報道為阿爾茲海默癥治療的關鍵基因,但也有研究發現app基因常與巨噬細胞的內吞作用相關,且在豬肺泡巨噬細胞上高表達。因此,app基因的研究可以為非洲豬瘟病毒感染相關研究提供理論依據,而app基因敲除的研究將為進一步研究app受體在asfv感染過程中發揮的具體作用奠定基礎。目前app基因敲除的克隆豬尚未見報道。
技術實現思路
1、本發明的目的是提供一種靶向敲除app基因的sgrna及其應用,以解決上述現有技術存在的問題,利用sgrna構建的非洲豬瘟病毒受體app敲除豬,豬體內app基因不表達,以此獲得非洲豬瘟病毒抗性豬,這為抗非洲豬瘟育種研究奠定基礎。
2、為實現上述目的,本發明提供了如下方案:
3、本發明提供一種靶向敲除app基因的sgrna,所述sgrna的核苷酸序列如seq?idno.1-2所示或者seq?id?no.3-4所示。
4、本發明還提供用于編碼所述的sgrna的dna分子。
5、本發明還提供含有所述的sgrna的重組載體。
6、本發明還提供一種含有所述的重組載體的轉基因細胞。
7、本發明還提供一種敲除app基因的細胞系的構建方法,包括利用crispr/cas9系統敲除細胞系中的app基因步驟,所述crispr/cas9系統的sgrna的核苷酸序列如seq?idno.1-2所示或者seq?id?no.3-4所示。
8、可選的是,所述細胞系包括豬成纖維細胞和豬肺泡巨噬細胞。
9、本發明還提供一種敲除app基因的細胞系,其由所述的構建方法制得。
10、本發明還提供所述的sgrna在構建app基因敲除的細胞系中的應用。
11、本發明還提供所述的細胞系在以下任一項中的應用:
12、(1)在制備app基因功能研究模型中的應用;
13、(2)在抗非洲豬瘟轉基因豬的制備中的應用;
14、(3)在抗非洲豬瘟育種中的應用。
15、本發明還提供一種抗非洲豬瘟轉基因豬的制備方法,包括以下步驟:
16、利用所述的構建方法構建的細胞系,篩選陽性細胞克隆,再以陽性細胞克隆為核移植供體細胞,卵母細胞為核移植受體細胞獲取克隆胚胎;將所述克隆胚胎移入豬子宮內妊娠,獲得基因敲除后的抗非洲豬瘟轉基因豬。
17、本發明公開了以下技術效果:
18、本發明通過crispr/cas9技術敲除非洲豬瘟受體app基因,構建app敲除的豬成纖維細胞系,并經過篩選陽性克隆,作為核移植供體細胞,卵母細胞為核移植受體細胞;將克隆胚胎移入豬子宮內妊娠,獲得基因敲除后的抗非洲豬瘟克隆豬。經試驗,對app基因敲除細胞系和基因敲除豬進行鑒定,發現豬體內app基因不表達,該豬感染非洲豬瘟后不死亡。說明app敲除后對非洲豬瘟病毒具有抗性,這為抗非洲豬瘟育種研究奠定基礎。
1.一種靶向敲除app基因的sgrna,其特征在于,所述sgrna的核苷酸序列如seq?idno.1-2所示或者seq?id?no.3-4所示。
2.用于編碼權利要求1所述的sgrna的dna分子。
3.含有權利要求1所述的sgrna的重組載體。
4.一種含有權利要求3所述的重組載體的轉基因細胞。
5.一種敲除app基因的細胞系的構建方法,其特征在于,包括利用crispr/cas9系統敲除細胞系中的app基因的步驟,所述crispr/cas9系統的sgrna的核苷酸序列如seq?idno.1-2所示或者seq?id?no.3-4所示。
6.如權利要求5所述的構建方法,其特征在于,所述細胞系包括豬成纖維細胞和豬肺泡巨噬細胞。
7.一種敲除app基因的細胞系,其特征在于,其由權利要求5或6所述的構建方法制得。
8.如權利要求1所述的sgrna在構建app基因敲除的細胞系中的應用。
9.如權利要求7所述的細胞系在以下任一項中的應用:
10.一種抗非洲豬瘟轉基因豬的制備方法,其特征在于,包括以下步驟: