本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種抗菌肽Dermaseptin-M及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
抗生素在養(yǎng)殖業(yè)中的濫用導(dǎo)致藥物在動物產(chǎn)品中殘留,已經(jīng)嚴(yán)重影響食品安全,使細(xì)菌對抗生素產(chǎn)生耐藥性,并通過餐桌潛入人體,成為潛伏在人體內(nèi)的隱形殺手。其危機(jī)是如果發(fā)生新的病種將面臨無藥可用的局面。越來越多的國家開始尋找抗生素的替代品,而抗菌肽以其獨(dú)特的生物活性和殺菌機(jī)制成為最具潛力的抗生素替代品之一??咕脑谑称?、化妝品領(lǐng)域的應(yīng)用也不斷加深,具有良好的發(fā)展前景。
抗菌肽(antibacterial peptides)是一類具有巨大發(fā)展?jié)摿Φ男滦涂咕幬???咕氖撬拗鳟a(chǎn)生的一類抵抗外界病原體感染的小分子陽離子肽,廣泛存在于昆蟲、植物、動物及人體內(nèi),具有非特異性抗細(xì)菌、真菌、病毒等病原體作用,還有抗腫瘤細(xì)胞作用,因此又稱為肽抗生素(peptide antibitics)??咕目咕V廣,對多重耐藥菌、腫瘤細(xì)胞、艾滋病毒有殺傷作用,甚至還可能有抗重癥急性呼吸綜合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)病毒的作用。因此有著廣闊的開發(fā)應(yīng)用前景,是目前國際學(xué)術(shù)研究的活躍領(lǐng)域之一。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的旨在提供一種抗菌肽Dermaseptin-M及其應(yīng)用。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采取的技術(shù)方案如下:
一種抗菌肽Dermaseptin-M,其氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。
所述抗菌肽Dermaseptin-M在制備抗菌肽制劑中的應(yīng)用。
所述抗菌肽Dermaseptin-M在制備治療革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌和/或病毒感染疾病的藥物中的應(yīng)用。
所述革蘭氏陰性菌為大腸桿菌或綠膿桿菌,所述革蘭氏陽性菌為金黃色葡萄球菌,所述病毒為豬繁殖與呼吸障礙綜合征病毒。
有益效果:通過實(shí)驗(yàn)證明本發(fā)明抗菌肽Dermaseptin-M不但對大腸桿菌,綠膿桿菌,金黃色葡萄球菌等有明顯的抑制作用,而且對病毒也有一定的滅活作用,穩(wěn)定性好,抗菌活性強(qiáng),具有高效廣譜抑菌作用,可以作為抗生素替代品使用。
附圖說明
圖1:發(fā)酵液中Dermaseptin-M蛋白純度鑒定結(jié)果;其中,M為蛋白maker,1,2,3,4均為樣品重復(fù);
圖2:Dermaseptin-M蛋白質(zhì)譜圖。
具體實(shí)施方式
以下結(jié)合具體實(shí)施例對本發(fā)明的技術(shù)方案作進(jìn)一步詳細(xì)說明,但本發(fā)明的保護(hù)范圍并不局限于此。
實(shí)施例1
本發(fā)明抗菌肽的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示,具體為:
Ala-Ser-Trp-Met-Thr-Ser-Phe-Lys-Lys-Val-Leu-Lys-Thr-Pro-Thr-Lys-Thr-Thr-Leu-Asn-Thr-Val-Leu-Val-Gly-Thr-Asn-Ala。
序列特征:序列為氨基酸序列,含有28個氨基酸殘基,鏈型為α螺旋直鏈多肽,分子量大小為 3405 .04Da ,等電點(diǎn)是10.25,疏水殘基46.42%。
本實(shí)施例抗菌肽是發(fā)明人在Dermaseptin基因基礎(chǔ)上通過氨基酸替代增強(qiáng)其多肽抗微生物能力,將改造后Dermaseptin-M基因轉(zhuǎn)入枯草芽孢桿菌,并通過枯草芽孢桿菌發(fā)酵而得;其具體步驟如下:
1. Dermaseptin-M序列合成
Dermaseptin-M是在Dermaseptin序列(如SEQ ID No.2所示):
GCGTTGTGGATGACCTTGTTAAAAAAGGTTCTTAAAGCTGCCGCAAAGGCTGCGCTGAATGCAGTGTTGGTAGGTGCAAATGCT的基礎(chǔ)上,將第37、43、49、52、61、76位堿基G變?yōu)锳,其編碼氨基酸由丙氨酸變?yōu)樘K氨酸,第5、17位T變成C,其氨基酸由亮氨酸變成絲氨酸,即Dermaseptin-M序列為:
GCGTCGTGGATGACCTCGTTAAAAAAGGTTCTTAAAACTGCCACAAAGACTACGCTGAATACAGTGTTGGTAGGTACAAATGCT(如SEQ ID No.3所示)。替代后,其親水性增強(qiáng),更易于表達(dá)。序列委托上海生工公司合成。
2. Dermaseptin-M序列整合入枯草芽孢桿菌
2.1 整合載體的構(gòu)建
將Dermaseptin-M序列按照pUB110載體(購自BioVector質(zhì)粒載體菌種細(xì)胞基因保藏中心)克隆標(biāo)準(zhǔn)操作步驟連接到芽孢桿菌載體pUB110上,得到整合載體pUB110-DM。
2.2 枯草芽孢桿菌基因組的整合
將構(gòu)建好的整合載體pUB110-DM用電轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化至Bacillus subtilis(枯草芽孢桿菌)168 (購自BioVector質(zhì)粒載體菌種細(xì)胞基因保藏中心)感受態(tài),操作步驟如下:
1. 以1:100的比例將10mL Bacillus subtilis(枯草芽孢桿菌)168菌液(市購菌粉用無菌水稀釋而得)倒入1000mL LB液體培養(yǎng)基中,37℃、220rpm振搖2-3小時,每半小時測一次OD,當(dāng)OD值達(dá)到0.3-0.4時,停止培養(yǎng);
2. 將菌液在冰上預(yù)冷30分鐘,隨后將菌液分裝到500mL 冰上預(yù)冷的離心杯中,4℃、2500rpm離心10分鐘;
3. 棄上清,離心杯中加入少量ddH2O,使沉淀懸浮后,再將水注滿離心杯,4℃、4000rpm離心10分鐘;
4. 棄上清,往離心杯中加入少量10%甘油(滅菌,冰上預(yù)冷;甘油與水的體積百分比,下同),重懸菌體,再加滿10%甘油,4℃、4000rpm離心10min;
5. 棄上清,每個離心杯中加入5mL10%的甘油,使沉淀懸浮后,制得感受態(tài);取100 μL感受態(tài)加0.01ng pUB110-DM直接電穿孔轉(zhuǎn)化,用0.05%(g/mL,下同)氯霉素抗性的LB固體培養(yǎng)基篩選陽性轉(zhuǎn)化子。
其中,LB液體培養(yǎng)基的配方:胰蛋白胨 10g/L,酵母提取物 5g/L,NaCl 10g/L;
LB固體培養(yǎng)基的配方:胰蛋白胨 10g/L,酵母提取物 5g/L,NaCl 10g/L、瓊脂15 g/L。
3 枯草芽孢桿菌優(yōu)化表達(dá)
首先應(yīng)用 Plackett-Burman 試驗(yàn)設(shè)計(jì)方法,確定出轉(zhuǎn)速、接種量和總發(fā)酵時間為重要影響因素。通過最陡爬坡法接近最大響應(yīng)面區(qū)域,利用 Box-Behnken 試驗(yàn)設(shè)計(jì),建立了以Dermaseptin-M蛋白含量為響應(yīng)值的全變量二次回歸方程模型,最終得到枯草芽孢桿菌產(chǎn)蛋白酶的最優(yōu)發(fā)酵條件為:
最佳培養(yǎng)基配方:葡萄糖20g,玉米粉10g,大豆粉10g,酵母粉8g,硅油1g,碳酸氫鈣0.5g,氯化鈣0.015g,硫酸銨1g,硫酸鎂0.15g,加水1000 mL,用碳酸氫鈉調(diào)節(jié)pH至7.0,于121℃條件下滅菌20 min。
最佳發(fā)酵條件如下:裝液量為500mL的三角瓶中裝100mL培養(yǎng)基,初始pH值為7.0,接種菌液量為2%(即每100ml液體培養(yǎng)基中加入2mL 濃度為1×108個/mL的枯草芽孢桿菌懸液,枯草芽孢桿菌懸液是指篩選所得陽性轉(zhuǎn)化子經(jīng)肉湯培養(yǎng)基培養(yǎng)并調(diào)整菌落濃度而得),培養(yǎng)溫度為35℃,搖床轉(zhuǎn)速200rpm,總發(fā)酵時間120h。
在搖床條件下,優(yōu)化后此發(fā)酵液的Dermaseptin-M蛋白含量達(dá)974.96mg/mL。
鑒定:
(1)、將發(fā)酵液取樣進(jìn)行SDS-PAGE鑒別其純度,結(jié)果顯示如圖1所示,發(fā)酵液中幾乎沒有雜蛋白片段,只有Dermaseptin-M蛋白,灰度掃描計(jì)算其純度為98.9%;
(2)將發(fā)酵液取樣送于上海中科新生命生物科技有限公司進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,質(zhì)譜結(jié)果見圖2,質(zhì)譜分析見表1;PMF和MS/MS數(shù)據(jù)提交到MASCOT數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索,分類學(xué)檢索為Phyllomedusa sauvagii,結(jié)果顯示,該蛋白與Dermaseptin蛋白相似率為78.57%,即產(chǎn)生了6個突變。結(jié)合圖譜分析,該蛋白序列為 :
Ala-Ser-Trp-Met-Thr-Ser-Phe-Lys-Lys-Val-Leu-Lys-Thr-Pro-Thr-Lys-Thr-Thr-Leu-Asn-Thr-Val-Leu-Val-Gly-Thr-Asn-Ala,與發(fā)明人預(yù)期結(jié)果完全一致,說明該蛋白在枯草芽孢桿菌內(nèi)得到正確表達(dá)。
收集發(fā)酵液離心,5000rpm,取上清凍干,得到淡黃色粉末狀成品即抗菌肽Dermaseptin-M,密封包裝,-20°保存可以保存兩年,4°可以保存6個月。
4. 發(fā)明產(chǎn)品抗菌肽Dermaseptin-M最小抑菌濃度(MIC)的測定
MIC實(shí)驗(yàn)選擇大腸桿菌、綠膿桿菌和金黃色葡萄球菌等臨床常見有害菌進(jìn)行。分別將大腸桿菌(ATCC25922)、綠膿桿菌(ATCC18642)、金黃色葡萄球菌(ATCC25923)用肉湯培養(yǎng)基37℃培養(yǎng)至對數(shù)期,然后用肉湯培養(yǎng)基稀釋至2.0×106 cfu/mL。在青霉素瓶中依次加入稀釋過的抗菌肽水溶液100μL(濃度為0.5、1、2、4、5、10、15、20mg/mL),向各瓶中加入已經(jīng)稀釋好的菌液100 μL?;靹蚝笾糜?7℃恒溫培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)18h,震蕩后測定各瓶菌液在600nm處的吸光度值,以100μg/mL氨芐青霉素水溶液作為陽性對照。其中,肉湯培養(yǎng)基的配方為:蛋白胨 10g/L,牛肉浸出粉 3g/L,氯化鈉5g/L。
結(jié)果判定:以檢測不到細(xì)菌生長的抗菌肽最小濃度孔作為其最小抑菌濃度,結(jié)果如表2所示。
表2可以看出,Dermaseptin-M對大腸桿菌,綠膿桿菌以及金黃色葡萄球菌等臨床常見細(xì)菌都有很強(qiáng)的抑制效果,其中對金黃色葡萄球菌效果最好,綠膿桿菌次之,具有較好的開發(fā)價值。
5. 本發(fā)明產(chǎn)品抗菌肽Dermaseptin-M體外抑制豬繁殖與呼吸障礙綜合征病毒的活性
豬繁殖與呼吸障礙綜合征病毒(PRRSV)是目前困擾養(yǎng)殖業(yè)的一大難題,豬群感染后引起豬的免疫抑制,導(dǎo)致免疫失敗,還會造成豬瘟、大腸桿菌病等多種疫病混合感染或者繼發(fā)感染。本發(fā)明抗菌肽對PRRSV在體外有一定的抑制作用。
本實(shí)驗(yàn)中PRRSV采用HuN4 F112 株弱毒疫苗,購自哈爾濱維科生物技術(shù)有限公司,用生理鹽水將其病毒滴度稀釋至10-7 TCID50/mL,備用。
Marc-145購自中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,按如下步驟復(fù)蘇培養(yǎng):
1.細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行常規(guī)消毒,紫外照射40min以上;
2.培養(yǎng)液(DMEM)、0.25%(g/g,下同)胰蛋白酶溶液恒溫水浴箱37℃預(yù)熱20min,備用;
3.從液氮保存罐中取出細(xì)胞凍存管,立即放入37℃水浴中,快速搖晃,直至凍存液完全融化;
4.將融化后所得細(xì)胞懸液移入15mL離心管,緩慢加入4mL DMEM培養(yǎng)液,離心(1000r/min,5min);
5.用DMEM培養(yǎng)液混懸沉淀細(xì)胞,置于37℃、5% CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。每管細(xì)胞可以復(fù)蘇2-3瓶。
48h后,將長滿細(xì)胞的培養(yǎng)瓶中原來的培養(yǎng)液棄去,加入0.5-1mL 0.25%的胰蛋白酶溶液,使瓶底細(xì)胞都浸入溶液中。放在倒置顯微鏡下觀察細(xì)胞,在原貼壁細(xì)胞逐漸趨于圓形,還未漂起時將胰酶棄去,加入10mL 含1v%小牛血清的DMEM培養(yǎng)液終止消化,用無菌吸管將貼壁細(xì)胞吹打成懸液。
5.1 Dermaseptin-M對Marc145細(xì)胞最大無毒濃度的測定
將Marc-145細(xì)胞懸液接種于96孔板中,每孔0.1mL,每孔接種細(xì)胞個數(shù)2.5×104。每孔加10v%小牛血清DMEM培養(yǎng)液100μL,置于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),12h后觀察細(xì)胞貼壁生產(chǎn)情況。將Dermaseptin-M用DMEM培養(yǎng)液稀釋,濃度分別為0.5、1、2、4、8、16mg/L,待細(xì)胞貼壁后,每孔加DMEM稀釋的Dermaseptin-M 100μL。每4個小時觀察一次,判定各孔存活細(xì)胞的增殖代謝情況及細(xì)胞毒性反應(yīng),不產(chǎn)生細(xì)胞病變的藥物最大濃度視為最大無毒劑量。培養(yǎng)96h,測得抗菌肽 Dermaseptin-M對Marc-145細(xì)胞的最大安全濃度為8mg/L。即當(dāng)抗菌肽 Dermaseptin-M濃度大于8mg/L時,Marc-145細(xì)胞會產(chǎn)生病變。
5.2 體外抗病毒試驗(yàn)
將Marc-145細(xì)胞懸液接種于96孔板中,每孔0.1mL,每孔接種細(xì)胞個數(shù)2.5×104,置于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),48h后細(xì)胞形成單層開始進(jìn)行體外抗病毒試驗(yàn)。
試驗(yàn)分正常細(xì)胞對照組(不接種病毒)、PRRSV對照組(只接種PRRSV 0.1mL,不加藥物)、藥物(替米考星)對照組(20mg/L,用DMEM稀釋)和抗菌肽Dermaseptin-M(DM)組(2、4、6mg/L,DMEM液稀釋)。試驗(yàn)采用同時感染的方式進(jìn)行:將PRRSV病毒液用不含血清的DMEM細(xì)胞培養(yǎng)基稀釋100倍后取100μL,與100μL藥物對照組/DM組處理液在37℃、5% CO2培養(yǎng)箱中作用2h后感染Marc-145細(xì)胞,檢測本發(fā)明抗菌肽對PRRSV的直接滅活作用。
試驗(yàn)采用96孔細(xì)胞培養(yǎng)板進(jìn)行,每個處理重復(fù)10次,當(dāng)PRRSV對照組感染陽性率達(dá)75%、正常細(xì)胞對照組正常時進(jìn)行MTT染色,用酶標(biāo)儀測490nm處吸光度值OD490nm。分別計(jì)算細(xì)胞存活率和DM對PRRSV的抑制率。
細(xì)胞存活率=(實(shí)驗(yàn)組OD490nm/正常細(xì)胞對照組OD490nm)×100%;
抑制率=(實(shí)驗(yàn)組OD490nm-PRRSV對照組OD490nm)/PRRSV對照組OD490nm×100%;
抗菌肽Dermaseptin-M對PRRSV抗性結(jié)果如表3所示。
表3可以看出,3個不同濃度的DM與PRRSV直接作用后再作用于Marc-145細(xì)胞,結(jié)果與PRRSV對照組相比,各組的OD490nm顯著升高(P<0.05),各組細(xì)胞存活率和對PRRSV的抑制率分別為61.93%、75.29%、85.80%和31.71%、60.12%、82.48%,即三個不同濃度的Dermaseptin-M都有抑制PRRSV的作用,各個濃度間的抑制效應(yīng)差異顯著。Dermaseptin-M在高濃度時的吸光度值、細(xì)胞存活率和對PRRSV的抑制率均稍低于替米考星對照組,但差異不顯著(P>0.05)。說明Dermaseptin-M體外可以直接滅活PRRSV,且滅活效果與藥物替米考星相當(dāng)。
綜上,本發(fā)明抗菌肽Dermaseptin-M不僅對畜禽常見致病菌有顯著的抑制作用,對革蘭氏陽性菌和陰性菌都有較好的效果,抗菌譜廣,而且對PRRSV也有一定的滅活作用,所以本發(fā)明抗菌肽具有極大的應(yīng)用潛力,在制備抗菌抗病毒藥物中能夠得到廣泛的應(yīng)用。
SEQUENCE LISTING
<110> 河南牧翔動物藥業(yè)有限公司
河南牧翔科技有限公司
<120> 一種抗菌肽Dermaseptin-M及其應(yīng)用
<130>
<160> 3
<170> PatentIn version 3.4
<210> 1
<211> 28
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 1
Ala Ser Trp Met Thr Ser Phe Lys Lys Val Leu Lys Thr Pro Thr Lys
1 5 10 15
Thr Thr Leu Asn Thr Val Leu Val Gly Thr Asn Ala
20 25
<210> 2
<211> 84
<212> DNA
<213> 未知
<400> 2
gcgttgtgga tgaccttgtt aaaaaaggtt cttaaagctg ccgcaaaggc tgcgctgaat 60
gcagtgttgg taggtgcaaa tgct 84
<210> 3
<211> 84
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
gcgtcgtgga tgacctcgtt aaaaaaggtt cttaaaactg ccacaaagac tacgctgaat 60
acagtgttgg taggtacaaa tgct 84