專利名稱:昆蟲β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因及其應用的制作方法
技術領域:
本發明涉及生物技術領域。具體涉及昆蟲β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因序列及其dsRNA的應用。
背景技術:
在我國長期施用有機氯、有機磷等化學殺蟲劑防治害蟲,導致一系列問題農藥殘留導致農業環境污染;昆蟲出現抗藥性,防治成本提高;有毒農藥危害人類身體健康等。目前已有將生物殺蟲劑應用于害蟲防治,但往往作用時間較長,效果緩慢。為更為有效地進行植物保護,迫切需要研發新型的害蟲防治方法。RNA干擾(RNAi)是一種通常由雙鏈RNA分子引起的特異性轉錄后基因沉默現象,于2006年獲得諾貝爾獎。這一發現不僅是基因功能研究方法上的突破,同時也為人類的疾 病治療和作物害蟲防治開辟了新的途徑。2008年,Price和Gatehouse總結了眾多研究結果后,提出了基于RNAi的害蟲防治策略。基于RNA干擾技術的害蟲防治具有如下優勢1)選擇對害蟲專一的基因進行干擾,對高等動物和和人類是安全的;2)防治害蟲具有專一性,對非靶標生物無殺傷作用;3)對環境無毒無害。
發明內容
本發明的目的是提供一種昆蟲β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因及其dsRNA在致死害蟲中的應用。本發明提供的一種β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列是SEQ ID NO
I。該序列是通過對飛蝗EST數據庫的搜索,得到17條飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因基因片段,通過序列拼接和比對后,進一步克隆獲得。該序列長2667bp,包含1845bp開放閱讀框。本發明提供的一種昆蟲β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列是SEQ IDNO :2,是根據SEQ ID NO :1設計上游引物SEQ ID NO :3和下游引物SEQ ID NO :4,通過PCR擴增獲得SEQ ID Ν0:2,其含有Τ7啟動子。進一步利用試劑盒合成dsRNA。所述dsRNA是用上游引物SEQ ID NO 3和下游引物SEQ ID NO 4合成PCR產物,經Wizardrft'SV Gel and PCR Clean-Up System (Promega)試劑盒純化后按照 T7RiboMAXTMExpress RNAi System (Promega)試劑盒說明體外轉錄合成。SEQ ID NO 2合成的dsRNA在致死害蟲中的應用注射上述dsRNA到昆蟲體腔,結果表明SEQ ID NO 2合成的dsRNA可以特異性地沉默β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因LmNAGl的mRNA表達,并導致飛蝗蛻皮困難而死亡。
圖I :2齡飛蝗注射SEQ ID NO :2合成的dsRNA后出現蛻皮困難而死亡的表型。A為注射dsGFP的對照,B為注射SEQ ID NO 2合成的dsRNA。
圖2 :5齡飛蝗注射SEQ ID NO :2合成的dsRNA后出現蛻皮困難而死亡的表型。A為注射dsGFP的對照,B為注射SEQ ID NO 2合成的dsRNA。圖3 :飛蝗注射SEQ ID NO 2合成的dsRNA后飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因LmNAGl的不同時間點mRNA表達,β-actin做為內參基因。24,48,72為注射dsRNA后的小時數。**P〈0. 01。
具體實施例方式實施例I :飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因片段及其dsRNA的獲得I、飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因片段的獲得I)飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因在飛蝗表達序列標簽EST數據庫的搜索
基于飛蝗的表達序列標簽(EST)數據庫,采用生物信息學方法對飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因進行搜索,經過序列分析及比對后,共獲得17條飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因片段。經拼接后,獲得的飛蝗β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因(LmNAGl)序列全長2667bp,開放閱讀框1845bp。2)飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因引物的設計基于已獲得LmNAGl的堿基序列,采用primer premier5. O軟件設計引物。所有引物均由上海英濰捷基生物有限公司合成。3)飛蝗總RNA獲得選取大小一致雌雄各半飛蝗5齡若蟲,四頭一組,冷凍于液氮中,待提取RNA,具體操作步驟參照TaKaRa Trizol試劑盒。4)第一鏈cDNA的合成 參照M-MLV反轉錄TaKaRa試劑說明書,進行第一鏈cDNA的合成。5)飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因序列的獲得根據天根MasterMix說明書進行PCR,進一步克隆獲得的飛蝗β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因。6)飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因堿基序列的分析利用Expasy網站中相關在線軟件和GENED0C、基因探索者等軟件分析所得序列,之后在NCBI網站中使用BLAST功能進行序列同源性比對。2、飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA合成I)飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA引物的設計基于本研究所得到飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因的序列SEQ ID NO :1,采用primer premier5. O軟件設計。設計dsRNA引物,其序列分別為SEQ ID NO :3和SEQ IDNO :4。所有引物均由上海英濰捷基生物有限公司合成。2)飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA的合成上述dsRNA 引物合成 PCR 產物,經Wizard SV Gel and PCR Clean-Up System(Promega)試劑盒純化后按照 T7RiboMAXTM Express RNAi System(Promega)試劑盒說明體外轉錄合成dsRNA。dsRNA濃度采用酶標儀SpectraMax 190測定,并濃縮至終濃度為3 μ g/μ I。實施例2 :飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA致死2齡飛蝗
I、飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA注射將I μ I (3 μ g)SEQ ID NO :2的dsRNA用25 μ I規格微量注射器注射到2齡飛蝗第2日齡若蟲二、三腹節之間,共注射30只,雌雄各半。注射相同體積濃度的dsGFP至對照組體內。將注射后飛蝗置于28°C恒溫生化培養箱中飼養。2、注入dsRNA后2齡飛蝗表型的觀察2齡若蟲經注射dsRNA后,注射dsGFP對照組3天后開始蛻皮并全部成功蛻至三齡,平均蛻皮時間為15-20分鐘,蛻至三齡后蟲體形態活力正常,并于半天后開始正常進食。注射dsLmNAGl的處理組若蟲共30頭,與對照組若蟲相比均出現延遲I天蛻皮的現象,并且蛻皮過程的持續時間均>lh,其中有9頭若蟲最終不能完成蛻皮導致死亡,能夠蛻至三齡的處理組若蟲蛻皮后出現身體柔軟、活力不足、進食量減少等現象。當三齡若蟲蛻至四齡時,對照組蟲體仍然能夠正常順利地完成蛻皮,隨后蛻至五齡乃至成蟲。而處理組21頭若蟲中,有6頭蛻皮困難而導致死亡,至此處理組若蟲的死亡率達到50. 0%,蛻至四齡的若蟲 最終可以發育至成蟲。蛻皮困難并最終導致蟲體死亡的15頭若蟲都出現統一的表型(圖
1):頭部、胸部及腹部舊表皮均能夠開裂并剝離,但蛻至附肢時,新舊表皮無法分離,蟲體開始出現反復掙扎,時間長達數小時,最終導致死亡。實施例3 :飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA致死5齡飛蝗I、飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因dsRNA注射將2 μ I (6 μ g)SEQ ID NO :2的dsRNA用25 μ I規格微量注射器注射到5齡飛蝗第2日齡若蟲二、三腹節之間,共注射40只,雌雄各半。注射相同體積濃度的dsGFP至對照組體內。將注射后飛蝗置于28°C恒溫生化培養箱中飼養。2、注入dsRNA后5齡飛蝗表型的觀察五齡若蟲注射dsRNA后,對照組蟲體3天后開始蛻皮并在注射后第5天全部成功發育至成蟲,蛻皮時間約為20min,蛻皮發育為成蟲后蟲體狀態良好。注射dsLmNAGl的處理組若蟲共40頭,與對照組相比未出現蛻皮延遲的現象,但蛻皮持續時間仍均>lh,其中有I頭于注射后3天死亡、2頭于注射后4天死亡、18頭于注射后5天(即五齡第七天)死亡,僅有19頭若蟲能夠蛻至成蟲,死亡率達到52. 5%。19頭死亡若蟲出現三種不同的表型(圖
2):第一種為蝗蝻蛻皮時僅前胸背板及頭部沿脊線開裂少許,開裂部分可見新表皮,后腹部僅蛻出一小段從而死亡;第二種表型是附肢新舊表皮無法分離,且新翅也無法從舊表皮翅芽中蛻出;第三種則是前胸背板脊線開裂部分增大,可一直延長至下腹部背板,前胸背板處新表皮脹裂,體液溢出導致蟲體死亡。以上三種表型出現的幾率基本相同。3、飛蝗β -N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因沉默檢測對于5齡dsRNA注射后不同時間點的沉默效率檢測,選擇注射后24h、48h和72h的整蟲蟲體作為RNA提取對象,每組各個時間點設置3個生物學重復。提取各樣品的總RNA并反轉錄成第一鏈cDNA,用RT-PCR和Real-time PCR檢測目的基因(LmNAGl)和管家基因(β -actin)的相對表達量,以計算目的基因的沉默效率(圖3)。
權利要求
1.一種昆蟲β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列是SEQ ID Ν0:1。
2.一種昆蟲β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列是SEQ ID Ν0:2。
3.如權利要求2所述的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因,含有Τ7啟動子。
4.如權利要求2所述的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因合成的dsRNA,所述dsRNA是用上游引物SEQ ID NO :3和下游引物SEQ ID NO :4合成PCR產物,經fizard SV Gel andPCR Clean-Up System (Promega)試劑盒純化后按照 T7RiboMAX Express RNAi System(Promega)試劑盒說明體外轉錄合成。
5.如權利要求5所述的dsRNA在致死蝗蟲中的應用。
全文摘要
本發明提供一種昆蟲β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因(NAG)的序列及其雙鏈RNA(dsRNA)的應用方法,它可沉默特定的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因,使害蟲死亡。對飛蝗β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因進行克隆和測序后,得到序列為SEQ ID NO1的β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶基因;然后選擇序列為SEQ ID NO2的該基因片段,用于dsRNA的合成。該基因dsRNA注入昆蟲體腔后,昆蟲生長過程發育遲緩;無法順利蛻皮進入下一齡期,導致死亡。本發明為基于RNA干擾的害蟲防治提供新的靶標。
文檔編號C12N15/56GK102876691SQ20121035667
公開日2013年1月16日 申請日期2012年9月21日 優先權日2012年9月21日
發明者李大琪, 容爍, 李濤, 張建珍, 馬恩波 申請人:山西大學