本發(fā)明屬于醫(yī)療數(shù)據(jù)處理,具體涉及一種對(duì)腹部平掃ct圖像中腎上腺區(qū)域的自動(dòng)分割模型。
背景技術(shù):
1、腎上腺是人體最重要的內(nèi)分泌器官之一,負(fù)責(zé)合成和分泌多種激素。其位于雙側(cè)腎上極的內(nèi)側(cè),左右各一,按組織學(xué)結(jié)構(gòu)可分為皮質(zhì)和髓質(zhì)兩個(gè)部分。可發(fā)生多種病變。作為無創(chuàng)檢查,?ct檢查由于密度分辨力高和空間分辨力較高,易于發(fā)現(xiàn)較小病變,并顯示病變的某些組織學(xué)特征,例如脂肪、液體以及鈣化等成分,對(duì)于腎上腺增生、萎縮、腎上腺髓質(zhì)瘤和腎上腺囊腫等,應(yīng)當(dāng)優(yōu)先使用ct或者其他成像方法進(jìn)行診斷。因腎上腺被其他器官所包圍,活檢較為困難。
2、現(xiàn)有的腹部圖像智能分割方法一般都以增強(qiáng)ct作為對(duì)象。一般來說,經(jīng)過初步診斷,發(fā)現(xiàn)可疑部位的病人,通常會(huì)采用增強(qiáng)ct的方法。該方法主要通過對(duì)患者靜脈注射含碘的造影劑。由于碘對(duì)于輻射具有更高的吸收效率,造影劑隨著血液循環(huán)流經(jīng)各個(gè)器官,相應(yīng)器官在ct圖像中的灰度值就會(huì)顯著提高,使得器官的邊界更加明顯、易于區(qū)分。盡管增強(qiáng)ct是一種非常有效的方式,但相對(duì)于平掃ct來說,增強(qiáng)ct需要更高的金錢和時(shí)間成本。雖然使用的靜脈造影劑對(duì)人無毒副作用,但仍有少數(shù)人對(duì)造影劑可產(chǎn)生過敏反應(yīng);同時(shí),在診斷進(jìn)程中,需要時(shí)間讓造影劑隨血液流經(jīng)檢查部位;掃描結(jié)束后,病人仍需要留滯觀察數(shù)十分鐘是否存在不良反應(yīng);對(duì)造影劑的代謝也會(huì)對(duì)人體健康產(chǎn)生影響。
3、人工智能應(yīng)用于醫(yī)學(xué)圖像,不僅能幫助醫(yī)生快速的分析和解讀圖像數(shù)據(jù),提高工作效率,讓醫(yī)生能夠在較短時(shí)間內(nèi)為更多患者提供服務(wù)。更能通過日益發(fā)達(dá)的移動(dòng)互聯(lián)網(wǎng)技術(shù),實(shí)現(xiàn)跨區(qū)域的遠(yuǎn)程醫(yī)療咨詢于診斷,特別是在偏遠(yuǎn)地區(qū)或資源匱乏的地區(qū),為更多人提供高質(zhì)量的醫(yī)療服務(wù)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有方法多為針對(duì)增強(qiáng)ct圖像的腎上腺且分割精度不高的問題,提出了一種針對(duì)平掃ct腎上腺區(qū)域的分割方法。
2、本發(fā)明的技術(shù)方案如下:
3、一種平掃ct圖像中腎上腺區(qū)域分割的方法,包括以下步驟:
4、s1:選取腎上腺無病變的腹部ct平掃圖像,并勾畫出腎上腺區(qū)域圖像的感興趣區(qū)域;
5、s2:對(duì)步驟s1中的ct圖像按照8:2分為原始訓(xùn)練集和測(cè)試集,對(duì)原始訓(xùn)練集,分別按照水平面、矢狀面和冠狀面三個(gè)視角進(jìn)行逐層分割,分別記為水平面、矢狀面和冠狀面的粗分割數(shù)據(jù)集;對(duì)三個(gè)粗分割數(shù)據(jù)集,隨機(jī)裁剪出像素大小為128*128的圖像,得到水平面、矢狀面和冠狀面的精分割數(shù)據(jù)集;
6、s3:將步驟s2中的三個(gè)粗分割訓(xùn)練集分別送入三個(gè)帶注意力模塊、深度為5的u型卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練,得到三個(gè)視角的粗分割網(wǎng)絡(luò);
7、s4:將步驟s2中的三個(gè)粗分割訓(xùn)練集送入步驟s3中訓(xùn)練得到的對(duì)應(yīng)視角的網(wǎng)絡(luò),取得網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)的結(jié)果為正樣本的區(qū)域,取得這些區(qū)域中的最大連通域,并以最大連通域?yàn)橹行?,裁剪為像素大小?28*128的圖像,得到三個(gè)不同視角下的粗分割網(wǎng)絡(luò)輸出,記作差異化數(shù)據(jù)集;
8、s5:將步驟s4中得到的差異化數(shù)據(jù)集分別送入三個(gè)帶注意力模塊、深度為3的u型卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練;再將步驟s2中得到的三個(gè)精分割數(shù)據(jù)集分別送入這三個(gè)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練;
9、重復(fù)步驟s5,得到三個(gè)視角的精分割網(wǎng)絡(luò);
10、s6:將步驟s2所述的原始訓(xùn)練集分三個(gè)視角,由步驟s4中生成的粗分割網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行預(yù)測(cè),將得到的預(yù)測(cè)結(jié)果為正樣本的區(qū)域等權(quán)重相加,取得這些區(qū)域中的最大連通域,并以最大連通域?yàn)橹行?,裁剪為像素大小?28*128*128的3d圖像,將所述3d圖像分三個(gè)視角由步驟s5中生成的精分割網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行預(yù)測(cè),得到三個(gè)視角下的精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果,將圖像中某一像素以及周圍像素的灰度值、像素對(duì)應(yīng)的三個(gè)精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果組合成一個(gè)數(shù)列,得到融合網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練集;
11、s7:將步驟s6中生成的融合網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練集送入一個(gè)全連接網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練,得到三視角融合網(wǎng)絡(luò),對(duì)步驟s2中生成的測(cè)試集,按照步驟s6逐步預(yù)測(cè),得到三個(gè)精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果,將結(jié)果通入中得到的三視角融合網(wǎng)絡(luò),得到該ct圖像中腎上腺區(qū)域的分割結(jié)果。
12、進(jìn)一步,在步驟s5中,對(duì)精分割網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練時(shí),使用的損失函數(shù)包括改進(jìn)后的交叉熵?fù)p失函數(shù),該損失函數(shù)針對(duì)粗分割網(wǎng)絡(luò)和精分割網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測(cè)差異區(qū)域作為重點(diǎn),其公式定義為:
13、
14、其中,是模型對(duì)于樣本的預(yù)測(cè)概率,定義為:
15、
16、為在步驟s1中,勾畫出的腎上腺區(qū)域的標(biāo)簽值,為模型對(duì)腎上腺區(qū)域的預(yù)測(cè)結(jié)果,為焦點(diǎn)因子,為焦點(diǎn)因子的調(diào)節(jié)變量(本發(fā)明中取2),為權(quán)重值,其值為:當(dāng)體素被精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)為正樣本,但被粗分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)為負(fù)樣本時(shí),,其他情況下,;
17、在步驟s5中,使用差異化訓(xùn)練方法:將步驟s4中得到的差異化數(shù)據(jù)集分別送入三個(gè)帶注意力模塊、深度為3層的u型卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練時(shí),使用改進(jìn)后的交叉熵?fù)p失函數(shù)fl和dsc系數(shù)損失函數(shù)fdice結(jié)合,其公式表達(dá)為:
18、
19、其中,表示精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果,表示粗分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果,即第一步中的感興趣區(qū)域。
20、進(jìn)一步,在步驟s7中,使用融合多視角輸出的全連接網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)以某一像素為中心的5*5*5范圍內(nèi)所有像素的灰度值、5*5*5范圍所有像素對(duì)應(yīng)的三個(gè)精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果組合成一個(gè)數(shù)列作為輸入,輸出為的預(yù)測(cè)結(jié)果。
21、本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比,有益效果在于:
22、本發(fā)明基于帶注意力模塊的u型卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)平掃ct圖像中的腎上腺區(qū)域的分割,在常用的兩步法的基礎(chǔ)之上提出了一種新的訓(xùn)練方法,并輔以改進(jìn)后的交叉熵?fù)p失函數(shù)使分割模型關(guān)注于難以分割的邊界區(qū)域;同時(shí)使用了多視角方法并引入了融合網(wǎng)絡(luò),使得模型的分割精度進(jìn)一步提升,提高了模型分割結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性。
1.一種平掃ct圖像中腎上腺區(qū)域分割的方法,包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種平掃ct圖像中腎上腺區(qū)域分割的方法,其特征在于,在步驟s5中,對(duì)精分割網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練時(shí),使用的損失函數(shù)包括改進(jìn)后的交叉熵?fù)p失函數(shù),該損失函數(shù)針對(duì)粗分割網(wǎng)絡(luò)和精分割網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測(cè)差異區(qū)域作為重點(diǎn),其公式定義為:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種平掃ct圖像中腎上腺區(qū)域分割的方法,其特征在于,在步驟s7中,使用融合多視角輸出的全連接網(wǎng)絡(luò),該網(wǎng)絡(luò)以某一像素為中心的5*5*5范圍內(nèi)所有像素的灰度值、5*5*5范圍所有像素對(duì)應(yīng)的三個(gè)精分割網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)結(jié)果組合成一個(gè)數(shù)列作為輸入,輸出為的預(yù)測(cè)結(jié)果。