本發(fā)明涉及核酸檢測領(lǐng)域,尤其涉及一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒。
背景技術(shù):
:人類獲得性免疫缺陷綜合癥(AIDS,英文全稱:acquiredimmunodeficiencysyndrome),又稱艾滋病,其病原是人類免疫缺陷病毒(HIV,英文全稱:humanimmunodeficiencyvirus),屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科(Retroviridae)的慢病毒亞科(Lentivirinae)。根據(jù)其基因型差異分為HIV-1和HIV-2兩個大型,各大型包括多種亞型。目前世界上大部分地區(qū)流行的是HIV-1,而HIV-2只在西非、西歐區(qū)域性流行。HIV基因組由兩條單鏈正鏈RNA組成,包含gag、pol、env三個結(jié)構(gòu)基因,以及tat、rev、nef、vif、vpu、vpr、vpx等調(diào)控基因,并在基因組的5′端和3′端各含長末端重復(fù)序列(LTR,英文全稱:longterminalrepeat)。HIV的LTR區(qū)含順式調(diào)控序列,包含啟動子和增強子并含負調(diào)控區(qū),控制病毒基因的表達。各基因的功能如下:(1)gag基因能編碼約500個氨基酸組成的聚合前體蛋白(P55),經(jīng)蛋白酶水解形成P17,P24核蛋白,使RNA不受外界核酸酶破壞。(2)pol基因編碼聚合酶前體蛋白(P34),經(jīng)切割形成蛋白酶、整合酶、逆轉(zhuǎn)錄酶、核糖核酸酶H,均為病毒增殖所必需。(3)env基因編碼約863個氨基酸的前體蛋白并糖基化成gp160,gp120和gp41。gp120含有中和抗原決定簇,已證明HIV中和抗原表位,在gp120V3環(huán)上,V3環(huán)區(qū)是包膜蛋白的重要功能區(qū),在病毒與細胞融合中起重要作用。gp120與跨膜蛋白gp41以非共價鍵相連。gp41與靶細胞融合,促使病毒進入細胞內(nèi)。實驗表明gp41亦有較強抗原性,能誘導(dǎo)產(chǎn)生抗體反應(yīng)。(4)tat基因編碼蛋白(P14)可與LTR結(jié)合,以增加病毒所有基因轉(zhuǎn)錄率,也能在轉(zhuǎn)錄后促進病毒mRNA的翻譯。(5)rev基因產(chǎn)物是一種順式激活因子,能對env和gag中順式作用抑制序列(Crs,英文全稱:Cis-Actingrepressionsequance)去抑制作用,增強gag和env基因的表達,以合成相應(yīng)的病毒結(jié)構(gòu)蛋白。(6)nef基因編碼蛋白P27對HIV基因的表達有負調(diào)控作用,以推遲病毒復(fù)制。該蛋白作用于HIVcDNA的LTR,抑制整合的病毒轉(zhuǎn)錄。可能是HIV在體內(nèi)維持持續(xù)感染所必需。(7)vif基因?qū)IV并非必不可少,但可能影響游離HIV感染性、病毒體的產(chǎn)生和體內(nèi)傳播。(8)vpu基因為HIV-1所特有,對HIV的有效復(fù)制及病毒體的裝配與成熟不可少。(9)vpr基因編碼蛋白是一種弱的轉(zhuǎn)錄激活物,在體內(nèi)繁殖周期中起一定作用。HIV-2基因結(jié)構(gòu)與HIV-1存在有差別,兩者之間同源性僅為40~60%,HIV-2不含vpu基因,但有一功能不明vpx基因。HIV因為其反轉(zhuǎn)錄酶無校正功能,錯配性高,導(dǎo)致基因變異性很強,尤以env基因變異率最高。根據(jù)env基因區(qū)的突變,HIV-2又可分為7個亞型。熒光定量PCR(聚合酶鏈式反應(yīng),英文全稱:PolymeraseChainReaction)是在普通PCR的基礎(chǔ)上在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,在把序列擴增過程中,隨著PCR反應(yīng)產(chǎn)物不斷累積,熒光信號強度也等比例增加,熒光信號不斷增強,并逐漸累積形成一條擴增曲線,通過熒光積累曲線實時監(jiān)測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定性及定量分析的方法。目前real-timeQ-PCR所使用的熒光化學(xué)方法主要有五種,分別是:DNA結(jié)合染色,水解探針,分子信標,熒光標記引物,雜交探針。它們又可分為擴增序列特異和非特異的檢測兩大類。(1)擴增序列非特異性檢測。此方法基于與DNA結(jié)合的熒光分子,如SYBRgreen1等熒光染料。通過在PCR反應(yīng)體系中加入過量SYBRgreen1熒光染料,此染料能滲入DNA雙鏈,并發(fā)出熒光信號,但不能與單鏈DNA或RNA結(jié)合。在模板擴增過程中,隨著雙鏈DNA數(shù)量的積累,熒光信號強度也等比增強。熒光染料的優(yōu)勢在于它能監(jiān)測任何dsDNA序列的擴增,不需要探針的設(shè)計,使檢測方法變得簡便,同時也降低了檢測的成本。然而正是由于熒光染料能和任何dsDNA結(jié)合,因此它也能與非特異的dsDNA(如引物二聚體)結(jié)合,使實驗容易產(chǎn)生假陽性信號。引物二聚體的問題目前可以用帶有熔解曲線分析的軟件加以解決。(2)擴增序列特異性檢測。上世紀90年代,TaqDNA多聚酶的5’核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn)和雙熒光標記探針的運用使得在一密閉PCR反應(yīng)管中間接地檢測PCR產(chǎn)物成為可能,此后,相應(yīng)的儀器和試劑的商品化發(fā)展導(dǎo)致real-timeQ-PCR方法在研究工作中正式投入使用。擴增序列特異性檢測又分為直接法和間接法。直接的方法指的是標記熒光的探針與擴增產(chǎn)物結(jié)合后即直接產(chǎn)生熒光,如分子信標、熒光標記引物及分子探針探針。分子信標探針是一種標記熒光的發(fā)夾探針,當探針分子呈發(fā)夾結(jié)構(gòu)時,結(jié)合在其兩端的熒光基團距離上接近,使得產(chǎn)生能量轉(zhuǎn)移效應(yīng),而不發(fā)生熒光。當有與環(huán)序列互補的模板存序列存在時,環(huán)序列將與模板配對,分子信標將成鏈狀,熒光基團與淬滅劑分開,發(fā)出熒光信號。熒光標記引物是從分子信標的概念變化而產(chǎn)生的一種聯(lián)合分子探針系統(tǒng),它把熒光基團標記的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的序列直接與PCR引物相結(jié)合,從而使熒光標記基團直接摻入PCR擴增產(chǎn)物中。目前主要有兩種:日出引物和蝎子引物。雜交探針使用兩個特異的探針,其中上游的探針的3′端標記有供體熒光素,而下游的探針的5′端標記有受體熒光素。在PCR中模板退火階段,兩探針同時與擴增產(chǎn)物雜交,并形成頭尾結(jié)合的形式,使供體和受體熒光素距離非常接近,兩者產(chǎn)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET,此作用與上述水解探針的方式相反),使得受體熒光基團發(fā)出熒光;當兩探針處于游離狀態(tài)時,無熒光產(chǎn)生。由于反應(yīng)中運用了兩個探針,因此增加了方法的特異性,另外也可利用熒光寡核苷酸熔解曲線對與寡核苷酸探針結(jié)合的序列進行分析,從中獲取有用的信息。間接的方法就是利用水解探針的策略。目前在real-timeQ-PCR中最廣泛使用的TaqMan系統(tǒng)就是運用了這個原理。PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團,此時5′端熒光基團吸收能量后將能量轉(zhuǎn)移給臨近的3′端熒光淬滅基團(發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移,F(xiàn)RET),因此探針完整時,檢測不到該探針5′端熒光基團發(fā)出的熒光。但在PCR擴增中,溶液中的模板變性后低溫退火時,引物與探針同時與模板結(jié)合。在引物的介導(dǎo)下,沿模板向前延伸至探針結(jié)合處,發(fā)生鏈的置換,Taq酶的5′-3′外切酶活性(此活性是雙鏈特異性的,游離的單鏈探針不受影響)將探針5′端連接的熒光基團從探針上切割下來,游離于反應(yīng)體系中,從而脫離3′端熒光淬滅基團的屏蔽,接受光刺激發(fā)出熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。HIV-2雖然只是區(qū)域性感染,以西非和西歐地區(qū)為主,但近年來隨著人口流動加強,在其它地區(qū)亦出現(xiàn)了感染病例。HIV-2攻擊性與HIV-1相比較弱,發(fā)展為艾滋病的潛伏期較長,但后期癥狀類似,危害性相當。傳統(tǒng)的血清學(xué)檢測如ELISA法,免疫熒光法,凝集試驗,免疫印跡法(WB,英文全稱:Westernblot)并不能在感染窗口期檢測出HIV-2,且HIV-2與HIV-1在血清學(xué)上存在一定的交叉反應(yīng),易造成漏檢或誤檢,給后期治療和用藥帶來不便。而普通PCR雖然耗時較少,但由于HIV-2變異性強,亞型較多,導(dǎo)致特異性較差,且其后期的結(jié)果分析需開蓋進行,易造成污染和非特異性擴增造成假陽性,增加了檢測的難度。因此,亟需一種靈敏度高,特異性強,覆蓋面廣,檢測窗口期短的HIV-2檢測方法。技術(shù)實現(xiàn)要素:本發(fā)明提供一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,以解決現(xiàn)有技術(shù)中試劑盒靈敏度低,特異性差的技術(shù)問題。本發(fā)明提供一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,所述人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒包括:人類免疫性缺陷病毒2型核酸PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括反應(yīng)緩沖液、脫氧核糖核苷三磷酸、用于靶多核苷酸擴增的上下游引物以及用于靶多核苷酸檢測的探針,其中,所述用于靶多核苷酸檢測的探針序列為SEQIDNO:3。優(yōu)選的,所述用于靶多核苷酸擴增的上下游引物的序列分別為SEQIDNO:1和2。優(yōu)選的,所述人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒還包括內(nèi)標,所述內(nèi)標的序列為SEQIDNO:7。優(yōu)選的,所述人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒還包括:用于內(nèi)標片段擴增的上下游引物和用于檢測內(nèi)標的探針,所述探針的序列為SEQIDNO:6。優(yōu)選的,所述用于內(nèi)標片段擴增的上下游引物序列分別為SEQIDNO:4和5。優(yōu)選的,所述檢測試劑盒還包括陽性對照和陰性對照。優(yōu)選的,所述檢測試劑盒中還包括酶混合液,所述酶混合液中包括耐熱DNA聚合酶和尿嘧啶DNA糖基化酶,同時在所述PCR反應(yīng)液中還包括dUTP。本發(fā)明中的核苷酸序列如表1所示:本發(fā)明的實施例提供的技術(shù)方案可以包括以下有益效果:本發(fā)明提供一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,包括:人類免疫性缺陷病毒2型核酸PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括反應(yīng)緩沖液、脫氧核糖核苷三磷酸、用于靶多核苷酸擴增的上下游引物以及用于靶多核苷酸檢測的探針,其中,所述用于靶多核苷酸檢測的探針序列為SEQIDNO:3。本發(fā)明提供一種操作快速、方法簡便、檢測特異性好、靈敏度高、檢測范圍寬的人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,本試劑盒提供的用于靶多核苷酸檢測的探針特異性較高,應(yīng)用該試劑盒,可以對未知樣本中的人類免疫性缺陷病毒2型核酸進行快速檢測,為診斷人類免疫性缺陷病毒2型核酸提供可靠的實驗依據(jù),可以解決現(xiàn)有技術(shù)中試劑盒檢測效率低、特異性差以及靈敏度低的問題。應(yīng)當理解的是,以上的一般描述和后文的細節(jié)描述僅是示例性和解釋性的,并不能限制本發(fā)明。具體實施方式本說明書中的各個實施例均采用遞進的方式描述,各個實施例之間相同相似的部分互相參見即可,每個實施例重點說明的都是與其它實施例的不同之處。實施例一本發(fā)明提供一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,所述人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒包括:人類免疫性缺陷病毒2型核酸PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括:30μl反應(yīng)緩沖液、100mM的脫氧核糖核苷三磷酸1.5μl、0.5μl用于靶多核苷酸檢測的探針,其核苷酸序列為SEQIDNO:3以及用于靶多核苷酸擴增的上下游引物,其核苷酸序列分別為SEQIDNO:1和2。HIV-2與HIV-1的基因組同源性較低,僅為40%-60%,且突變性強。針對HIV-2基因組5’和3’的LTR基因高保守區(qū)設(shè)計一對上下游引物及TaqMan探針(SEQIDNO:1、2、3),探針5’和3’分別標記FAM和BHQ1,能實現(xiàn)對HIV-2各亞型的高覆蓋面檢測,同時能將其和HIV-1及其它病毒區(qū)分開來,具有較高的特異性。本發(fā)明提供一種操作快速、方法簡便、檢測特異性好、靈敏度高、檢測范圍寬的人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,本試劑盒提供的用于靶多核苷酸檢測的探針特異性較高,應(yīng)用該試劑盒,可以對未知樣本中的人類免疫性缺陷病毒2型核酸進行快速檢測,為診斷人類免疫性缺陷病毒2型核酸提供可靠的實驗依據(jù),可以解決現(xiàn)有技術(shù)中試劑盒檢測效率低、特異性差以及靈敏度低的問題。實施例二本發(fā)明提供一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒,所述人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒包括:人類免疫性缺陷病毒2型核酸PCR反應(yīng)液,所述PCR反應(yīng)液包括:30μl反應(yīng)緩沖液、100mM的脫氧核糖核苷三磷酸1.5μl、0.5μl用于靶多核苷酸檢測的探針,其核苷酸序列為SEQIDNO:3、用于靶多核苷酸擴增的上下游引物,其核苷酸序列分別為SEQIDNO:1和2、內(nèi)標,其序列為SEQIDNO:7、用于內(nèi)標片段擴增的上下游引物和用于檢測內(nèi)標的探針,其序列分別為SEQIDNO:4、5和6。設(shè)計一種人工合成的由外殼蛋白包裹的含特定RNA序列(SEQIDNO:7)的慢病毒作為內(nèi)標質(zhì)控,另設(shè)計一對檢測內(nèi)標質(zhì)控序列的引物(SEQIDNO:4、5)及一條TaqMan探針(SEQIDNO:6),探針5’和3’分別標記HEX和BHQ1,對靶序列的提取及擴增過程進行監(jiān)控,避免假陰性。此外,本實施例中還包括Tth酶、Taq酶以及催化DNA聚合酶所需要的金屬陽離子,本實施例中PCR反應(yīng)體系的配比如表2所示:表2:PCR反應(yīng)體系的配比組份每一個反應(yīng)中的體積反應(yīng)緩沖液30uldNTPs(100mM)1.5μlTth酶(5U/μl)2.0μlTaq酶(5U/μl)2.0μlMn(OAc)2(30mM)1.5μlSEQIDNO:10.5μlSEQIDNO:20.5μlSEQIDNO:30.25μlSEQIDNO:40.3μlSEQIDNO:50.3μlSEQIDNO:60.15μl滅菌純化水Upto50μl此外,本發(fā)明其他實施例中,還包括陰性對照和陽性對照。本發(fā)明采用陰性血清作為陰性對照,采用人工合成的一定濃度(1×103copies/ml)的假病毒作為陽性對照。本發(fā)明中所提供的方法為一種實時熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR(RealtimeRT-PCR),更具體地說為一種擴增序列特異性檢測的實時熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR。在普通PCR體系中引入了一段兩端帶有熒光化學(xué)基團(報告熒光基團和淬滅熒光基團)的與核酸模板互補的TaqMan探針。本發(fā)明檢測HIV-2所用的引物為用作HIV-2核酸序列中核酸合成起始點的寡核苷酸(SEQIDNO:1、2)。檢測HIV-2內(nèi)標質(zhì)控所用的引物為能用作內(nèi)標質(zhì)控核酸序列中核酸合成起始點的寡核苷酸(SEQIDNO:4、5)。可利用常規(guī)方法從限制性消化物中純化得到上述引物,或者可通過合成方法生產(chǎn)上述引物。引物優(yōu)選為在擴增中效率最高的單鏈,但引物也可以是雙鏈。雙鏈引物首先被變性(如采用加熱方法使其變性),即處理以分離各鏈。在本發(fā)明中,針對HIV-2靶核苷酸和內(nèi)標RNA各設(shè)計了一條熒光標記的TaqMan探針(SEQIDNO:3、6),其中,寡核苷酸探針SEQIDNO:3兩端均分別標記為FAM和BHQ1,寡核苷酸探針SEQIDNO:6兩端分別標記為HEX和BHQ1。擴增開始時,探針與HIV-2靶核酸序列互補性決定的特定位置或內(nèi)標質(zhì)控核酸序列互補性決定的特定位置上與模板序列雜交,在聚合酶5’-3’外切酶活性下被水解,釋放出熒光信號。首先,HIV-2核酸序列經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄酶的催化,完成RNA指導(dǎo)下的cDNA合成,隨后DNA經(jīng)過加熱變性(變性溫度一般范圍約為90-105℃,時間一般進行約30秒或更久)成為cDNA。在擴增開始時,探針與模板結(jié)合,隨后,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號。隨著反應(yīng)的進行,反應(yīng)產(chǎn)物不斷累積,熒光信號強度也等比例增加。每經(jīng)過一個循環(huán),收集一個熒光強度信號,通過熒光強度變化監(jiān)測產(chǎn)物量的變化,得到一條熒光擴增曲線圖。熒光擴增曲線可以分成三個階段:熒光背景信號階段,熒光信號指數(shù)擴增階段和平臺期。在熒光背景信號階段,產(chǎn)生熒光的水平不能與背景明顯地區(qū)別,指數(shù)期時,產(chǎn)物量的對數(shù)值與起始模板量之間存在線性關(guān)系,在平臺期,擴增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加,因此可以在反應(yīng)處于指數(shù)期的某一點上來檢測產(chǎn)物的量,并且由此來推斷模板最初的含量。本發(fā)明的檢測方法為RealtimeRT-PCR,將RNA逆轉(zhuǎn)錄和DNA擴增結(jié)合起來。一般的RealtimeRT-PCR反應(yīng)過程為:1)cDNA合成;2)cDNA預(yù)變性,時間和長度取決于靶核苷酸長度及堿基組成,預(yù)變性的溫度一般為90℃-105℃,時間一般為1-10min,預(yù)變性的目的為使雙鏈核苷酸序列徹底分離為單鏈;3)變性,溫度一般為90℃-105℃,時間一般為10s-30s;4)退火,使各引物退火至HIV-2或內(nèi)標質(zhì)控核酸的靶序列上。退火的溫度通常為40℃-60℃,退火的時間可以是10s-60s;5)延伸,引物與模板結(jié)合,開始合成新的雙鏈DNA,延伸溫度一般為40℃-80℃,延伸時間可以是10s-5min。熒光檢測通道選擇:1)選擇FAM通道(Reporter:FAM,Quencher:none)檢測人類免疫性缺陷病毒2型核酸;2)選擇HEX通道(Reporter:ROX,Quencher:none)檢測內(nèi)標;4)參比熒光(PassiveReference)設(shè)置為none。熒光定量實時PCR反應(yīng)條件如表3所示。表3:熒光定量實時PCR反應(yīng)條件結(jié)果分析:反應(yīng)結(jié)束后,儀器自動保存結(jié)果,可以利用儀器自帶的軟件進行自動分析(也可以手動調(diào)節(jié)基線的開始值、結(jié)束值以及閾值線值進行分析),然后記錄樣本Ct值和定值結(jié)果。擴增曲線與閾值線的交點,稱為Ct(即cyclethreshold,指PCR反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達到設(shè)定的閾值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)值)。具體測試結(jié)果分析如下:1)當FAM通道無CT值,且HEX通道CT值≦40(一般為28-32)時,可報告檢測結(jié)果為陰性;2)當FAM通道CT值≦40,且HEX通道CT值≦40,可報告檢測結(jié)果為陽性;3)當FAM通道CT值≧40,且HEX通道CT值≦40,可報告樣本濃度低于檢測下線,結(jié)果僅供參考;4)當HEX通道CT值≧40,該檢測結(jié)果無效,應(yīng)查找并排除原因,并重復(fù)試驗;5)當出現(xiàn)陰性對照有CT值或呈典型S型擴增曲線、陽性對照無CT值或無擴增曲線兩種情況中的任一種時,該檢測結(jié)果無效,應(yīng)查找并排除原因,并重復(fù)試驗。為證明該發(fā)明方法的可行性,進行如下測試:(1)最低檢測限(LOD)試驗通過對各濃度梯度的樣本進行檢測,表明本檢測方法的檢測靈敏度(LOD)為15IU/mL。(2)特異性實驗—與其它疾病的交叉反應(yīng)情況通過用本發(fā)明中的檢測方法對HIV-2以外的其它病原體進行檢測,結(jié)果表明本發(fā)明中的方法對HIV-1的O、M、N3個組型、HBVA-H8型、HCV1-6型、EB病毒等病原體感染樣本無交叉反應(yīng),表明其具有高特意性。(3)對潛在內(nèi)源物質(zhì)的抗干擾性試驗表明,當血漿樣本中甘油三脂≦3000mg/dL、非結(jié)合性膽紅素≦40mg/dL、血紅蛋白≦500mg/dL、血蛋白≦9g/dL時,本檢測方法的靈敏度不受干擾。當血漿樣本中血細胞體積比≧2.5時,可能會出現(xiàn)內(nèi)標失敗的現(xiàn)象。(4)對潛在外源物質(zhì)的抗干擾性試驗表明,當樣本中含有齊多夫定、替諾福韋、拉米夫定、洛匹那韋立托那韋、阿德福韋酯,替比夫定,恩替卡韋,替諾福韋酯、撲熱息痛、扎那米韋(200μg/ml)等常見的抗病毒藥物時,對本試劑盒的檢測靈敏度不會受到明顯干擾。本發(fā)明中的檢測方法基于實時熒光逆轉(zhuǎn)錄PCR,把PCR、熒光探針融為一體,使PCR擴增和產(chǎn)物分析的全過程均在單管封閉條件下進行,能對反應(yīng)過程進行實時監(jiān)測。實時熒光定量技術(shù)是近年來發(fā)展迅速的一種核酸檢測技術(shù),使用一種帶有熒光檢測裝置的擴增儀,熒光檢測裝置能夠按照一定的程序周期性地發(fā)出特定波長的激發(fā)光,收集檢測熒光信號,通過檢測熒光信號的動態(tài)變化實時反映的每個循環(huán)的擴增水平,根據(jù)擴增曲線及CT值可以判斷檢測結(jié)果的陰陽性。同時,通過設(shè)計不同濃度的假陽性樣本作為定量參考品,可通過標準曲線計算出樣本的絕對濃度。本發(fā)明中的用實時熒光PCR技術(shù)檢測HIV-2與其它檢測技術(shù)相比具有以下優(yōu)勢:(1)采用實時熒光PCR技術(shù)檢測HIV-2與傳統(tǒng)的血清免疫學(xué)檢測比較,具有更高的靈敏度,從理論上講只要有一個基因拷貝就可以檢測出來,同時避免了交叉反應(yīng),縮短了檢測窗口期。(2)根據(jù)HIV-2基因組獨特的保守基因序列設(shè)計引物和探針,能夠保證PCR反應(yīng)的高度特異性。HIV-2與HIV-1的基因組同源性較低,僅為40%-60%,且突變性強,而位于基因組中間區(qū)域的env基因更甚。本發(fā)明在引物設(shè)計上避開高突變區(qū)域,針對HIV-2基因組的5’LTR及3’LTR高保守區(qū)設(shè)計一對引物探針,能實現(xiàn)對HIV-2各亞型的高覆蓋面檢測,同時能將其和HIV-1及其它病毒區(qū)分開來,具有較高的特異性。(3)采用人工合成的慢病毒作為內(nèi)標質(zhì)控,確保檢測結(jié)果的準確度。本發(fā)明中采用一種由蛋白質(zhì)外殼包裹的,含特定RNA序列的慢病毒顆粒作為內(nèi)標質(zhì)控,內(nèi)標質(zhì)控可參與HIV-2核酸的提取和PCR反應(yīng),監(jiān)控實驗操作過程和PCR反應(yīng)過程,避免出現(xiàn)假陰性,增加了檢測結(jié)果的可信度。(4)集PCR的高靈敏性與TaqMan探針的高特異性兩大優(yōu)點于一身,在很大程度上改變了傳統(tǒng)PCR的缺陷,縮短了檢測時間,簡化檢測步驟,提高了檢測效率。(5)檢測全過程均在單管封閉條件下進行,避免了由于樣本間交叉引起的假陽性和環(huán)境污染。(6)可連續(xù)不斷的檢測PCR過程中實時信號的變化,避免了傳統(tǒng)PCR的“平臺期效應(yīng)”,并且模板的定量不通過終產(chǎn)物,而由Ct值算出,準確性和靈敏性都有提高。以上所述的本發(fā)明實施方式,并不構(gòu)成對本發(fā)明保護范圍的限定。任何在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的修改、等同替換和改進等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。以上所述僅是本發(fā)明的具體實施方式,使本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠理解或?qū)崿F(xiàn)本發(fā)明。對這些實施例的多種修改對本領(lǐng)域的技術(shù)人員來說將是顯而易見的,本文中所定義的一般原理可以在不脫離本發(fā)明的精神或范圍的情況下,在其它實施例中實現(xiàn)。因此,本發(fā)明將不會被限制于本文所示的這些實施例,而是要符合與本文所公開的原理和新穎特點相一致的最寬的范圍。SEQUENCELISTING<110>湖南圣湘生物科技有限公司<120>一種人類免疫性缺陷病毒2型核酸檢測試劑盒<130>2016<160>7<170>PatentInversion3.3<210>1<211>21<212>DNA<213>引物<400>1gcaggtagagcctgggtgttc21<210>2<211>22<212>DNA<213>引物<400>2gaagagggctttaagcaagcaa22<210>3<211>27<212>DNA<213>探針<400>3tgctagactctcaccagyrcttggccg27<210>4<211>22<212>DNA<213>引物<400>4taggaggtagagcctgggtgtt22<210>5<211>17<212>DNA<213>引物<400>5ccagcaccggccaagtg17<210>6<211>28<212>DNA<213>探針<400>6agcctgggtgttccctgctagactctca28<210>7<211>154<212>DNA<213>內(nèi)標<400>7tagattaggaggtagagcctgggtgttgtcacaacatttgtgttgtaagtgtaataatca60acttcagctagtagtagaaacctcgcaagacagcctgggtgttccctgctagactctcat120ggacacactacacttggccggtgctggtgtgttt154當前第1頁1 2 3