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一種比較斷奶仔豬抗應(yīng)激生理反應(yīng)能力的標(biāo)記引物和方法與流程

文檔序號:11145754閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種比較斷奶仔豬血清GA、Cor含量以及小腸絨毛高度差異的標(biāo)記引物,其特征在于:該引物對包括GLS、EGFR、IGF-1、IGF-1R;其中,

引物對GLS,正向引物序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2所示;

引物對EGFR,正向引物序列如SEQ ID NO.3所示,反向引物序列如SEQ ID NO.4所示;

引物對IGF-1,正向引物序列如SEQ ID NO.5所示,反向引物序列如SEQ ID NO.6所示;

引物對IGF-1R,正向引物序列如SEQ ID NO.7所示,反向引物序列如SEQ ID NO.8所示。

2.一種比較斷奶仔豬血清GA、Cor含量以及小腸絨毛高度差異的方法,其特征在于:該方法分別以與血清GA、Cor含量呈正相關(guān)的候選基因GLS和EGFR的表達(dá)水平比較不同斷奶仔豬個體血清GA、Cor含量差異,與小腸絨毛高度呈正相關(guān)的候選基因IGF-1、IGF-R的表達(dá)水平比較不同斷奶仔豬個體小腸絨毛高度差異。

3.一種比較斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況的方法,其特征在于:該方法以與斷奶仔豬腸道生長發(fā)育相關(guān)聯(lián)的血清GA、Cor含量、仔豬小腸絨毛高度為對象,通過分析與血清GA、Cor含量呈正相關(guān)的候選基因GLS和EGFR的表達(dá)水平,與小腸絨毛高度呈正相關(guān)的候選基因IGF-1、IGF-R的表達(dá)水平,判定斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況,標(biāo)記基因表達(dá)水平高的斷奶仔豬比標(biāo)記基因表達(dá)水平低的斷奶仔豬腸道發(fā)育更良好。

4.權(quán)利要求3所述的比較斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況的方法,其特征在于:該方法具體包括如下步驟:(1)斷奶仔豬小腸總RNA提取;(2)引物設(shè)計:分別設(shè)計候選基因GLS的反轉(zhuǎn)錄引物對GLS、候選基因EGFR的反轉(zhuǎn)錄引物對EGFR、候選基因IGF-1的反轉(zhuǎn)錄引物對IGF-1、候選基因IGF-1R的反轉(zhuǎn)錄引物對IGF-1R;(3)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA:使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒對步驟(1)得到的總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA;(4)采用步驟(2)通過q-RT-PCR方法測定候選基因GLS、EGFR、IGF-1、IGF-1R在斷奶仔豬個體小腸中的表達(dá)量;(5)根據(jù)各候選基因在不同斷奶仔豬個體的表達(dá)量的差異確定不同斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況;

其中,引物對GLS,正向引物序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物序列如SEQ ID NO.2所示;

引物對EGFR,正向引物序列如SEQ ID NO.3所示,反向引物序列如SEQ ID NO.4所示;

引物對IGF-1,正向引物序列如SEQ ID NO.5所示,反向引物序列如SEQ ID NO.6所示;

引物對IGF-1R,正向引物序列如SEQ ID NO.7所示,反向引物序列如SEQ ID NO.8所示。

5.權(quán)利要求4所述的比較斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況的方法,其特征在于,步驟(4)所述q-RT-PCR方法具體包括如下步驟:

(1)標(biāo)準(zhǔn)品制備及條件優(yōu)化:每個待測RNA的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物取等量混合,將cDNA混合樣按梯度稀釋,用RT-PCR的反應(yīng)體系,對每個目的基因作標(biāo)準(zhǔn)曲線來優(yōu)化整個反應(yīng)條件;

(2)q-RT-PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立和擴(kuò)增曲線:采用RT-PCR方法作目的基因GLS、EGFR、IGF-1、IGF-1R的標(biāo)準(zhǔn)曲線,得到各個目的基因及內(nèi)參β-Actin基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線,對結(jié)果相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,當(dāng)標(biāo)準(zhǔn)曲線的相關(guān)系數(shù)及擴(kuò)增效率均等于或接近于1.000時,表明實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)誤差較小,可信度較高,實(shí)驗(yàn)所得的Ct值可準(zhǔn)確地測定起始cDNA的拷貝數(shù);目的基因和看家基因標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率小于0.1,表明兩個基因的標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率基本一致,在后續(xù)實(shí)驗(yàn)中可以使用分析Comparative Delta-delta Ct法進(jìn)行相對定量分析;

(3)相關(guān)候選基因的q-RT-PCR反應(yīng):采用RT-PCR法檢測豬GLS、EGFR、IGF-1、IGF-1R、FUT1、LYZ、TAP1、SLA-DQB、TLR4基因及內(nèi)參基因β-Actin在斷奶仔豬小腸各段的表達(dá)量;

(4)數(shù)據(jù)分析:目的基因mRNA表達(dá)豐度采用2-ΔΔCT法對有效數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析,計算出每個樣本目的基因的相對表達(dá)水平,通過內(nèi)參基因β-Actin校正;

其中,內(nèi)參基因β-Actin的擴(kuò)增引物對β-antin上游序列如SEQ ID NO.9所示,下游引物序列如SEQ ID NO.10所示。

6.權(quán)利要求5所述的比較斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況的方法,其特征在于,步驟(4)q-RT-PCR 反應(yīng)體系為20μL,包括:SYBR綠色熒光染料10μL,上游引物1μL,下游引物1μL,cDNA1μL,超純水7μL;反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性30s;95℃變性10s,退火溫度下退火30s,40個循環(huán),于65℃5s至95℃5s時搜集熒光值;其中,引物對GLS的退火溫度為58.8℃;引物對EGFR的退火溫度為60℃;引物對IGF-1和IGF-1R的退火溫度為61℃。

7.權(quán)利要求4所述的比較斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況的方法,其特征在于,步驟(3)反轉(zhuǎn)錄合成cDNA具體包括如下步驟:(1)基因組DNA除去反應(yīng):體系包括:5×gDNA Eraser緩沖液2μL,gDNA Eraser1μL,總RNA1μg,加超純水至10μL;反應(yīng)條件為:42℃反應(yīng)2min,4℃保存,得反應(yīng)液I;(2)反轉(zhuǎn)錄反應(yīng):體系包括:反應(yīng)液I 10μL,Buffer2 4.0μL,RT酶混合液I 1.0μL,RT Primer Mix 1.0μL,加超純水至20μL;反應(yīng)條件為:使用普通PCR儀設(shè)置程序37℃反應(yīng)15min,85℃反應(yīng)5s,4℃保存,得反轉(zhuǎn)錄樣品cDNA,檢測后置于-20℃條件下備用。

8.權(quán)利要求3-7任一項所述比較斷奶仔豬腸道發(fā)育狀況的方法,其特征在于:所述斷奶仔豬品種為安徽地方品種安慶六白豬。

9.權(quán)利要求3-7任一項所述方法在斷奶仔豬抗應(yīng)激生理反應(yīng)能力比較中的應(yīng)用,其特征在于:該方法比較GLS、EGFR和IGF-1、IGF-R的表達(dá)水平,基因表達(dá)水平越高,說明與基因表達(dá)正相關(guān)的GA、Cor和仔豬小腸絨毛高度水平越高,仔豬斷奶抗應(yīng)激能力越強(qiáng)。

10.權(quán)利要求9所述方法在斷奶仔豬抗應(yīng)激生理反應(yīng)能力比較中的應(yīng)用,其特征在于:所述斷奶仔豬品種為安徽地方品種安慶六白豬。

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