基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法
【專利摘要】本發明公開了一種基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法，包括以下步驟：A.通過genemapper軟件導入數據樣本；B.對計算機數據庫系統中的所有樣本進行XY/XX讀取并分為男性樣本和女性樣本；C.將指定的子代樣本分別與計算機數據庫系統中男性樣本和女性樣本進行二聯體檢索，篩選出符合二聯體親權關系的假定父和假定母；再進行二聯體親權計算，得出疑似父母；D.將疑似父、母以及指定子代樣本按照三聯體計算方法計算出與指定子代樣本符合三聯體親權關系的生物學父母。本發明能夠方便找出符合親權關系的父母，降低單親檢索假陽性的樣本量，提高親權判定準確度以及可靠性。
【專利說明】基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法
【技術領域】
[0001] 本發明涉及法醫遺傳學【技術領域】，特別是一種利用計算機數據庫對親權鑒定過程 中的三聯體樣本進行檢索的方法。
【背景技術】
[0002] 親權鑒定是指通過對人類遺傳標記的檢測，根據遺傳規律分析，判定父母與孩子 間是否為親生關系。親權鑒定一般分為二聯體親權鑒定和三聯體親權鑒定，二聯體親權鑒 定是指被檢測男子與孩子之間的親子關系鑒定，三聯體親權鑒定是指被檢測男子、孩子生 母與孩子之間的親子關系鑒定。
[0003] 近年來，隨著計算機的普及，警方及地方的大型DNA法醫物證實驗室都建立了計 算機數據庫系統，用于樣本的數據存儲以及個體識別和親權鑒定的檢索，因此計算機數據 庫系統的建立在尋找被拐賣兒童以及查找犯罪份子方面發揮的作用越來越大。然而，由于 中國人口基數大，而法醫物證初期使用DNA進行檢測的時候所用的基因座數量較少，并且 不同的實驗室選用的試劑盒不一致，這就造成除了國家規定的必檢基因座以外還存在著不 同的基因座。當計算機數據庫系統中存儲有大量的樣本DNA數據時，利用父親或者母親數 據進行檢索時會出現數十個或者幾十個樣本都符合孟德爾遺傳定律的情況。在這種情況下 計算機便無法對親代和子代的關系進行有效的判定，需要人工干預證實。此時，便需要實驗 室增加被檢索樣本的檢測基因座，或者加入生母或者父親的樣本，人工進行三聯體計算，排 除假陽性樣本；不僅增加了成本，而且操作繁瑣、工作量大、耗時長且容易出錯。
【發明內容】
[0004] 本發明需要解決的技術問題是提供一種基于計算機數據庫系統的親權鑒定中三 聯體樣本檢索的方法，從而方便找出符合親權關系的父母，降低單親檢索假陽性的樣本量， 提高親權判定準確度以及可靠性。
[0005] 為解決上述技術問題，本發明所采取的技術方案如下。
[0006] 基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法，包括以下步驟： A. 通過genemapper軟件導入指定的子代樣本以及與指定的子代樣本相關的數據樣 本； B. 對計算機數據庫系統中的所有樣本進行XY/XX讀取，將樣本分為男性樣本和女性樣 本； C. 將指定的子代樣本分別與計算機數據庫系統中男性樣本和女性樣本進行二聯體檢 索，篩選出符合二聯體親權關系的m個假定父和η個假定母；將指定子代樣本分別與m個假 定父和η個假定母進行二聯體親權計算，得到ml個疑似父和nl個疑似母；其中ml < m，nl < η ； D. 將ml個疑似父、nl個疑似母以及指定子代樣本按照三聯體計算方法計算出與指定 子代樣本符合三聯體親權關系的生物學父、母。
[0007] 本發明步驟C中所述的二聯體計算方法為：按照二聯體親權指數計算公式以及計 算機數據庫系統中設定的基因頻率分別計算出指定子代樣本與每個假定父的親權指數值 和每個假定母的親權指數值，最后分別篩選出符合遺傳規律的疑似父和疑似母；所述二聯 體親權指數計算公式為：
【權利要求】
1. 基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法，其特征在于包括以下步驟： A. 通過genemapper軟件導入指定的子代樣本以及與指定的子代樣本相關的數據樣 本； B. 對計算機數據庫系統中的所有樣本進行XY/XX讀取，將樣本分為男性樣本和女性樣 本； C. 將指定的子代樣本分別與計算機數據庫系統中男性樣本和女性樣本進行二聯體檢 索，篩選出符合二聯體親權關系的m個假定父和η個假定母；將指定子代樣本分別與m個假 定父和η個假定母進行二聯體親權計算，得到ml個疑似父和nl個疑似母；其中ml < m，nl < η ； D. 將ml個疑似父、nl個疑似母以及指定子代樣本按照三聯體計算方法計算出與指定 子代樣本符合三聯體親權關系的生物學父、母。
2. 根據權利要求1所述的基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法，其特征在于步 驟C中所述的二聯體計算方法為：按照二聯體親權指數計算公式以及計算機數據庫系統中 設定的基因頻率分別計算出指定子代樣本與每個假定父的親權指數值和每個假定母的親 權指數值，最后分別篩選出符合遺傳規律的疑似父和疑似母；所述二聯體親權指數計算公 式為：
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3. 根據權利要求1所述的基于計算機數據庫系統的親權鑒定檢索方法，其特征在于步 驟D中所述的三聯體計算方法為：根據步驟C獲得的符合遺傳規律的疑似父、疑似母以及指 定子代樣本按照三聯體親權計算公式進行計算，并結合步驟C獲得的親權指數值篩選出符 合遺傳定律的生物學父母；所述三聯體親權計算公式為：
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【文檔編號】G06F17/30GK104112023SQ201410368913
【公開日】2014年10月22日 申請日期:2014年7月30日 優先權日:2014年7月30日
【發明者】譚笑丹 申請人:譚笑丹