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一種作物基因型預(yù)測表型方法、控制裝置和設(shè)備

文檔序號:41745634發(fā)布日期:2025-04-25 17:30閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種作物基因型預(yù)測表型方法,其特征在于,所述方法包括:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因型數(shù)據(jù)包括單核苷酸多態(tài)性single?nucleotide?polymorphism,snp標記編碼的數(shù)值矩陣。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述特征關(guān)系捕獲層采用transformer架構(gòu),包括:

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的方法,其特征在于,所述位置編碼模塊通過正弦-余弦函數(shù)生成位置向量,并與所述低維全局特征進行疊加,以保留所述snp數(shù)據(jù)位點的空間位置信息。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)與所述自編碼器的連接方式包括:

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于,所述輸出層包括全連接網(wǎng)絡(luò),所述全連接網(wǎng)絡(luò)包括:

7.一種控制裝置,其特征在于,包括處理器和存儲器,所述處理器與所述存儲器耦合,所述存儲器用于存儲計算機程序或指令,所述處理器用于執(zhí)行所述存儲器中的所述計算機程序或指令,使得如權(quán)利要求1至6中任一項所述的方法被執(zhí)行。

8.一種設(shè)備,其特征在于,所述設(shè)備包括如權(quán)利要求7所述的控制裝置。


技術(shù)總結(jié)
本申請實施例提供了一種作物基因型預(yù)測表型方法、控制裝置和設(shè)備,該方法包括:S1:構(gòu)建輸入層,所述輸入層用于接收基因型數(shù)據(jù);S2:構(gòu)建數(shù)據(jù)特征提取層對所述基因型數(shù)據(jù)進行特征提取,所述數(shù)據(jù)特征提取層包括:卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和自編碼器,所述自編碼器用于生成低維全局特征;S3:將所述低維全局特征輸入特征關(guān)系捕獲層,所述特征關(guān)系捕獲層基于自注意力機制捕捉所述基因型數(shù)據(jù)的長距離依賴關(guān)系;S4:構(gòu)建輸出層,所述輸出層用于將所述特征關(guān)系捕獲層的輸出映射為表型預(yù)測值。該方法不僅能夠?qū)?shù)據(jù)特征進行深層次的理解與提取,還可以捕獲基因型與表型之間的復(fù)雜關(guān)系,進而提高了模型的表達能力以及預(yù)測準確性。

技術(shù)研發(fā)人員:張建華,李佳樂,賀子康,周國民,閆燊,虞國平,劉恩平,王奉斌
受保護的技術(shù)使用者:三亞中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院國家南繁研究院
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/4/24
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