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一種制備3’?巰基核苷類似物的單體的合成方法與流程

文檔序號:12151306閱讀:665來源:國知局
一種制備3’?巰基核苷類似物的單體的合成方法與流程

本公開涉及有機化學領域,具體地,涉及一種制備3'-巰基核苷類似物的單體的合成方法,更具體地,涉及一種核苷中間體、一種制備核苷中間體的方法、一種制備硫代核苷中間體的方法、一種制備硫代嘧啶核苷衍生物的方法、一種制備硫代核苷衍生物的方法、一種制備具有保護基團的硫代核苷的方法和一種制備硫代核苷的磷?;瘑误w的方法。



背景技術:

核酸(RNA、DNA)是由核苷酸以3’-5’磷酸二酯鍵連接而成的大分子化合物,是構成生命的最基本的物質,在生物的遺傳、變異、生長發育以及蛋白質合成等方面起重要作用,在疾病的發病過程中,核酸功能的改變是發病的重要因素,如惡性腫瘤、放射病、病毒的致病作用和遺傳性疾病等都與核酸有關,所以核酸類藥物對防治那些危害人類最大的幾類疾病都有著重大的意義。

硫代核酸是指核酸鏈中磷酸二酯鍵基團中的氧原子被硫原子取代后的核酸。硫代核酸能夠抵抗核酸酶,從而延長了核酸類藥物在體內的作用時間。硫代核酸的其中一種情況是指核酸鏈中磷酸二酯鍵基團中帶雙鍵的氧原子被硫原子取代的衍生物。這種取代方式的硫代核酸中,磷酸二酯鍵基團是具有手性的,因此在藥學應用上具有手性缺陷。

為了避免硫代核酸的手性缺陷,技術人員開發了核酸鏈中磷酸二酯鍵基團中帶單鍵的氧原子被硫原子取代的衍生物。例如CN201310053524.2就提供了5’-S-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脫氧肌苷的合成與制備方法,這是一種核酸鏈中磷酸二酯鍵基團的5’端中帶單鍵的氧原子被硫原子取代的衍生物。此外,核酸鏈中磷酸二酯鍵基團的3’端中帶單鍵的氧原子被硫原子取代的衍生物及其制備方法也已經具有若干公開內容。

但是,核酸鏈中磷酸二酯鍵基團的3’端中帶單鍵的氧原子被硫原子取代的衍生物的制備方法仍然存在步驟繁瑣、反應條件苛刻、試劑成本高等缺陷。



技術實現要素:

本公開的目的是提供一種核酸鏈中磷酸二酯鍵基團的3’端中帶單鍵的氧原子被硫原子取代的衍生物的制備方法,該制備方法精簡了反應步驟、具有溫和的反應條件且試劑成本較低。

為了實現上述目的,一方面,本公開提供一種核苷中間體,其中,所述核苷中間體具有如下式(5)所示的結構:

其中,R1選自三苯基甲基、4-甲氧基三苯基甲基、4,4'-二甲氧基三苯基甲基、4,4',4”-三甲氧基三苯基甲基、苯甲酰基、對甲氧苯甲?;?、乙?;?、異丁酰基、芐基、苯氧乙?;?、苯磺?;?、甲磺酰基、對甲苯磺酰基、三甲基硅基、叔丁基二甲基硅基、叔丁基二苯基硅基、叔丁氧羰基、甲苯基、(i-Pr2SiCl)2O-或N,N-二甲胺亞甲基;

R3選自氫、甲基、乙基、正丙基、異丙基、氟或氯;

R6選自氫、鹵素、甲氧基、乙氧基、甲氧乙基、正丙基氧基、異丙基氧基或疊氮基。

其中,所述R1優選為4,4'-二甲氧基三苯基甲基;R3優選為氫或甲基;R6優選為氫。

另一方面,本公開提供一種制備核苷中間體的方法,該核苷中間體為如上所定義的式(5)所示的化合物,該方法包括:在質子性溶劑的存在下,在環合反應條件下,將式(4)所示化合物與能夠用于環合反應的堿性試劑接觸,使式(4)所示化合物發生環合反應;

式(4)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義;

R4選自甲基磺?;?、三氟甲磺?;⒈交酋;?、對甲苯磺?;?、酯基或鹵素。

優選地,所述環合反應條件包括使式(4)所示化合物與質子性溶劑及能夠用于環合反應的堿性試劑回流。

另一方面,本公開還提供一種制備硫代核苷中間體的方法,該硫代核苷中間體如式(6)所示,該方法包括:在加成開環反應溶劑存在下,在加成開環反應條件下,將使上文中所定義的式(5)所示化合物與式(8)所示的化合物接觸;

式(6)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義;R2選自C2-C10的取代的或未取代的酰基、C7-C11的取代的或未取代的芳香基?;粌炦x地,R2為乙酰基、異丁?;虮郊柞;?。

式(8)中,R'為氧或硫;R”為C1-C9的取代的或未取代的烷基或C6-C10的取代的或未取代的芳香基;優選地,R”為甲基、異丙基或苯基;R”'為H、Na、K、Li、C1-C10的取代的或未取代的烷基或C6-C10的取代的或未取代的芳香基。

另一方面,本公開提供一種制備硫代嘧啶核苷衍生物的方法,該硫代嘧啶核苷衍生物如式(7)所示,該方法包括:根據上文所述的方法制備如式(6)所示的硫代核苷中間體;并且將式(6)所示的硫代核苷中間體在水解反應溶劑存在下,在水解反應條件下,與能夠用于水解反應的堿性試劑接觸;

式(7)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義。

另一方面,本公開提供一種制備硫代核酸的磷?;瘑误w的方法,該硫代核酸的磷?;瘑误w如式(1)所示,該方法包括:根據上文所述的方法制備如式(7)所示的硫代嘧啶核苷衍生物;并且在磷?;磻軇┖土柞;磻呋瘎┐嬖谙拢诹柞;磻獥l件下,將如式(7)所示的硫代嘧啶核苷衍生物與磷酰化反應試劑接觸;

式(1)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義。

通過上述技術方案,本公開給予式(5)所示的結構的中間體,提供了合成3'-巰基-2'-脫氧核糖核苷類似物的單體的合成方法,具體地,通過式(5)所示的結構的中間體開環,得到了具有胸腺嘧啶核苷酸母核結構的核苷酸單體和具有尿嘧啶核苷酸母核結構的核苷酸單體。由此,本公開提供了一種與現有方法構思不同的制備硫代核酸的方法。并且,本公開的方法具有步驟精簡、反應條件溫和、試劑成本低等優勢。

本公開的其他特征和優點將在隨后的具體實施方式部分予以詳細說明。

附圖說明

附圖是用來提供對本公開的進一步理解,并且構成說明書的一部分,與下面的具體實施方式一起用于解釋本公開,但并不構成對本公開的限制。在附圖中:

圖1是5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷亞磷酰亞胺核苷單體的制備合成路線圖。

圖2是5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷亞磷酰亞胺核苷單體的制備合成路線圖。

具體實施方式

以下結合附圖對本公開的具體實施方式進行詳細說明。應當理解的是,此處所描述的具體實施方式僅用于說明和解釋本公開,并不用于限制本公開。

一方面,本公開提供一種核苷中間體,其中,所述核苷中間體具有如下式(5)所示的結構:

其中,R1選自三苯基甲基、4-甲氧基三苯基甲基、4,4'-二甲氧基三苯基甲基、4,4',4”-三甲氧基三苯基甲基、苯甲?;?、對甲氧苯甲酰基、乙酰基、異丁?;⑵S基、苯氧乙?;?、苯磺酰基、甲磺?;妆交酋;?、三甲基硅基、叔丁基二甲基硅基、叔丁基二苯基硅基、叔丁氧羰基、甲苯基、(i-Pr2SiCl)2O-或N,N-二甲胺亞甲基;

R3選自氫、甲基、乙基、正丙基、異丙基、氟或氯;

R6選自氫、鹵素、甲氧基、乙氧基、甲氧乙基、正丙基氧基、異丙基氧基或疊氮基。

其中,所述R1優選為4,4'-二甲氧基三苯基甲基;R3優選為氫或甲基;R6優選為氫。

其中,式(5)所示的化合物可以作為硫代核苷合成路線中的中間體。

另一方面,本公開提供一種制備核苷中間體的方法,該核苷中間體如上所定義,該方法包括:在質子性溶劑的存在下,在環合反應條件下,將式(4)所示化合物與能夠用于環合反應的堿性試劑接觸,使式(4)所示化合物發生環合反應;

式(4)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義;

R4選自甲基磺?;?、三氟甲磺酰基、苯磺酰基、對甲苯磺?;?、酯基或鹵素。

優選地,所述環合反應條件包括使式(4)所示化合物與質子性溶劑及能夠用于環合反應的堿性試劑回流。

可選地,所述環合反應條件包括:溫度為50-120℃,時間為0.5-100小時,相對于1g的式(4)所示化合物,所述質子性溶劑的用量為2-150mL,所述能夠用于環合反應的堿性試劑的用量為0.2-15mL。

可選地,所述質子性溶劑選自水、甲醇、乙醇和異丙醇中的至少一種;所述能夠用于環合反應的堿性試劑選自三乙胺、二乙胺、二異丙基乙胺、甲胺、乙胺、異丙胺和叔丁胺中的至少一種。

可選地,式(4)所示化合物的制備方法包括在3’位取代反應溶劑和縛酸劑存在下,以及在3’位取代反應條件下,將式(3)所示的化合物與3’位取代反應試劑接觸;

式(3)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義。

可選地,所述3’位取代反應試劑選自甲基磺酰氯、苯磺酰氯、對甲苯磺酰氯、三氟甲磺酰氯、N-溴代琥珀酰亞胺、碘甲烷和苯甲酸甲酯中的至少一種。

可選地,所述3’位取代反應條件包括:溫度為-20℃至60℃,時間為0.5-100小時,相對于1克的式(3)所示化合物,所述3’位取代反應溶劑的用量為1-100mL,式(3)所示化合物與所述縛酸劑的摩爾比為1:(1-2),式(3)所示化合物與所述3’位取代反應試劑之間的摩爾比為1:(1-4),優選為1:(1-2)。

可選地,所述3’位取代反應溶劑選自吡啶、1,4-二氫吡啶、二氯甲烷、1,2-二氯乙烷、乙腈和乙酸乙酯中的至少一種,所述縛酸劑為吡啶和/或三乙胺。

可選地,式(3)所示化合物的制備方法包括在5’位取代反應溶劑存在下,在5’位取代反應條件下,將式(2)所示的化合物與5’位取代反應試劑接觸。

可選地,5’位取代反應試劑選自4,4'-二甲氧基三苯基甲烷、4-甲氧基三苯基氯甲烷、三苯基氯甲烷、4,4',4”-三甲氧基三苯基氯甲烷、苯甲酰氯、對甲氧苯甲酰氯、乙酰氯、異丁酰氯、苯氧乙酰氯、苯磺酰氯、甲磺酰氯、對甲苯磺酰氯、三甲基氯硅烷、叔丁基二甲基氯硅烷、叔丁基二苯基氯硅烷和溴硅烷中的至少一種。

可選地,所述5’位取代反應條件包括:溫度為-20℃至60℃,時間為0.5-100小時,相對于1g的式(2)所示化合物,所述5’位取代反應溶劑的用量為1-100mL,式(2)所示化合物與所述5’位取代反應試劑之間的摩爾比為1:(1-4),優選為1:(1-2)。

可選地,所述5’位取代反應溶劑選自吡啶、1,4-二氫吡啶、N,N-二甲基甲酰胺和二甲基亞砜中的至少一種。

另一方面,本公開還提供一種制備硫代核苷中間體的方法,該硫代核苷中間體如式(6)所示,該方法包括:在加成開環反應溶劑存在下,在加成開環反應條件下,將使上文中所定義的式(5)所示化合物與式(8)所示的化合物接觸;

式(6)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義;R2選自C2-C10的取代的或未取代的?;7-C11的取代的或未取代的芳香基?;?;優選地,R2為乙?;惗□;虮郊柞;?。

式(8)中,R'為氧或硫;R”為C1-C9的取代的或未取代的烷基或C6-C10的取代的或未取代的芳香基;優選地,R”為甲基、異丙基或苯基;R”'為H、Na、K、Li、C1-C10的取代的或未取代的烷基或C6-C10的取代的或未取代的芳香基。

可選地,所述加成開環反應條件包括:溫度為70-120℃,時間為0.2-100小時,相對于1g的式(5)所示化合物,所述加成開環反應溶劑的用量為1-100mL,式(5)所示化合物與式(8)所示的化合物之間的摩爾比為1:(0.5-10),優選為1:(1-2)。

可選地,所述加成開環反應溶劑選自N,N-二甲基甲酰胺和/或二甲基亞砜;式(8)所示的所述化合物選自硫代苯甲酸鈉、硫代苯甲酸、硫代乙酸鈉、硫代乙酸鉀和硫代異丁酸中的至少一種。

另一方面,本公開提供一種制備硫代嘧啶核苷衍生物的方法,該硫代嘧啶核苷衍生物如式(7)所示,該方法包括:根據上文所述的方法制備如式(6)所示的硫代核苷中間體;并且將式(6)所示的硫代核苷中間體在水解反應溶劑存在下,在水解反應條件下,與能夠用于水解反應的堿性試劑接觸;

式(7)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義。

可選地,所述水解反應條件包括:溫度為-20℃至70℃,時間為0.5-100小時,相對于1g的式(6)所示化合物,所述水解反應溶劑的用量為0.5-100mL,式(6)所示化合物與所述能夠用于水解反應的堿性試劑之間的摩爾比為1:(0.01-10),優選為1:(1-2)。

其中,所述水解反應的溶劑選自C1-C6的醇和水中的至少一種;所述能夠用于水解反應的堿性試劑包括有機堿和/或無機堿;優選所述有機堿為C1-C6的胺;更優選所述有機堿為甲胺、乙胺、叔丁胺和異丙胺中的至少一種;優選所述無機堿為氫氧化鈉、氫氧化鉀和氫鈉中的至少一種。

另一方面,本公開提供一種制備硫代核酸的磷酰化單體的方法,該硫代核酸的磷?;瘑误w如式(1)所示,該方法包括:根據上文所述的方法制備如式(7)所示的硫代嘧啶核苷衍生物;并且在磷酰化反應溶劑和磷?;磻呋瘎┐嬖谙?,在磷酰化反應條件下,將如式(7)所示的硫代嘧啶核苷衍生物與磷?;磻噭┙佑|;

式(1)中,R1、R3和R6具有和上文中相同的定義。

可選地,所述磷酰化反應條件包括:溫度為0-60℃,時間為0.1-100小時,相對于1g的式(7)所示化合物,所述磷?;磻軇┯昧繛?-100mL,式(7)所示化合物與所述磷?;磻噭┖退隽柞;磻呋瘎┲g的摩爾比為1:(1-4):(0.01-5),優選地,1:(1-2):(0.1-2)。

可選地,所述磷?;磻軇┻x自二氯甲烷、乙腈和N,N-二甲基甲酰胺中的至少一種;所述磷?;磻噭?-氰乙基-N,N,N',N'-四異丙基亞磷酰二胺;所述磷?;磻呋瘎檫溥?、4,5-二氰基咪唑、N-甲基咪唑、三氮唑和四氮唑中的至少一種。

根據本公開特別優選的一種實施方式,本公開提供一種制備硫代核酸的磷酰化單體的方法,該硫代核酸的磷酰化單體如式(1)所示,該方法包括如下步驟:

S1、在5’位取代反應溶劑存在下,在5’位取代反應條件下,將式(2)所示的化合物與5’位取代反應試劑接觸;以制備式(3)所示化合物;

S2、在3’位取代反應溶劑和縛酸劑存在下,以及在3’位取代反應條件下,將式(3)所示的化合物與3’位取代反應試劑接觸;以制備式(4)所示化合物;

S3、在質子性溶劑的存在下,在環合反應條件下,將式(4)所示化合物與能夠用于環合反應的堿性試劑接觸,使式(4)所示化合物發生環合反應;以制備式(5)所示化合物;

S4、在加成開環反應溶劑存在下,在加成開環反應條件下,將式(5)所示化合物與式(8)所示的化合物接觸;以制備式(6)所示化合物;

S5、將式(6)所示的硫代核苷中間體在水解反應溶劑存在下,在水解反應條件下,與能夠用于水解反應的堿性試劑接觸;以制備式(7)所示化合物;

S6、在磷酰化反應溶劑和磷?;磻呋瘎┐嬖谙?,在磷?;磻獥l件下,將如式(7)所示的硫代嘧啶核苷衍生物與磷?;磻噭┙佑|;以制備式(1)所示化合物。

以下,通過實施例進一步詳細說明本公開。

實施例1:反應合成路線圖如圖1所示:5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷亞磷酰亞胺核苷單體的制備:

(1)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧胸苷的合成

稱取100gβ-胸腺嘧啶核苷(胸苷FW=242.23,0.41mol)于5L的三口反應瓶中,加入1.5L吡啶,電動攪拌至溶解。冰水浴使體系溫度降為10℃左右,加入4,4'-二甲氧基三苯基氯甲烷(DMT-Cl,FW=338.84,0.615mol)208.4g,保持溫度為10℃左右,反應5小時。TLC檢測,原料反應完全。再向其中加入1L的5%碳酸氫鈉水溶液,攪拌30分鐘,減壓旋蒸出吡啶溶劑至體系為粘稠狀物質,向殘余物中加入乙酸乙酯500ml,攪拌均勻,分液,收集有機相,有機相依次用200ml水、200ml 10%的氯化鈉水溶液洗滌,所得有機相用無水硫酸鈉干燥,蒸干,得到粗產品5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧胸苷。柱層析(400g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,得白色泡沫狀固體195.0g(FW=544.61,0.36mol),收率(收率為目標產物與(主)原料的物質的量之比,以下相同):0.36mol/0.41mol=87.8%。

該白色泡沫狀固體的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.94(d,J=1.3Hz,1H),7.50–7.41(m,2H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.31(t,J=7.0Hz,1H),4.28(q,J=7.0Hz,1H),3.84(td,J=6.9,5.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.73(d,J=5.0Hz,1H),3.61(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),2.57(dt,J=13.2,7.0Hz,1H),2.03(dt,J=13.3,7.0Hz,1H),1.76(d,J=1.1Hz,3H).;上述核磁特征峰表明該白色泡沫狀固體為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧胸苷。

(2)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2’-脫氧胸苷的合成

稱取100g 5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧胸苷于2L的三口反應瓶中,加入吡啶1L。將三口瓶放入低溫冷卻阱中,給反應體系降溫。電動攪拌,當體系溫度為-5℃時,用滴液漏斗向三口瓶中滴加入26g甲基磺酰氯(MS-Cl,FW=114.55),滴加過程中體系溫度保持在-5℃~-2.5℃之間。滴加完成后,撤掉冷阱,室溫攪拌2小時。TLC檢測,原料反應完全,向三口瓶中加入約2L 5%的碳酸氫鈉水溶液,攪拌30分鐘,減壓蒸出約1.5L溶劑。低溫攪拌約30分鐘,析出類白色固體粉末,抽濾,干燥后得到粗產品125g,純度90.62﹪。柱層析(250g 250-300目硅膠,二氯甲烷洗脫)純化,收集純品,蒸干后得泡沫狀物質110.0g(純度99.34%),收率為95.33%。

該泡沫狀物質的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.94(d,J=1.3Hz,1H),7.50–7.42(m,2H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.26(t,J=7.0Hz,1H),5.36(q,J=7.0Hz,1H),4.52(q,J=7.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.16(s,3H),2.65(dt,J=13.8,7.0Hz,1H),2.06(dt,J=13.2,7.0Hz,1H),1.76(d,J=1.1Hz,3H).;上述核磁特征峰表明該泡沫狀物質為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2’-脫氧胸苷。

(3)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2,3’-酐-2’-脫氧胸苷的合成

稱取108g 5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2’-脫氧胸苷于2L的單口反應瓶中,加入三乙胺100ml、乙醇1000ml。磁力攪拌、安裝回流裝置,加熱回流。回流過程中體系逐漸變為透亮溶液。保持回流1小時。TLC檢測,原料基本反應完全。停止加熱,放冷。將反應液加入到1L的5%的碳酸氫鈉水溶液中,析出大量的白色固體。抽濾,得濾餅,濾餅干燥得白色粉末狀固體。稱重87.5g(純度近100%),收率為95.80%。

該白色粉末狀固體的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.50–7.42(m,2H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.25–6.11(m,2H),4.24(dq,J=27.7,6.9Hz,2H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.4,6.9Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,6.9Hz,1H),2.36(dt,J=13.6,7.0Hz,1H),2.16(d,J=1.1Hz,3H),1.91(dt,J=13.5,7.0Hz,1H).;上述核磁特征峰表明該白色粉末狀固體為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2’-脫氧胸苷。

(4)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-硫代苯甲?;?2’-脫氧胸苷的合成

稱取80g的5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2,3’-酐-2’-脫氧胸苷于2L的三口瓶中,加入1000ml的N,N-二甲基甲酰胺(DMF)溶解,向其中加入硫代苯甲酸鈉25g,體系為酒紅色的透亮溶液。電動攪拌,加熱,保持內溫為105℃2小時。TLC檢測,當原料反應完畢后停止加熱。減壓蒸出溶劑DMF。柱層析(400g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,收集主產品段,得粉色的泡沫狀物質58.0g(純度98.31%),收率:57.43%。

該粉色的泡沫狀物質的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.94(ddt,J=6.0,4.1,2.0Hz,3H),7.72(ddt,J=9.4,6.9,2.0Hz,1H),7.58(t,J=7.4Hz,2H),7.50–7.42(m,2H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.51(t,J=7.0Hz,1H),4.33(q,J=7.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.19(q,J=7.0Hz,1H),2.80(dt,J=13.7,6.9Hz,1H),2.52(dt,J=13.2,7.0Hz,1H),1.76(d,J=1.0Hz,3H).;上述核磁特征峰表明該白色粉末狀固體為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-硫代苯甲酰基-2’-脫氧胸苷。

(5)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷的合成

稱取55g的5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-硫代苯甲酰基-2’-脫氧胸苷于1L的單口反應瓶中,加入甲醇300ml,叔丁胺12g,室溫磁力攪拌2小時,攪拌過程中體系逐漸溶解至酒紅色透明溶液。TLC檢測,原料反應完畢,減壓旋蒸出溶劑,得粘稠的紫紅色醬狀物質,加入5%碳酸氫鈉水溶液250ml,乙酸乙酯250ml攪拌溶解,靜置分層,收集有機相,水相再加入150ml乙酸乙酯,攪拌20min,靜置分層,收集橙黃色有機相,混合兩次收集的有機相,水洗滌3次,每次100ml,所得有機相用無水硫酸鈉干燥。旋蒸至干,柱層析(200g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,得粉色的泡沫狀產品38.0g,純度98.7%,收率為81.92%。

該粉色的泡沫狀產品的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.94(d,J=1.3Hz,1H),7.50–7.41(m,2H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.25(t,J=6.9Hz,1H),4.27(q,J=7.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.66–3.52(m,2H),3.36(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.21(s,1H),2.53(dt,J=13.7,6.9Hz,1H),2.19(dt,J=13.5,7.0Hz,1H),1.76(d,J=1.0Hz,3H).;13C NMR(100MHz,DMSO-d6)δ164.42,158.66,151.01,142.93,137.22,135.46,135.36,128.30,128.19,127.60,113.38,110.87,88.33,86.86,85.44,65.18,55.35,40.91,39.44,12.62.;上述核磁特征峰表明該粉色的泡沫狀產品為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷。

(6)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷亞磷酰亞胺核苷單體的合成

稱取25g的5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷于250ml的單口瓶中,加入乙腈100ml溶解,再向其中加入磷?;噭?2-氰乙基N,N,N’,N’-四異丙基亞磷酰二胺)16.2g,四氮唑2.1g??刂扑囟葹?5℃左右。保持攪拌40分鐘。HPLC檢測,起始物料反應完畢。減壓旋蒸出溶劑。殘余物柱層析(100g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,收集產品段,蒸干后得粉色泡沫狀物質25.8g,收率為76.04%,純度為93.8%。

該粉色泡沫狀物質的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.46(dd,J=6.7,2.9Hz,2H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.27(t,J=7.0Hz,1H),4.47–4.29(m,2H),4.22–4.08(m,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),2.98–2.65(m,6H),2.21(dt,J=13.4,6.9Hz,1H),1.76(d,J=1.0Hz,3H),1.17–1.04(m,12H).;該粉色泡沫狀物質的M+H的m/z值為761.73,由此表明包括:該粉色泡沫狀物質為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧胸苷亞磷酰亞胺核苷單體。

實施例2:5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷亞磷酰亞胺核苷單體的制備

(1)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧尿苷的合成

稱取100g 2’-脫氧尿苷于5L的三口反應瓶中,加入1.5L吡啶。電動攪拌至溶解。冰水浴使體系溫度降為10℃左右,加入4,4'-二甲氧基三苯基氯甲烷(DMT-Cl)163.3g,保持溫度為10℃左右,反應5小時。TLC檢測,原料反應完全。再向其中加入1L的5%碳酸氫鈉水溶液,攪拌30分鐘,減壓旋蒸出吡啶溶劑至體系為粘稠狀物質,向殘余物中加入乙酸乙酯500ml,攪拌均勻,分液,收集有機相,有機相依次用200ml水、200ml 10%的氯化鈉水溶液洗滌,所得有機相用無水硫酸鈉干燥,蒸干,得到粗產品5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧尿苷。柱層析(400g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,得白色泡沫狀固體207.1g。純度:98.87%,收率為89.08%。

該白色泡沫狀固體的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.50–7.37(m,3H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.27(t,J=7.0Hz,1H),5.47(d,J=10.8Hz,1H),4.39(q,J=7.0Hz,1H),4.04(qd,J=7.0,5.0Hz,1H),3.81(d,J=5.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),2.59(dt,J=13.7,7.0Hz,1H),1.99(dt,J=13.5,7.0Hz,1H).;上述核磁特征峰表明該白色泡沫狀固體為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧尿苷。

(2)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2'-脫氧尿苷的合成

稱取100g 5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2’-脫氧尿苷于2L的三口反應瓶中,加入吡啶1L。將三口瓶放入低溫冷卻阱中,給反應體系降溫。電動攪拌,當體系溫度為-5℃時,用滴液漏斗向三口瓶中滴加入28g甲基磺酰氯,滴加過程中體系溫度保持在-5℃~-2.5℃之間。滴加完成后,撤掉冷阱,室溫攪拌2小時。TLC檢測,原料反應完全,向三口瓶中加入約2L 5%的碳酸氫鈉水溶液,攪拌30分鐘,減壓蒸出約1.5L溶劑。低溫攪拌約30分鐘,析出類白色固體粉末,抽濾,干燥后得到粗產品。柱層析(250g 250-300目硅膠,二氯甲烷洗脫)純化,收集純品,蒸干后得泡沫狀物質108g(純度:99.34%)收率:94.14%。

該泡沫狀物質的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.50–7.37(m,3H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.24(t,J=7.0Hz,1H),5.47(d,J=10.8Hz,1H),5.27(q,J=7.0Hz,1H),4.50(q,J=7.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.16(s,3H),2.66(dt,J=13.6,7.0Hz,1H),2.06(dt,J=13.2,7.0Hz,1H).;上述核磁特征峰表明該泡沫狀物質為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2’-脫氧尿苷。

(3)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2,3’-酐-2’-脫氧尿苷的合成

稱取100g 5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2'-脫氧尿苷于2L的單口反應瓶中,加入三乙胺100ml、乙醇1000ml。磁力攪拌、安裝回流裝置,加熱回流?;亓鬟^程中體系逐漸變為透亮溶液。保持回流1小時。TLC檢測,原料基本反應完全。停止加熱,放冷。將反應液加入到1L的5%的碳酸氫鈉水溶液中,析出大量的白色固體。抽濾,得濾餅,濾餅干燥得白色粉末狀固體。稱重82.5g,純度:99.75%,收率:98.01%。

該白色粉末狀固體的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.51–7.41(m,2H),7.36–7.25(m,7H),6.93–6.81(m,5H),6.49(d,J=10.8Hz,1H),6.16(t,J=7.0Hz,1H),4.23(s,1H),4.28–4.17(m,1H),3.79(s,6H),3.67–3.56(m,1H),3.42–3.31(m,1H),2.44–2.32(m,1H),1.97–1.85(m,1H).;上述核磁特征峰表明該白色粉末狀固體為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-氧甲磺?;?2’-脫氧尿苷。

(4)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-硫代苯甲酰基-2’-脫氧尿苷的合成

稱取80g的5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-2,3’-酐2’-脫氧尿苷于2L的三口瓶中,加入1000ml的DMF溶解,向其中加入硫代苯甲酸鈉25g,體系為酒紅色的透亮溶液。電動攪拌,加熱。保持內溫為105℃2小時。TLC檢測,當原料反應完畢后停止加熱。減壓蒸出溶劑DMF。柱層析(400g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,收集主產品段,得粉色的泡沫狀物質62.10g,純度:99.11%,收率:61.14%。

該粉色的泡沫狀物質的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.98–7.90(m,2H),7.77–7.67(m,1H),7.58(t,J=7.4Hz,2H),7.50–7.37(m,3H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.32(t,J=7.0Hz,1H),5.47(d,J=10.8Hz,1H),4.15(q,J=6.9Hz,1H),3.97(q,J=7.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.06(dt,J=13.6,6.9Hz,1H),2.63(dt,J=13.2,7.0Hz,1H).;上述核磁特征峰表明該白色粉末狀固體為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-硫代苯甲?;?2’-脫氧尿苷。

(5)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷的合成

稱取60g的5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-硫代苯甲酰基-2’-脫氧尿苷于1L的單口反應瓶中,加入甲醇300ml,叔丁胺12.5g,室溫磁力攪拌2小時,攪拌過程中體系逐漸溶解至酒紅色透明溶液。TLC檢測,原料反應完畢,減壓旋蒸出溶劑,得粘稠的紫紅色醬狀物質,加入5%碳酸氫鈉水溶液250ml,乙酸乙酯250ml攪拌溶解,靜置分層,收集有機相,水相再加入150ml乙酸乙酯,攪拌20min,靜置分層,收集橙黃色有機相,混合兩次收集的有機相,水洗滌3次,每次100ml,所得有機相用無水硫酸鈉干燥。旋蒸至干,柱層析(200g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,得粉色的泡沫狀產品43.2g,純度98.90%,收率:85.71%。

該粉色的泡沫狀產品的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.50–7.37(m,3H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.38(t,J=7.0Hz,1H),5.47(d,J=10.8Hz,1H),4.34(q,J=7.0Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),3.27(s,1H),2.66(q,J=6.9Hz,1H),2.50(dt,J=13.8,7.0Hz,1H),2.23(dt,J=13.5,7.0Hz,1H).;13C NMR(100MHz,DMSO-d6)δ163.47,158.66,151.67,142.93,139.97,135.46,135.36,128.30,128.19,127.60,113.38,102.17,88.53,86.86,85.44,65.18,55.35,40.91,39.44.;上述核磁特征峰表明該粉色的泡沫狀產品為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷。

(6)5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷亞磷酰亞胺核苷單體的合成

稱取40g的5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷于500ml單口瓶中,加入乙腈200ml溶解,再向其中加入磷?;噭?2-氰乙基N,N,N’,N’-四異丙基亞磷酰二胺)26.5g、四氮唑3.0g??刂扑囟葹?5℃左右。保持攪拌40分鐘。HPLC檢測,起始物料反應完畢。減壓旋蒸出溶劑。殘余物柱層析(160g 250-300目硅膠,正己烷-乙酸乙酯梯度洗脫)純化,收集產品段,蒸干后得粉色泡沫狀物質41.7g,收率為76.30%,純度為97.1%。

該粉色泡沫狀物質的核磁特征峰包括:1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.50–7.37(m,3H),7.36–7.25(m,7H),6.89–6.81(m,4H),6.32(t,J=7.0Hz,1H),5.47(d,J=10.8Hz,1H),4.37(q,J=7.0Hz,1H),4.13(dddd,J=11.1,8.1,3.1,1.6Hz,1H),3.96(dddd,J=12.3,9.7,8.0,1.7Hz,1H),3.79(s,6H),3.61(dd,J=12.5,7.0Hz,1H),3.36(dd,J=12.4,7.0Hz,1H),2.91–2.74(m,3H),2.69–2.52(m,2H),2.56–2.43(m,2H),2.16(dt,J=13.2,7.0Hz,1H),1.07–0.95(m,12H).該粉色泡沫狀物質的M+H的m/z值為747.75,由此表明包括:該粉色泡沫狀物質為5'-氧-(4,4'-二甲氧基三苯基甲基)-3'-巰基-2’-脫氧尿苷亞磷酰亞胺核苷單體。

以上結合附圖詳細描述了本公開的優選實施方式,但是,本公開并不限于上述實施方式中的具體細節,在本公開的技術構思范圍內,可以對本公開的技術方案進行多種簡單變型,這些簡單變型均屬于本公開的保護范圍。

另外需要說明的是,在上述具體實施方式中所描述的各個具體技術特征,在不矛盾的情況下,可以通過任何合適的方式進行組合,為了避免不必要的重復,本公開對各種可能的組合方式不再另行說明。

此外,本公開的各種不同的實施方式之間也可以進行任意組合,只要其不違背本公開的思想,其同樣應當視為本公開所公開的內容。

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