專利名稱：一種空間屎腸球菌lct-ef20菌株的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域；更具體地，本發(fā)明涉及屎腸球菌及其生物學(xué)特性、全基因組學(xué)測序、轉(zhuǎn)錄組測序和差異蛋白組學(xué)分析。
背景技術(shù)：
隨著我國載人 航天和空間站建設(shè)等國家重大需求的實施，載人航天的醫(yī)學(xué)保障需求日益突出。載人航天活動中，地面微生物可隨航天員或航空部件進入太空，微重力、強輻射及極端溫度等特殊空間環(huán)境可對微生物產(chǎn)生影響，誘導(dǎo)細菌生物學(xué)性狀或致病性改變，增加航天員的感染風(fēng)險，影響人類空間駐留能力。屎腸球菌是一種革蘭氏陽性菌，屬于腸球菌屬。腸球菌屬是人類胃腸道的常駐菌群，可以在各種植物、動物、昆蟲和環(huán)境其他位置生長。長期以來，腸球菌屬被認為是哺乳動物胃腸道內(nèi)無害的共生菌，被用作為益生菌加入到發(fā)酵食品中。然而，最近的研究顯示某些腸球菌已被確認為能引起感染的條件致病菌，可導(dǎo)致人體多系統(tǒng)感染。近幾十年來，由于頭孢菌素和喹諾酮類等抗菌藥物在臨床中的濫用，導(dǎo)致多重耐藥、泛耐藥和全耐藥腸球菌的產(chǎn)生和蔓延，使得臨床上腸球菌感染的情況更加嚴峻。隨著人類基因組計劃的實施和進行，生物體基因組研究已經(jīng)成為生命科學(xué)研究的前沿領(lǐng)域，而與之相對應(yīng)的微生物基因組研究正在廣泛開展。細菌是微生物的一種，其基因組小、操作簡單且實驗周期短，其研究的工作可為人類基因組研究提供有益的參考；同時隨著測序技術(shù)的更新?lián)Q代和高通量測序技術(shù)的出現(xiàn),細菌基因組的測序成本和所需時間已大幅度降低。此外，差異蛋白組學(xué)分析技術(shù)近年來也日新月異，質(zhì)譜等新技術(shù)的不斷出現(xiàn)，使蛋白質(zhì)組分析更為簡便。通過基因組、轉(zhuǎn)錄組測序和蛋白組分析太空環(huán)境條件下的細菌，研究空間環(huán)境對屎腸球菌的作用和機理，有利于空間生物安全性的評估和保障航天員的健康；同時利用太空環(huán)境下微生物菌株，可為人類抗感染提供新的理論基礎(chǔ)，最終造福于人類。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的一個目的提供空間環(huán)境誘變的屎腸球菌LCT-EF20菌株。本發(fā)明提供的該菌株，其保藏號為CGMCC NO. 6524。—株屎腸球菌，革蘭氏染色陽性，呈單個、鏈狀、聚團排列；同地面對照株的抗生素耐受性相比，對抗生素菌必治(頭孢曲松鈉)更加敏感；無生長速度的差異；能利用肌酐和L-蘋果酸為碳源，而不能利用對羥基苯乙酸。所述的屎腸球菌LCT-EF20菌株，進行全基因組測序和比較基因組學(xué)分析得出突變基因，見表1，空間環(huán)境導(dǎo)致LCT-E F20菌株基因組上SNP的變化，包括SNP在基因組上的位置，突變位點及編碼蛋白以及注釋出的基因。表I空間環(huán)境導(dǎo)致LCT-EF20菌株基因組上SNP的變化
權(quán)利要求
1.一種屎腸球菌LCT-EF20，其保藏號為CGMCC NO. 6524。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一株屎腸球菌，其特征在于革蘭氏染色陽性，呈單個、鏈狀、聚團排列；同地面對照株的抗生素耐受性相比，對抗生素菌必治(頭孢曲松鈉)更加敏感；無生長速度的差異；能利用肌酐和L-蘋果酸為碳源，而不能利用對羥基苯乙酸。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的屎腸球菌LCT-EF20菌株，進行全基因組測序和比較基因組學(xué)分析得出突變基因。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的屎腸球菌LCT-EF20菌株，進行轉(zhuǎn)錄組測序得出差異表達基因。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的屎腸球菌LCT-EF20菌株，進行差異蛋白組學(xué)分析得出差異表達蛋白分子。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的屎腸球菌LCT-EF20菌株，可應(yīng)用于篩選和鑒定臨床抗生素耐藥靶點。
全文摘要
本發(fā)明涉及一株太空環(huán)境下屎腸球菌LCT-EF20菌株的生物學(xué)特性、基因組DNA序列、轉(zhuǎn)錄組和差異蛋白組學(xué)，特別是同地面屎腸球菌比較分析鑒定出的功能序列和分子在闡明空間環(huán)境對微生物的作用及其用途，可獲得全面、準確的空間環(huán)境下屎腸球菌菌株突變的基因、差異表達基因和蛋白質(zhì)。
文檔編號C12N1/20GK103060225SQ20121038003
公開日2013年4月24日 申請日期2012年9月26日 優(yōu)先權(quán)日2012年9月26日
發(fā)明者劉長庭, 常德, 方向群, 李天志, 王俊峰, 郭英華, 蘇龍翔, 王雅娟, 陳振鴻, 劉巖 申請人:中國人民解放軍總醫(yī)院