【】本發(fā)明屬于水稻粒重粒形改良的遺傳育種領(lǐng)域,具體涉及檢測水稻粒重qtlqtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記及應(yīng)用,特別是控制水稻粒重粒形qtl的鑒定、高粒重等位基因的檢測和粒重粒形改良的育種應(yīng)用。
背景技術(shù)
0、
背景技術(shù):
1、近年來,基于數(shù)量性狀位點(diǎn)(quantitative?trait?loci,qtls)的研究在農(nóng)業(yè)生物技術(shù)中扮演了越來越重要的角色。通過對這些控制重要農(nóng)藝性狀如抗病蟲害能力和籽實(shí)大小等因素的qtl進(jìn)行研究,科學(xué)家們能夠更精準(zhǔn)地定位有益變異并將其應(yīng)用于育種實(shí)踐中去,從而培育出更加優(yōu)質(zhì)高效的作物品種。
2、粒重是水稻關(guān)鍵的產(chǎn)量性狀之一,主要由粒長、粒寬和粒厚決定。其中,水稻粒長和粒寬不僅是評價(jià)稻米外觀品質(zhì)的重要指標(biāo),同時(shí)對稻米碾磨品質(zhì)和蒸煮食味品質(zhì)具有重要影響,極大地影響其市場價(jià)值。因此,鑒定更多新的控制粒重粒形qtl并開發(fā)與其緊密連鎖的dna標(biāo)記,將有利于水稻粒重和粒形的品種改良。
3、目前,在改善水稻產(chǎn)量方面常用的策略主要有兩種:一是傳統(tǒng)雜交育種法,即通過反復(fù)試驗(yàn)不同親本間的組合,篩選出生長性能優(yōu)良的新品系;這種方法雖然成本較低但耗時(shí)較長且效率不高。另一種則是利用分子標(biāo)記輔助選擇(marker-assisted?selection,mas),它可以在早期階段就快速鑒別出攜帶期望表型的個(gè)體,大大縮短了育種周期并提高了成功率。然而,傳統(tǒng)的mas方法依賴于連鎖不平衡區(qū)域內(nèi)多個(gè)多態(tài)性標(biāo)志物的同時(shí)使用,這不僅增加了實(shí)驗(yàn)復(fù)雜度,也限制了其實(shí)用性和精確度。
4、盡管上述方法都能一定程度上改進(jìn)稻米品質(zhì),但仍存在一些局限性。例如,傳統(tǒng)雜交育種法因其漫長的時(shí)間跨度難以滿足市場對新品種的需求;而現(xiàn)有的mas方法雖能顯著加快育種進(jìn)程,但由于缺乏有效的單一標(biāo)記,導(dǎo)致在實(shí)際應(yīng)用中的準(zhǔn)確率有待提高。
5、專利權(quán)人從秈稻品種特青和秈稻品種irbb52衍生群體中鑒定到一個(gè)新的控制粒重的qtl?qtgw2-35.7,來自irbb52的等位基因顯著增加千粒重、粒長、粒寬和長寬比。隨后,專利權(quán)人根據(jù)特青和irbb52全基因組重測序結(jié)果,開發(fā)了一個(gè)用于檢測qtgw2-35.7上irbb52高粒重等位基因的分子標(biāo)記,該標(biāo)記可廣泛用于水稻品種中粒重粒形性狀的改良。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
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技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
1、本發(fā)明要解決的技術(shù)問題,在于提供一種檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記及應(yīng)用,該標(biāo)記可特異性識別位于水稻qtgw2-35.7區(qū)域內(nèi)的高粒重等位基因,且準(zhǔn)確性高,可用于高粒重水稻品種的分子標(biāo)記輔助選擇育種。
2、本發(fā)明是這樣實(shí)現(xiàn)的:
3、一種檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記,所述dna標(biāo)記名稱為tw35754,所述dna標(biāo)記tw35754的引物序列如下:
4、tw35754的上游引物序列為:ggtacatataagaaatgatgcctg;如seq?id?no:1所示核苷酸序列;
5、tw35754的下游引物序列為:gcctcctcaatttatactagatga;如seq?id?no:2所示核苷酸序列。
6、進(jìn)一步地,所述dna標(biāo)記在檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上irbb52高粒重等位基因的應(yīng)用。
7、進(jìn)一步地,一種檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記的檢測方法,步驟如下:
8、(1)將對照irbb52和待測水稻材料的dna作為模板,加入權(quán)利要求1所述dna標(biāo)記tw35754和taq?dna聚合酶進(jìn)行pcr擴(kuò)增,pcr反應(yīng)條件:預(yù)變性94℃2分鐘,變性94℃30秒,退火55℃30秒,72℃延伸15秒,32個(gè)循環(huán),72℃延伸3分鐘;
9、(2)用6%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測pcr產(chǎn)物,若待測樣品的pcr產(chǎn)物片段大小與irbb52一致,則說明待測樣品攜帶qtgw2-35.7上irbb52高粒重等位基因。
10、本發(fā)明具有如下優(yōu)點(diǎn):
11、本發(fā)明提供了一個(gè)檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上irbb52高粒重等位基因的特異性pcr標(biāo)記,該標(biāo)記可以準(zhǔn)確鑒定待測材料在該座位上是否攜帶irbb52高粒重等位基因,根據(jù)其檢測結(jié)果可判斷該水稻品種是否能增加水稻粒重、粒長、粒寬和長寬比。本發(fā)明提供的標(biāo)記特異性好、準(zhǔn)確性高,有助于迅速鎖定有價(jià)值的遺傳變異來源,同時(shí)簡化了復(fù)雜的多重標(biāo)記聯(lián)用模式,只需一組特異性良好的引物就能達(dá)到理想的分型效果,在水稻粒重粒形品種改良中具有良好的應(yīng)用前景。
1.檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記,其特征在于:所述dna標(biāo)記名稱為tw35754,所述dna標(biāo)記tw35754的引物序列如下:
2.一種檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記的應(yīng)用,其特征在于:基于權(quán)利要求1所述dna標(biāo)記在檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上irbb52高粒重等位基因的應(yīng)用。
3.一種檢測水稻粒重qtl?qtgw2-35.7上高粒重等位基因的特異性dna標(biāo)記的檢測方法,其特征在于:所述檢測方法步驟如下: