一種青光眼的篩查試劑盒的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了檢測ABCA1基因上31個(gè)SNP位點(diǎn)的試劑在制備檢測青光眼的試劑中的用途，還公開了青光眼檢測試劑盒。本發(fā)明試劑盒可用于青光眼的輔助性診斷，還可用于個(gè)體青光眼疾病的抗性和易感性評(píng)估。
【專利說明】一種青光眼的篩查試劑盒

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及SNP領(lǐng)域，特別涉及與青光眼相關(guān)的SNP。

【背景技術(shù)】
[0002]青光眼是全世界主要的致盲原因，它是以視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞死亡為特征。在大多數(shù)人群中，原發(fā)性開角型青光眼(POAG，MIM137760)是原發(fā)性青光眼的主要類型。POAG可以被分為高眼壓型青光眼(HTG)和正常眼壓型青光眼(NPG)。POAG可以由單個(gè)基因突變引起，該種類型符合孟德爾遺傳規(guī)律；但多數(shù)POAG是散發(fā)的，由多個(gè)基因的遺傳變異和環(huán)境因素共同引起。目前已鑒定出五個(gè)基因一MY0C(編碼肌纖蛋白)，OPTN(編碼視神經(jīng)蛋白)，WDR36(編碼WD重復(fù)結(jié)構(gòu)域)，TBKl (TANK結(jié)合激酶I)和ASBlO (encoding錨蛋白重合和SOCS盒基因10)能引起單基因遺傳的P0AG。然而這五個(gè)基因的突變只能解釋5%-6%的原發(fā)性開角型青光眼的發(fā)病，而大多數(shù)患者的發(fā)病仍無法解釋。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0003]為了解決上述問題，本發(fā)明提供了一種新的青光眼的篩查試劑盒。
[0004]本發(fā)明提供了檢測ABCAl基因rs2487032變異、rs2472519變異、rs2472459變異、rs2164560 變異、rsl2555462 變異、rs2472511 變異、rs2422493 變異、rs2487042 變異、rs2472495 變異、rs4397467 變異、rsll25873 變異、rs715119 變異、rs2487052 變異、rs2472493 變異、rs2487048 變異、rs2027400 變異、rs2472509 變異、rsl800977 變異、rs2246293 變異、rs25156 18 變異、rs7023634 變異、rsl2553329 變異、rs2437817 變異、rs3887137 變異、rs2487046 變異、rs2472496 變異、rsl800976 變異、rs2472516 變異、rs2043664變異、rs2487034變異、或/和rs2487031變異的相關(guān)試劑在制備青光眼篩查試劑中的用途。
[0005]所述試劑包括檢測ABCAl基因rs2487032變異A — G、rs2472519變異A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑。
[0006]所述的試劑還包括任選的用于擴(kuò)增包含ABCAl基因rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs247251U rs2422493、rs2487042、rs2472495、rs4397467、 rsll25873、 rs715119、 rs2487052、 rs2472493、 rs2487048、 rs2027400、rs2472509、rsl800977、rs2246293、rs2515618、rs7023634、rsl2553329、rs2437817、rs3887137、rs2487046、rs2472496、rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和rs2487031變異的基因片段的試劑。
[0007]其中，所述檢測ABCAl 基因 rs2487032 變異 A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為Snapshot用試劑。
[0008]所述檢測ABCAl 基因 rs2487032 變異 A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034 變異 G — A、或 / 和rs2487031變異C — T的試劑為DNA測序用試劑、實(shí)時(shí)熒光定量PCR法用試劑、變性高效液相色譜分析法用試劑、等位基因特異擴(kuò)增法用試劑、雜交法用試劑、質(zhì)譜法用試劑、限制性片段長度多態(tài)性分析法用試劑或單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析法用試劑。
[0009]本發(fā)明青光眼的篩查試劑盒，它包括任選的用于檢測ABCAl基因rs2487032變異、rs2472519 變異、rs2472459 變異、rs2164560 變異、rsl2555462 變異、rs2472511 變異、rs2422493 變異、rs2487042 變異、rs2472495 變異、rs4397467 變異、rsll25873 變異、rs715119 變異、rs2487052 變異、rs2472493 變異、rs2487048 變異、rs2027400 變異、rs2472509 變異、rsl800977 變異、rs2246293 變異、rs2515618 變異、rs7023634 變異、rsl2553329 變異、rs2437817 變異、rs3887137 變異、rs2487046 變異、rs2472496 變異、rsl800976 變異、rs2472516 變異、rs2043664 變異、rs2487034 變異、或 / 和 rs2487031 變異的相關(guān)試劑。
[0010]所述的試劑包括檢測ABCAl基因rs2487032變異A — G、rs2472519變異A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑。
[0011]所述試劑還包括任選的用于擴(kuò)增包含ABCAl基因rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs247251U rs2422493、rs2487042、rs2472495、rs4397467、rsll25873、rs715119、rs2487052、rs2472493、rs2487048、rs2027400、rs2472509、 rsl800977、 rs2246293、 rs2515618、 rs7023634、 rsl2553329、 rs2437817、rs3887137、rs2487046、rs2472496、rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和rs2487031變異的基因片段的試劑。
[0012]其中，所述檢測ABCAl 基因 rs2487032 變異 A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為Snapshot試劑。
[0013]其中，所述檢測ABCAl 基因 rs2487032 變異 A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為DNA測序用試劑、實(shí)時(shí)熒光定量PCR法用試劑、變性高效液相色譜分析法用試劑、等位基因特異擴(kuò)增法用試劑、雜交法用試劑、質(zhì)譜法用試劑、限制性片段長度多態(tài)性分析法用試劑或單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析法用試劑。
[0014]SNP是Single Nucleotide Polymorphism的縮寫，中文翻譯為單核苷酸多態(tài)性,是指基因組上單個(gè)核苷酸的變異。前述5個(gè)變異堿基屬于單核苷酸變異的結(jié)果。
[0015]本發(fā)明首次闡明了 ABCAl基因上31個(gè)位點(diǎn)與青光眼存在相關(guān)性，使用本發(fā)明提供的試劑盒，可以有效篩查待檢人群的對(duì)青光眼疾病的抗性和易感性，評(píng)估待檢人群患青光眼的可能性，應(yīng)用前景良好。
[0016]本發(fā)明的測定方法測定來源于人的基因組DNA，樣品沒有限制，如體液(如血液、腹水和尿液)、組織細(xì)胞(如肝組織)等，通過提取和純化這些樣品均可制備基因組DNA。
[0017]染色體DNA同一位置上的每個(gè)堿基類型叫做一個(gè)等位位點(diǎn)，SNP在人群中大多只有兩種等位型，故亦稱為雙等位標(biāo)記，其檢測是一種“+/ - ”或“全/無”的檢測方式。

【專利附圖】

【附圖說明】
[0018]圖1Snapshot檢測SNP rs2487032位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0019]圖2Snapshot檢測SNP rs2472519位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0020]圖3Snapshot檢測SNP rs2472459位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0021]圖4Snapshot檢測SNP rs2164560位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0022]圖5Snapshot檢測SNP rsl2555462位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0023]圖6Snapshot檢測SNP rs2472511位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0024]圖7Snapshot檢測SNP rs2422493位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0025]圖8Snapshot檢測SNP rs2487042位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0026]圖9Snapshot檢測SNP rs2472495位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0027]圖1OSnapshot檢測SNP rs4397467位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0028]圖1lSnapshot檢測SNP rsll25873位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0029]圖12Snapshot檢測SNP rs715119位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0030]圖13Snapshot檢測SNP rs2487052位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0031]圖HSnapshot檢測SNP rs2472493位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0032]圖15Snapshot檢測SNP rs2487048位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0033]圖16Snapshot檢測SNP rs2027400位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0034]圖17Snapshot檢測SNP rs2472509位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0035]圖18Snapshot檢測SNP rsl800977位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0036]圖19Snapshot檢測SNP rs2246293位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0037]圖20Snapshot檢測SNP rs2515618位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0038]圖21Snapshot檢測SNP 7023634位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0039]圖22Snapshot檢測SNP rsl2553329位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0040]圖23Snapshot檢測SNP rs2437817位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0041]圖24Snapshot檢測SNP rs3887137位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0042]圖25Snapshot檢測SNP rs2487046位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0043]圖26Snapshot檢測SNP rs2472496位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0044]圖27Snapshot檢測SNP rsl800976位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0045]圖28Snapshot檢測SNP rs2472516位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0046]圖29Snapshot檢測SNP rs2043664位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0047]圖30Snapshot檢測SNP rs2487034位點(diǎn)的基因分型圖譜
[0048]圖31Snapshot檢測SNP rs2487031位點(diǎn)的基因分型圖譜

【具體實(shí)施方式】
[0049]以下通過實(shí)施例形式的【具體實(shí)施方式】，對(duì)本發(fā)明的上述內(nèi)容作進(jìn)一步的詳細(xì)說明。但不應(yīng)將此理解為本發(fā)明上述主題的范圍僅限于以下的實(shí)施例。凡基于本發(fā)明上述內(nèi)容所實(shí)現(xiàn)的技術(shù)均屬于本發(fā)明的范圍。
[0050]用于下列實(shí)施例中表示試劑均為市售品，其英文縮寫如下。
[0051]需要時(shí)，用高壓鍋(120°C，20分鐘)滅菌
[0052]EDTA:乙二胺四乙酸二鈉
[0053]SDS:十二烷基硫酸納
[0054]TE: 1mM Tris-HCl (pH7.5)、ImM EDTA (ρΗ8.0)
[0055]dNTP:脫氧核苷三磷酸
[0056]實(shí)施例1樣本收集和基因組DNA的提取
[0057]本發(fā)明研究納入的原發(fā)性開角型青光眼包含了高眼壓型青光眼(HTG)和正常眼壓型青光眼(NPG)。全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)的發(fā)現(xiàn)階段，驗(yàn)證一階段和驗(yàn)證二階段用的都是高眼壓型青光眼(HTG)。發(fā)現(xiàn)階段包含了 1007個(gè)散發(fā)的高眼壓型青光眼患者和1009個(gè)正常對(duì)照。所有樣本都來自于上海，香港，和成都地區(qū)，分別在復(fù)旦大學(xué)附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院，香港中文大學(xué)香港眼科醫(yī)院，四川省人民醫(yī)院收集。驗(yàn)證一階段包含了 525位高眼壓型青光眼患者和912個(gè)正常對(duì)照，樣本取自新加坡國立眼科中心，新加坡眼科研究所，新加坡國立大學(xué)健康署。二階段驗(yàn)證包含615個(gè)散發(fā)的高眼壓型青光眼患者和1325個(gè)正常對(duì)照，樣本來自上海、北京和四川，分別取自北京同仁醫(yī)院，復(fù)旦大學(xué)附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院和四川省人民醫(yī)院。三階段患者主要是正常眼壓青光眼，共有759個(gè)患者和2728個(gè)正常對(duì)照，樣本來自上海、北京、四川和香港地區(qū)，分別取自北京同仁醫(yī)院，復(fù)旦大學(xué)附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院，四川省人民醫(yī)院和香港眼科醫(yī)院。所有參與者均由眼科醫(yī)生按照標(biāo)準(zhǔn)操作流程給予詳細(xì)的眼科檢查。本研究原發(fā)性開角型青光眼患者2906例，平均年齡54.9±16.1 (18.0-95.0)歲，其中男性占53.8%，對(duì)照5974例，平均年齡64.9± 16.6(19.0-102.0)歲，其中男性占51.6%。所有受檢者均為漢族，且簽署知情同意書，這一研究也得到了倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。
[0058]根據(jù)下列方法，用人外周血制備基因組DNA。在抗凝劑EDTA存在下，將收集的5ml人外周血在3000rpm離心分離30分鐘除去血清。接著加入0.2% NaCl溶液，使總體積為50ml。輕輕振蕩溶液5-6次，并使其放置于冰上15分鐘。此后，在3000rpm離心分離30分鐘，借此收集沉淀物。用0.2%的NaCl溶液，以類似于前面的方式再進(jìn)行洗滌。在如此獲得的沉淀物中，加入1mM Tris-HCl (pH8.0)和1mM EDTA(4ml)，以懸浮該沉淀物。將10%SDS, 25mg/ml的蛋白酶K和10mg/ml的RNaseA加入懸液中，其加入量分別為4ml、16 μ I和20 μ I，接著上下顛倒懸液輕輕混合。然后，在37°C過夜溫育懸液。過夜后，加入4ml酚/Tris溶液，上下顛倒混合物混合所得的混合物。以3000rpm離心分離10分鐘除去水層。將水層和4ml酹/氯仿溶液混合,接著逆混合并以3000rpm離心分離10分鐘，除去水層。最后,用氯仿提取兩次，以獲得水相，往其中加1/10，3M NaAC (pH5.2)，兩倍量的冷無水乙醇，使DNA沉淀。用70%的乙醇洗滌以獲得基因組DNA。最后將所得的基因組DNA溶解于TE中，然后定量測定混合物在260nm的吸收率，DNA工作液濃度校正至50ng/ μ 1，置_20°C冰箱保存。
[0059]實(shí)施例2本發(fā)明SNP的基因型分析
[0060] 本發(fā)明采用Snapshot基因分型技術(shù)對(duì)如下位于三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)子I (ATP-binding cassette, sub-family A(ABCl) ,memberI, ABCAI)基因上的 31 個(gè) SNP 位點(diǎn)進(jìn)行檢測。采用基因擴(kuò)增試劑及Snapshot引物分別按照下述方法進(jìn)行分型。SNaPshot又稱微測序法。該技術(shù)由美國應(yīng)用生物公司(ABI)開發(fā)，基于熒光標(biāo)記單堿基延伸原理的分型技術(shù)，主要針對(duì)中等通量的SNP分型項(xiàng)目。在一個(gè)含有測序酶，四種熒光標(biāo)記的ddNTP，緊挨多態(tài)位點(diǎn)5’端的不同長度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引物延伸一個(gè)堿基即終止，經(jīng)ABI測序儀電泳后，根據(jù)峰的顏色可知摻入的堿基種類，從而確定該樣本的基因型，根據(jù)峰移動(dòng)的膠位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn)。對(duì)于PCR產(chǎn)物模板可通過多重PCR反應(yīng)體系來獲得。通常用于5-15個(gè)SNP位點(diǎn)分析。本發(fā)明31個(gè)SNP的相關(guān)信息如下表1所示:
[0061]表1本發(fā)明31個(gè)SNP的相關(guān)信息
[0062]

【權(quán)利要求】
1.檢測ABCAl 基因 rs2487032 變異、rs2472519 變異、rs2472459 變異、rs2164560變異、rsl2555462 變異、rs2472511 變異、rs2422493 變異、rs2487042 變異、rs2472495變異、rs4397467 變異、rsll25873 變異、rs715119 變異、rs2487052 變異、rs2472493 變異、rs2487048 變異、rs2027400 變異、rs2472509 變異、rsl800977 變異、rs2246293 變異、rs2515618 變異、rs7023634 變異、rsl2553329 變異、rs2437817 變異、rs3887137 變異、rs2487046 變異、rs2472496 變異、rsl800976 變異、rs2472516 變異、rs2043664 變異、rs2487034變異、或/和rs2487031變異的相關(guān)試劑在制備青光眼篩查試劑中的用途。
2.根據(jù)權(quán)利要求2所述的用途，其特征在于:所述試劑包括檢測ABCAl基因rs2487032變異 A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462變異 A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495變異 C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052變異 T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509變異 C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664變異A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的用途，其特征在于:所述試劑還包括任選的用于擴(kuò)增包含 ABCAl 基因 rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs2472511、rs2422493、 rs2487042、 rs2472495、 rs4397467、 rsll25873、 rs715119、 rs2487052、rs2472493、rs2487048、rs2027400、rs2472509、rsl800977, rs2246293、rs2515618、rs7023634、 rsl2553329、 rs2437817、 rs3887137、 rs2487046、 rs2472496、 rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和 rs2487031 基因片段的試劑。
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的用途，其特征在于:所述檢測ABCAl基因rs2487032變異A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664變異A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為Snapshot用試劑。
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的用途，其特征在于:所述檢測ABCAl基因rs2487032變異A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664變異A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為DNA測序用試劑、實(shí)時(shí)熒光定量PCR法用試劑、變性高效液相色譜分析法用試劑、等位基因特異擴(kuò)增法用試劑、雜交法用試劑、質(zhì)譜法用試劑、限制性片段長度多態(tài)性分析法用試劑或單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析法用試劑。
6.一種青光眼的篩查試劑盒，其特征在于:它包括任選的用于檢測ABCAl基因rs2487032 變異、rs2472519 變異、rs2472459 變異、rs2164560 變異、rsl2555462 變異、rs2472511 變異、rs2422493 變異、rs2487042 變異、rs2472495 變異、rs4397467 變異、rsll25873 變異、rs715119 變異、rs2487052 變異、rs2472493 變異、rs2487048 變異、rs2027400 變異、rs2472509 變異、rsl800977 變異、rs2246293 變異、rs2515618 變異、rs7023634 變異、rsl2553329 變異、rs2437817 變異、rs3887137 變異、rs2487046 變異、rs2472496 變異、rsl800976 變異、rs2472516 變異、rs2043664 變異、rs2487034 變異、或 /和rs2487031變異的相關(guān)試劑。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的試劑盒，其特征在于:所述試劑包括檢測ABCAl基因rs2487032 變異 A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異 A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異A — G、rs2472495 變異 C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異A — G、rs2487052 變異 T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異A — G、rs2472509 變異 C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異A — G、rs7023634 變異 G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516變異 T — C、rs2043664 變異 A — G、rs2487034 變異 G — A、或 / 和 rs2487031 變異 C — T的試劑。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的試劑盒，其特征在于:所述試劑還包括任選的用于擴(kuò)增包含 ABCAl 基因 rs2487032、rs2472519、rs2472459、rs2164560、rsl2555462、rs2472511、rs2422493、rs2487042、rs2472495、rs4397467、rsll25873、rs715119、rs2487052、rs2472493、rs2487048、rs2027400、rs2472509、rsl800977, rs2246293、rs2515618、rs7023634、rsl2553329、rs2437817、rs3887137、rs2487046、rs2472496、rsl800976、rs2472516、rs2043664、rs2487034、或 / 和 rs2487031 的基因片段的試劑。
9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的試劑盒，其特征在于:所述檢測ABCAl基因rs2487032變異A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664變異A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為Snapshot用試劑。
10.根據(jù)權(quán)利要求7所述的試劑盒，其特征在于:所述檢測ABCAl基因rs2487032變異A — G、rs2472519 變異 A — G、rs2472459 變異 T — C、rs2164560 變異 C — T、rsl2555462 變異A — T、rs2472511 變異 A — G、rs2422493 變異 C — T、rs2487042 變異 A — G、rs2472495 變異C — T、rs4397467 變異 G — A、rsll25873 變異 T — A、rs715119 變異 A — G、rs2487052 變異T — C、rs2472493 變異 C — T、rs2487048 變異 C — T、rs2027400 變異 A — G、rs2472509 變異C — A、rsl800977 變異 T — C、rs2246293 變異 C — G、rs2515618 變異 A — G、rs7023634 變異G — A、rsl2553329 變異 A — G、rs2437817 變異 T — G、rs3887137 變異 A — G、rs2487046 變異 C — T、rs2472496 變異 A — G、rsl800976 變異 C — G、rs2472516 變異 T — C、rs2043664變異A — G、rs2487034變異G — A、或/和rs2487031變異C — T的試劑為DNA測序用試劑、實(shí)時(shí)熒光定量PCR法用試劑、變性高效液相色譜分析法用試劑、等位基因特異擴(kuò)增法用試劑、雜交法用試劑、質(zhì)譜法用試劑、限制性片段長度多態(tài)性分析法用試劑或單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析法用 試劑。
【文檔編號(hào)】C12Q1/68GK104164498SQ201410363088
【公開日】2014年11月26日 申請(qǐng)日期:2014年7月28日 優(yōu)先權(quán)日:2014年7月28日
【發(fā)明者】楊正林, 孫興懷, 林嬰, 陳宇虹 申請(qǐng)人:電子科技大學(xué)附屬醫(yī)院·四川省人民醫(yī)院, 復(fù)旦大學(xué)附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院