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豬藍耳病病毒rt-pcr快速檢測試劑盒的制作方法

文檔序號:563742閱讀:331來源:國知局
專利名稱:豬藍耳病病毒rt-pcr快速檢測試劑盒的制作方法
技術領域
本發明涉及獸醫生物技術領域的診斷技術,具體是一種檢測豬藍耳病病毒的診斷方法和 專用試劑盒。
背彔技術
豬藍耳病,也稱為豬繁殖與呼吸綜合征(porcine reproductive and respiratory syndrome, PRRS)是由豬藍耳病病毒(PRRSV)引起的一種豬的傳染病,其臨診特征為各種年齡的豬均 可感染,病豬厭食、嗜睡、體溫升高,妊娠母豬發生早產、流產、死胎、弱胎和木乃伊胎, 種公豬性功能下降,仔豬和育肥豬呼吸障礙。其特征性病理變化為間質性肺炎,皮膚發紺。 l訴7年該病首次報道于美國,隨后迅速蔓延北美、歐洲及亞洲各國,目前也是我國最主要的 豬群疫病之一。PRRS與其它引起豬繁殖障礙的疾病存在著非常類似的臨診癥狀,沒有示病性 臨床癥狀,根據臨床癥狀進行診斷及鑒別診斷比較困難。實驗室診斷方面,國內外已建立了 一些常規的檢測方法,如病毒的分離與鑒定、間接ELISA、 IPMA、 IFA及Dot - ELISA等血 清學方法用于該病診斷。在這些診斷方法中,特異性、敏感性、操作技術等方面存在各種各 樣的問題,不能滿足生產需要。由于該病特殊的免疫機理,疫苗免疫效果的不確定性,對養豬 業的威脅將時長期存在,因此,淘汰病原學陽性豬是該病防疫中主要措施,建立病原學快速 檢測技術非常重要。

發明內容
本發明根據豬藍耳病病毒(PRRSV)美洲型標準毒株((ATCC VR—2332)的ORF6及部分 ORF7的序列,設計一對豬藍耳病病毒特異性擴增引物,結合先進的病毒核酸提取技術和高 效RT-PCR商品試劑,經實驗條件優化,組合而成的一種成熟的一步法RT-PCR檢測試劑盒。 該試劑盒能對待檢組織進行直接檢測,檢測過程簡單,抗污染性強。從病料處理到獲得結果 只需4小時,結果準確且靈敏度高、特異性好,是目前豬藍耳病病毒檢測方法非常好的一種 替代方法。
本發明的主要技術方案有
1.引物設計根據豬藍耳病病毒(PRRSV)美洲型標準毒株((ATCCVR-2332)的ORF6及 部分ORF7的序列,設計一對豬藍耳病病毒特異性擴增引物,引物詳細為
Primer PI: 5,一 CACTACGGTCAACGGCACAT—3,
Primer P2: 5,一 CCACAGTGTAACTTATCCTCCCT—3,
其中PrimerPl/P2引物對在豬藍耳病病毒核酸中特異性擴增出402bp的產物。
2. 待檢病料的核酸提取采用RNA快速提取方法提取待檢組織樣品的RNA核酸。
3. RT-PCR體系AMV/Tfl 5xReaction Buffer 2.5/xL, 25mM/L MgS04 1/*L, 10mM/L dNTP
0. 5.tL, AMV Rever Transcriptase 2.5u, Tfl DNA Polymerase 2,5u 20uM/L Primer PI l/tL, 20uM/L Primer P2 1/iL,待檢RNA模板5/iL,加水至總體積25/iL。
4. RT-PCR程序45r逆轉錄45min; 94X:預變性2min; 94"30s、 55"C45s、 68XM5s, 35個循環;最后68^C延伸8min。 4匸保存。
本發明試劑盒組成及保存
Sloution R2 6mL x 1管 室溫儲存
Wash buffer 12mLxi管 室溫儲存
Elution buffer lmLx 1管 室溫儲存 Spin columns 10個 室溫儲存
RNaseFree離心管20個 室溫儲存 RT-PCR體系 20pLxlO管-20X:儲存,避免反復凍融。
陽性對照 lipLxl管 -20匸儲存,避免反復凍融。
RNase Free H20lmL x 1管 -20"儲存 本試劑盒有效期6個月。 本發明的優點
1. 操作簡單,抗污染性強,耗時短。本方法采用了先進的病毒核酸提取技術,操作 簡單,可操作性強,并省去了以往抽提核酸過程中的多步驟、多試劑抽提,從而減 少了污染,保證了檢測結果的準確度;同時,采用的高效RT-PCR商品試劑,實現了 一步法檢測,比常用的二步法RT-PCR省時省力,同時也避免了二步法RT-PCR過程 中加樣所造成的PCR污染。
2. 特異性強、重復性好、靈敏度高。本試劑盒僅對豬藍耳病病毒的核酸有擴增產物, 對豬偽狂犬病病毒、圓環病毒、乙型腦炎、豬瘟病毒、未接種PRRSV的正常細胞培 養液的核酸無擴增產物;對豬藍耳病弱毒疫苗株和豬藍耳病病毒陽性病料的檢測結 果重復性100%;對經104倍稀釋的臨床陽性病料的核酸提取液有穩定準確的檢測結 果。


圖1、引物Primer PI 、 PrimerP2的序列
圖2、試劑盒同時對豬偽狂犬病病毒(l泳道)、圓環病毒(2泳道)、乙型腦炎(3泳道)、豬 瘟病毒(4泳道)、未接種PRRSV的正常細胞培養液(5泳道)、PRRSV弱毒疫苗株(6 泳道)、滅菌水(7泳道)進行檢測的電泳結果,M泳道為DNADL2000Marker (2000bp、 1000bp、 750bp、 500bp、 250bp、 100bp)
圖3、本試劑盒對部分樣品的檢測結果圖
本發明的
具體實施例方式
1. 樣品制備
1.1組織樣品剪取待檢組織0.5g置研磨器中剪碎并研磨,加入L5mLPBS (pH7.2)繼續研 磨;將研磨好的待檢組織液,置1.5mL滅菌離心管中,5000rpm離心l~2min,取上清100/iL 進行核酸提取。
1.2血清樣品直接取100/tL進行核酸提取。 1.3陽性對照直接取100ML進行核酸提取。 1.4陰性對照直接取100j^LRNase Free H20進行核酸提取。
2. 操作步驟
2.1在100/iL處理好的樣品中,加入Sloution R2溶液600/*L,充分顛倒混勻,室溫靜置3~5min。 2.2吸取上清液至Spin column, Spin column要套上離心管,12000rpm離心30s。 2.3棄去外套管中的液體,向Spin column中加入600/*L Wash buffer, 12000rpm離心30s。 2.4重復2.3。 12000rpm離心2min。
2.5將Spin column移入新的RNase Free離心管內,在膜中央加入Elution buffer 3O~50/iL,室
溫靜置2 3min, 12000rpm離心2min,獲得樣品總RNA。
2.6取5/iL樣品RNA,加入至RT-PCR體系中,混勾,6000rpm離心30s。
2.7置于PCR儀中,進行如下程序45C逆轉錄45min; 94"C預變性2min; 94*C30s、 55"45s、
68XM5s, 35個循環;最后68X:延伸8min。 4'C保存。
2.8取8/iLPCR產物,混合1^L上樣緩沖液,1 1.5。/。的瓊脂糖凝膠電泳分析PCR產物,以 DNA分子量Marker為參考。
2.9在陰性對照無產物、陽性對照有明顯402bp條帶的前提下,樣品出現402bp大小條帶定 為PRRSV核酸陽性。
權利要求
1.一對豬藍耳病病毒(豬繁殖與呼吸綜合征病毒,porcine reproductive and respiratorysyndrome virus,PRRSV)特異性檢測引物Primer P1/P2,其序列為Primer P15’-CACTACGGTCAACGGCACAT-3’Primer P25’-CCACAGTGTAACTTATCCTCCCT-3’其中Primer P1/P2引物對在豬藍耳病病毒核酸中特異性擴增出402bp的產物。
2. 利用權利要求1所述引物組成的豬藍耳病病毒快速檢測試劑盒,其特征為采用RNA快速提取方法提取待檢組織樣品的RNA核酸,按如下RT-PCR反應體系和擴增 程序,用Primer Pl/P2引物對進行豬藍耳病病毒的RT-PCR擴增檢測。RT-PCR體系AMV/Tfl 5xReaction Buffer 2.5/iL, 25mM/L MgS04 1/iL, 10mM/L dNTP 0,5/xL, AMV Rever Transcriptase 2.5u, Tfl DNA Polymerase 2.5u, 20uM/L Primer PI l;iiL, 20uM/L Primer P2 l^L,待檢RNA模板5;xL,加水至總體積25/iL。RT-PCR擴增程序:45。C逆轉錄45min; 94'C預變性2min; 94'C30s、 55。C45s、 68。C45s, 35個循環;最后68t:延伸8min。 4'C保存。電泳檢測取8ptLPCR產物,混合1mL上樣緩沖液,1 1.5%的瓊脂糖凝膠電泳分析pcr 產物,以DNA分子量Marker為參考。結果判斷在陰性對照無條帶、陽性對照有明顯402bp條帶的前提下,樣品出現402bp大 小條帶定為豬藍耳病病毒核酸陽性,否則判為陰性。
全文摘要
本發明根據豬藍耳病病毒(PRRSV)美洲型標準毒株(ATCC VR-2332)的ORF6及部分ORF7的序列,設計一對豬藍耳病病毒特異性擴增引物,結合先進的病毒核酸提取技術和高效RT-PCR商品試劑,經實驗條件優化,組合而成的一種成熟的一步法RT-PCR檢測試劑盒。該試劑盒能對待檢組織進行直接檢測,檢測過程簡單,抗污染性強。從病料處理到獲得結果只需4小時,結果準確且靈敏度高、特異性好,是目前豬藍耳病病毒檢測方法非常好的一種替代方法。
文檔編號C12Q1/68GK101343669SQ200810032140
公開日2009年1月14日 申請日期2008年8月25日 優先權日2008年8月25日
發明者何世成, 劉道新, 李曉成, 范仲鑫, 談志祥, 邱伯根, 邱立新, 杰 陳, 魯杏華 申請人:湖南省獸醫總站
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