1.一種與白葉枯病抗性基因Xa7緊密連鎖的SNP分子標(biāo)記,其特征在于,其序列如SEQ ID No.1所示,第61bp位點(diǎn)處的堿基為C或G。
2.用于檢測(cè)權(quán)利要求1所述分子標(biāo)記的引物組合,其特征在于,包括:
(1)兩條特異性引物:
Primer X:5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAC-3’;
Primer Y:5’-ACATCCTATTTGCGATTGAAG-3’;
(2)一條通用引物:
Primer C:5’-GCTGACATGCATCTTCACAT-3’。
3.含有權(quán)利要求2所述引物組合的試劑或試劑盒。
4.權(quán)利要求2所述的引物組合在檢測(cè)白葉枯病抗性基因Xa7中的應(yīng)用。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應(yīng)用,其特征在于,包括如下步驟:
S1、提取水稻樣品基因組DNA;
S2、以水稻基因組DNA為模板,利用權(quán)利要求2所述引物組合進(jìn)行KASP反應(yīng)檢測(cè);其中,兩條特異性引物分別連接不同的熒光序列;
S3、若只檢測(cè)到引物Primer Y所連熒光序列對(duì)應(yīng)的熒光信號(hào),則判斷水稻樣品為攜帶白葉枯病抗性基因Xa7的純和型;若只檢測(cè)到引物Primer X所連熒光序列對(duì)應(yīng)的熒光信號(hào),則判斷水稻樣品為不攜帶白葉枯病抗性基因Xa7的純和型;若同時(shí)檢測(cè)到兩種熒光,則判斷水稻樣品為攜帶白葉枯病抗性基因Xa7的雜合型。
上述應(yīng)用的實(shí)質(zhì)為前述分子標(biāo)記的檢測(cè)方法。
6.權(quán)利要求1所述分子標(biāo)記在水稻抗病性輔助育種中的應(yīng)用,其特征在于,包括如下步驟:
S1、提取水稻樣品基因組DNA;
S2、以水稻基因組DNA為模板,利用權(quán)利要求2所述引物組合進(jìn)行KASP反應(yīng)檢測(cè);其中,兩條特異性引物分別連接不同的熒光序列;
S3、選擇檢測(cè)到引物Primer Y所連熒光序列對(duì)應(yīng)的熒光信號(hào)的水稻樣品進(jìn)行育種。