專利名稱:一段淋球菌dna序列的特異性確定及其應用的制作方法
技術領域:
本發明涉及一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)DNA序列的特異性確定及其應用,屬于生物醫學技術領域。
本發明的技術方案為本發明利用現有的方法確定了長度為197bp的一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)特異DNA序列及其PCR引物,用引物進行PCR擴增,其序列如下1 gctaaattg cggattggaa aattttgaaa taagaacccc tatcgggctg ttatctgatt61 agggttattt tgacatagtt gtatcatctt aaaaacaagc atacaatctg caaatcttag121 acaaagcaaa acccccgcca aacgccaatc tgcacggggg tttcgagata caacatgagc181 caattataca cccaacccg引物序列為1.5’-gctaaattgcggattggaaa-3’2.5’-cgggttgggtgtataattgg-3’上述的淋球菌特異DNA序列作為基因芯片診斷的探針及PCR擴增檢測序列,用于淋球菌的臨床診斷。
本發明具有檢測方法快速且準確,操作簡便,成本低等優點。
圖2、圖2續是測序圖。其中圖2是測定的序列、圖2續是原始測序圖譜。
圖3是用Blast軟件對PCR擴增產物的測序結果與預計序列的比較分析。
圖4、圖4續是基因數據庫中Blast搜索結果。
圖5.基因芯片雜交結果。
本發明可用于PCR方法或基因芯片方法進行淋球菌的臨床檢測。用本發明提供的序列進行PCR擴增,根據PCR方法獲得產物是否出現和大小判斷是否為淋球菌感染。也可用本序列為探針,作為基因芯片中的一個檢測位點,然后用本發明中的PCR引物序列擴增臨床標本,并標記后進行雜交檢測。
權利要求
1.一段淋球菌DNA序列的特異性確定,其特征在于長度為197bp,用引物進行PCR擴增,其序列如下1gctaaattg cggattggaa aattttgaaa taagaacccc tatcgggctg ttatctgatt61 agggttattt tgacatagtt gtatcatctt aaaaacaagc atacaatctg caaatcttag121 acaaagcaaa acccccgcca aacgccaatc tgcacggggg tttcgagata caacatgagc181 caattataca cccaacccg引物序列為1.5’-gctaaattgcggattggaaa-3’2.5’-cgggt tgggtgtataat tgg-3’
2.一段淋球菌DNA序列的應用,其特征在于該序列作為用于診斷淋球菌的特異序列的基因芯片及探針的檢測位點進行雜交檢測。
全文摘要
本發明涉及一段淋球菌DNA序列的特異性確定及其應用,屬于生物醫學技術領域。本發明通過基因數據庫資料的搜尋和分析,確定了一段淋球菌DNA序列的特異性及PCR擴增引物,該序列長度為197bp。通過對人類生殖道淋球菌感染標本的PCR擴增,克隆,獲得該序列,測序證明與預計序列一致。再經生物信息學方法分析,基因芯片雜交分析,結果證實了該序列對于淋球菌的特異性。本發明作為基因芯片診斷的探針及PCR擴增檢測序列,用于淋球菌的診斷。本發明具有檢測方法快速且準確,操作簡便,成本低等優點。
文檔編號C12P19/34GK1436852SQ0211337
公開日2003年8月20日 申請日期2002年2月9日 優先權日2002年2月9日
發明者譚德勇, 朱寶生 申請人:昆明寰基生物芯片開發有限公司