高效全血基因組dna提取方法
【專利摘要】本發明涉及一種快速、高效全血基因組DNA提取方法,屬于核酸純化領域。首先向全血中加入紅細胞裂解液,渦旋,直至紅細胞完全裂解,棄上清,吸干殘留液體。加入白細胞裂解液和蛋白酶K,37oC水浴裂解白細胞,直至沉淀溶解。加入氯化鈉和氯仿,離心分離DNA,并將上清液轉移至另一潔凈的EP管中。加入醋酸銨和冰乙醇沉淀DNA,75%乙醇洗滌后自然干燥,加入TE溶解得到DNA。本發明方法具有快速、高效和無毒的特點。所提取的DNA可用于聚合酶鏈反應(PCR)、甲基化檢測、基因克隆等多種后續分子生物學研究。
【專利說明】高效全血基因組DNA提取方法
[0001]
【技術領域】
[0002]本發明涉及一種快速、高效全血基因組DNA提取方法,屬于核酸純化領域。
【背景技術】
[0003]目前,分子生物學理論和技術發展十分迅速,已經與生物學、醫學、遺傳學和動物學等多個學科密切結合,獲得高純度和完整的基因組DNA是進行后續分子生物學研究的基礎,是其它研究工作的前提。外周血可作為造血系統疾病研究中分子標志,以及用于體外診斷系統的開發,還可用于血液系統外眾多系統疾病的分子監測。從外周血中提取DNA,進行核酸水平的研究是臨床分子生物學重要的研究手段。
[0004]在遺傳性疾病和腫瘤以及心腦血管病等研究中,可以利用外周血作為生物材料,檢測患病個體與正常健康個體之間的DNA差異,例如DNA甲基化分析和基因突變檢測。尋找快速、經濟的DNA提取方法是群體分子生物學實驗面臨的首要問題。然而,從血液中提取DNA面臨的難題之一是DNA易受到多種物質的污染,使得DNA純度下降,致使實驗結果準確性降低。有些傳統的外周血DNA提取方法使用飽和酚等有害物質,且操作復雜,過程繁瑣,用時過長;開放的自動化DNA提取裝置,雖然不再使用飽和酚等有害物質,操作過程也相對比較簡單,但所用儀器和試劑極為昂貴,不適用于普通實驗室大規模DNA的提取。
【發明內容】
[0005]本發明的目的在于提供一種快速、高效提取全血基因組DNA方法,保證提取出的基因組DNA完整,并使提取過程高效、快速、無毒。
[0006]為實現上述目的,本發明采用的技術方案是:
一種高效全血基因組DNA提取方法,包括以下步驟:
(1)按全血:紅細胞裂解液=1:1的體積比,向EP管中的全血中加入紅細胞裂解液,渦旋2分鐘后靜置5分鐘以上,直至溶液澄清透明,然后對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,離心時間為2分鐘,棄去上清液;
(2)向步驟(1)的EP管中再加入占全血體積1/3的紅細胞裂解液,渦旋I分鐘,直至沉淀完全散開,然后對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,棄去上清液;重復本步驟一次,并用吸水紙吸干殘留液體;
(3)向步驟(2)的EP管中加入占全血體積1/3的白細胞稀釋液,另加入占全血體積1/600的蛋白酶K,混勻,37°C水浴60-90分鐘,直至沉淀完全溶解;
(4)向步驟(3)的EP管中分別加入占全血體積1/12的5摩爾/升氯化鈉溶液和占全血體積2/3的氯仿,充分搖勻,然后對溶液進行離心分離,離心轉速為12000轉/分鐘,離心時間為5分鐘,將上層液體轉移至另一潔凈的EP管中;
(5)向步驟(4)的潔凈的EP管中加入占管內溶液I/ 10體積的醋酸銨溶液和2倍體積的冰乙醇,充分搖勻,沉淀DNA,然后對溶液進行離心分離,離心分離的轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,棄去上清液;
(6)向步驟(5)的潔凈的EP管中加入占全血體積1/3的75%乙醇,對DNA沉淀洗滌,然后進行離心分離,轉速為12000轉/分,離心時間為I分鐘,棄去上清液;重復本步驟兩次;
(7)將步驟(6)的潔凈的EP管倒立放置在放有吸水紙的水平實驗臺上,自然干燥5分
鐘;
(8)向步驟(7)的潔凈的EP管中加入與全血同等體積的TE緩沖液,溶解DNA沉淀。
[0007]采用上述技術方案的本發明,與現有技術相比,其優點是:
①本發明個步驟中涉及的離心時間、離心機轉速,使全血中基因組DNA的提取過程具有高效、快速、簡便的特點;
②本發明整個過程不需要使用有毒的苯酚的試劑,且所有試劑成本較低,使整個過程不僅安全可靠,而且比較經濟;
②使用本發明方法純化的基因組DNA完整性好,純度高,可用于聚合酶鏈反應(PCR)、實時定量熒光聚合酶鏈反應(Real Time PCR)、芯片分析、分子克隆等分子生物學實驗。
[0008]作為優選,本發明更進一步的技術方案是:
所述紅細胞裂解液中各組分的配方為:
Tris-HCl (PH7.6 或 8.0)0.01M
Sucrose320mM
MgCl25mM
TritonXlOO1%。
[0009]所述白細胞裂解液中各組分的配方為:
Tris-HCl (PH7.6 或 8.0)0.01M
EDTA (PH8.0)4mM
SDS0.2%
NaCl50mM。
·[0010]所述TE緩沖液中各組分的配方為:
Tris-HCl (PH7.6*8.0)IM
EDTA (ΡΗ8.0)0.5Μ。
【具體實施方式】
[0011]下面結合實施例對本發明作進一步說明,目的僅在于更好地理解本
【發明內容】
。因此,所舉之例并不限制本發明的保護范圍。
[0012]實施例1:從人的全血中提取DNA。
[0013](I)向600微升人全血中加入紅細胞裂解液600微升,加入的體積比為全血:紅細胞裂解液=1:1,渦旋2分鐘,靜置5分鐘以上,直至溶液澄清透明。對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,離心時間為2分鐘,棄去上清液。其中紅細胞裂解液按下述方法制備:取 IOmllMTris-HCl (ΡΗ7.6),109.54g Sucrose,1.0lg MgCl2,加 IOml TritonX 100,力卩水至800ml,溶解定容至1000ml。
[0014](2)向步驟(1)的EP管中加入200微升的紅細胞裂解液,渦旋I分鐘,直至沉淀完全散開。對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,棄上清。重復一次,并用吸水紙吸干殘留液體。
[0015](3)向步驟(2)的EP管中加入200微升白細胞稀釋液,I微升蛋白酶K,混勻,37°C水浴60-90分鐘,直至沉淀完全溶解。其中白細胞裂解液按下述方法制備:加IOmlIMTris-HCl (PH7.6), 8ml 0.5 M EDTA, 20ml 10% SDS, IOml 5M NaCl,定容至 1000ml。
[0016](4)向步驟(3)的EP管中加入50微升5摩爾/升氯化鈉溶液和400微升氯仿,充分搖勻。對溶液進行離心分離,離心轉速為12000轉/分鐘,離心時間為5分鐘。將上層液體轉移至另一潔凈EP管中。
[0017](5 )向步驟(4)的EP管中加入I / 10體積醋酸銨溶液和2倍體積冰乙醇,充分搖勻,沉淀DNA。對溶液進行離心分離,離心分離的轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,
棄上清。
[0018](6)向步驟(5)的EP管中加入200毫升75%乙醇,對DNA沉淀洗滌,于12000轉/
分離心I分鐘,棄上清。重復兩次。
[0019](7)將步驟(6)的EP管倒立放置與放有吸水紙的水平實驗臺上,自然干燥5分鐘。
[0020](8)加入600微升TE溶解DNA沉淀。其中TE緩沖液按下述方法制備:取IOml IMTris-HCl (PH8.6), 2ml 0.5 M EDTA,加水至 1000ml。
[0021]依照實施例1所述方法從600微升人全血中提取的DNA,通過其1%瓊脂糖凝膠電泳檢測發現DNA在23130bp處有一條單一亮條帶。
[0022]實施例2:從小鼠的全血中提取DNA。
[0023](I)向600微升小鼠全血中加入紅細胞裂解液600微升,加入的體積比為全血:紅細胞裂解液=1:1,渦旋2分鐘,靜置5分鐘以上,直至溶液澄清透明。對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,離心時間為2分鐘,棄去上清液。其中紅細胞裂解液,其制備方法是:取 IOmllMTris-HCl (PH7.6), 109.54g Sucrose,1.0lg MgCl2,加 IOml TritonXlOO,加水至800ml,溶解定容至1000ml。
[0024](2)向步驟(1)的EP管中加入200微升的紅細胞裂解液,渦旋I分鐘,直至沉淀完全散開。對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,棄上清。重復一次,并用吸水紙吸干殘留液體。
[0025](3)向步驟(2)的EP管中加入200微升白細胞稀釋液,I微升蛋白酶K,混勻,37°C水浴60-90分鐘,直至沉淀完全溶解。其中白細胞裂解液,其制備方法是:加IOmlIMTris-HCl (PH7.6), 8ml 0.5 M EDTA, 20ml 10% SDS, IOml 5M NaCl,定容至 1000ml。
[0026](4)向步驟(3)的EP管中加入50微升5摩爾/升氯化鈉溶液和400微升氯仿,充分搖勻。對溶液進行離心分離,離心轉速為12000轉/分鐘,離心時間為5分鐘。將上層液體轉移至另一潔凈EP管中。
[0027](5 )向步驟(4)的EP管中加入1 / 10體積醋酸銨溶液和2倍體積冰乙醇,充分搖勻,沉淀DNA。對溶液進行離心分離,離心分離的轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,
棄上清。
[0028](6)向步驟(5)的EP管中加入200毫升75%乙醇,對DNA沉淀洗滌,于12000轉/
分離心I分鐘,棄上清。重復兩次。
[0029](7)將步驟(6)的EP管倒立放置與放有吸水紙的水平實驗臺上,自然干燥5分鐘。[0030](8)加入600微升TE溶解DNA沉淀。其中TE緩沖液,其制備方法是:取IOml IMTris-HCl (PH8.6), 2ml 0.5 M EDTA,加水至 1000ml。[0031]依照實施例2所述方法從從600微升小鼠全血中提取的DNA,通過其1%瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA在23130bp處有一條單一較亮帶。
【權利要求】
1.一種高效全血基因組DNA提取方法,其特征在于,包括以下步驟: (1)按全血:紅細胞裂解液=1:1的體積比,向EP管中的全血中加入紅細胞裂解液,渦旋2分鐘后靜置5分鐘以上,直至溶液澄清透明,然后對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,離心時間為2分鐘,棄去上清液; (2)向步驟(1)的EP管中再加入占全血體積1/3的紅細胞裂解液,渦旋I分鐘,直至沉淀完全散開,然后對溶液進行離心分離,轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,棄去上清液;重復本步驟一次,并用吸水紙吸干殘留液體; (3)向步驟(2)的EP管中加入占全血體積1/3的白細胞稀釋液,另加入占全血體積1/600的蛋白酶K,混勻,37°C水浴60-90分鐘,直至沉淀完全溶解; (4)向步驟(3)的EP管中分別加入占全血體積1/12的5摩爾/升氯化鈉溶液和占全血體積2/3的氯仿,充分搖勻,然后對溶液進行離心分離,離心轉速為12000轉/分鐘,離心時間為5分鐘,將上層液體轉移至另一潔凈的EP管中; (5)向步驟(4)的潔凈的EP管中加入占管內溶液I/ 10體積的醋酸銨溶液和2倍體積的冰乙醇,充分搖勻,沉淀DNA,然后對溶液進行離心分離,離心分離的轉速為4000轉/分鐘,分離時間為I分鐘,棄去上清液; (6)向步驟(5)的潔凈的EP管中加入占全血體積1/3的75%乙醇,對DNA沉淀洗滌,然后進行離心分離,轉速為12000轉/分,離心時間為I分鐘,棄去上清液;重復本步驟兩次; (7)將步驟(6)的潔凈的EP管倒立放置在放有吸水紙的水平實驗臺上,自然干燥5分鐘; (8)向步驟(7)的潔凈的EP管中加入與全血同等體積的TE緩沖液,溶解DNA沉淀。
2.如權利要求1所述的高效全血基因組DNA提取方法,其特征在于,所述紅細胞裂解液中各組分的配方為: Tris-HCl (ΡΗ7.6*8.0)0.01M Sucrose320mMMgCl25mM TritonXlOO1%。
3.如權利要求1所述的高效全血基因組DNA提取方法,其特征在于,所述白細胞裂解液中各組分的配方為: Tris-HCl (PH7.6 或 8.0)0.01M EDTA (PH8.0)4mM SDS0.2% NaCl50mM。
4.如權利要求1所述的高效全血基因組DNA提取方法,其特征在于,所述TE緩沖液中各組分的配方為: Tris-HCl (PH7.6*8.0)IM EDTA (ΡΗ8.0)0.5Μ。
【文檔編號】C12N15/10GK103571826SQ201310593112
【公開日】2014年2月12日 申請日期:2013年11月23日 優先權日:2013年11月23日
【發明者】張雪梅, 張志 , 曹蕾 申請人:河北聯合大學