本發(fā)明屬于食品檢測,尤其涉及一種檢測牛肉的rpa-pfago檢測系統(tǒng)及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、牛肉因其豐富的營養(yǎng)價(jià)值、獨(dú)特的口感,在全球肉類消費(fèi)市場中占據(jù)重要地位,深受消費(fèi)者喜愛。然而,隨著市場需求的不斷增長,牛肉市場也面臨著嚴(yán)峻的挑戰(zhàn),其中肉類摻假問題尤為突出。一些不法商家為追求高額利潤,常常將價(jià)格相對低廉的肉類,如豬肉、雞肉、鴨肉等,摻入高價(jià)的牛肉中以次充好。這種欺詐行為不僅嚴(yán)重?fù)p害了消費(fèi)者的切身利益,破壞了市場的公平競爭環(huán)境,還可能引發(fā)一系列食品安全問題,對公眾健康構(gòu)成潛在威脅。因此,準(zhǔn)確識別肉類物種對于保護(hù)消費(fèi)者利益、遵守法律標(biāo)準(zhǔn)以及防止食品行業(yè)的欺詐行為至關(guān)重要。
2、近年來,肉類識別的進(jìn)展已從形態(tài)學(xué)和基于蛋白質(zhì)的檢測方法發(fā)展到復(fù)雜的核酸檢測方法?,F(xiàn)有技術(shù)中通常依賴于pcr,以及dna條形碼、微滴式數(shù)字pcr(ddpcr)、電子鼻和電子舌技術(shù)、酶聯(lián)免疫吸附測定(elisa)和光譜分析等技術(shù),實(shí)現(xiàn)牛肉的檢測。然而dna條形碼對檢測近親種類的摻假效果較差;ddpcr其高設(shè)備和操作要求限制了快速部署;電子鼻技術(shù)成本高且對環(huán)境敏感的特性,限制了其廣泛使用;elisa具有高靈敏性和特異性,但特定抗體的可用性有限,基質(zhì)效應(yīng)可能干擾結(jié)果;光譜方法雖然詳細(xì),但耗時(shí)且成本高,且對設(shè)備規(guī)格要求嚴(yán)格,使其不適合大規(guī)??焖佻F(xiàn)場檢測。重組酶聚合酶擴(kuò)增(rpa)和環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),雖然靈敏度高,能夠?qū)崿F(xiàn)快速檢測,然而也正是由于其靈敏度過高,在實(shí)際操作中極易受到環(huán)境中核酸污染的影響,導(dǎo)致假陽性結(jié)果頻繁出現(xiàn)。而且,在現(xiàn)場環(huán)境中執(zhí)行單管多重檢測時(shí),這兩種技術(shù)面臨諸多困難,難以有效區(qū)分目標(biāo)核酸和污染核酸,從而影響檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。因此,開發(fā)一種高效、準(zhǔn)確、可靠的牛肉檢測技術(shù),迫在眉睫。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、有鑒于此,本發(fā)明的目的在于提供一種檢測牛肉的rpa-pfago檢測系統(tǒng)及其應(yīng)用,本發(fā)明通過將rpa技術(shù)與來自極端嗜熱古菌的argonaute蛋白進(jìn)行結(jié)合,實(shí)現(xiàn)了對牛肉的準(zhǔn)確識別,為快速現(xiàn)場檢測提供了實(shí)用解決方案,增強(qiáng)了商業(yè)和監(jiān)管環(huán)境中對牛肉的驗(yàn)證。
2、為了實(shí)現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明提供以下技術(shù)方案:
3、本發(fā)明提供一種檢測牛肉的rpa-pfago檢測系統(tǒng),所述rpa-pfago檢測系統(tǒng)包括針對牛肉基因所設(shè)計(jì)的rpa特異性引物對、pfago蛋白的gdna1-1與gdna1-2序列以及探針;
4、所述rpa特異性引物對為seq?id?no.2與seq?id?no.4、seq?id?no.2與seq?idno.6或seq?id?no.3與seq?id?no.4;
5、所述gdna1-1序列如seq?id?no.7所示;
6、所述gdna1-2序列如seq?id?no.8所示;
7、所述探針的序列如seq?id?no.11所示。
8、作為優(yōu)選,所述探針標(biāo)記熒光基團(tuán),所述熒光基團(tuán)為fam或rox。
9、本發(fā)明提供了所述的rpa-pfago檢測系統(tǒng)在檢測牛肉中的應(yīng)用,所述檢測為出現(xiàn)熒光表明所檢測的肉類含有牛肉。
10、本發(fā)明還提供了一種檢測牛肉的試劑盒,包括所述的rpa-pfago檢測系統(tǒng)、緩沖液、醋酸鎂、pfago酶、mncl2、buffer、水。
11、作為優(yōu)選,所述試劑盒的使用方法包括如下步驟:
12、(1)提取樣品dna;
13、(2)利用rpa特異性引物對對提取的樣品dna進(jìn)行擴(kuò)增,獲得rpa產(chǎn)物;
14、(3)將步驟(2)獲得的rpa產(chǎn)物、gdna1-1序列、gdna1-2序列、探針、pfago酶、mncl2、buffer和水混合,進(jìn)行pfago酶切反應(yīng),出現(xiàn)熒光,表明樣品中含有牛肉。
15、作為優(yōu)選,步驟(2)所述擴(kuò)增體系以50μl計(jì),包括29.5μl緩沖液、初始濃度為10μm的所述的rpa特異性引物對的上下游引物各2μl、2μl樣品dna、2~5μl初始濃度為280mm的醋酸鎂、水補(bǔ)足至50μl。
16、作為優(yōu)選,所述擴(kuò)增的溫度為30~45℃,所述擴(kuò)增的時(shí)間為10~40min。
17、作為優(yōu)選,步驟(3)所述pfago酶切反應(yīng)體系以25μl計(jì),所述rpa產(chǎn)物的使用量為1~10μl;所述gdna1-1的濃度為1~100μm;所述gdna1-2的濃度為1~100μm;所述探針的濃度為1~100μm;所述mncl2的使用量為1~6μl;pfago酶的使用量為1~6μl。
18、作為優(yōu)選,所述pfago酶切反應(yīng)的溫度為90~100℃,所述pfago酶切反應(yīng)的時(shí)間為25~35min。
19、作為優(yōu)選,所述熒光的激發(fā)波長為470nm或525nm。
20、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:本發(fā)明提供了一種檢測牛肉的rpa-pfago檢測系統(tǒng)及其應(yīng)用,本發(fā)明利用rpa的高效性和特異性,結(jié)合來自極端嗜熱古菌(pyrococcus?furiosus)的argonaute蛋白(pfago)以增強(qiáng)檢測能力。本發(fā)明通過對rpa-pfago檢測系統(tǒng)的優(yōu)化,增強(qiáng)了對牛肉識別的特異性和靈敏性。并通過分析超市的商業(yè)肉類產(chǎn)品和人工摻假的肉類樣品,測試了該系統(tǒng)的普適適用性。為快速現(xiàn)場檢測提供了實(shí)用解決方案,增強(qiáng)了商業(yè)和監(jiān)管環(huán)境中對牛肉準(zhǔn)確識別的驗(yàn)證。
1.一種檢測牛肉的rpa-pfago檢測系統(tǒng),其特征在于,所述rpa-pfago檢測系統(tǒng)包括針對牛肉基因所設(shè)計(jì)的rpa特異性引物對、pfago蛋白的gdna1-1與gdna1-2序列以及探針;
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的rpa-pfago檢測系統(tǒng),其特征在于,所述探針標(biāo)記熒光基團(tuán),所述熒光基團(tuán)為fam或rox。
3.權(quán)利要求1或2所述的rpa-pfago檢測系統(tǒng)在檢測牛肉中的應(yīng)用,其特征在于,所述檢測為出現(xiàn)熒光表明所檢測的肉類含有牛肉。
4.一種檢測牛肉的試劑盒,其特征在于,包括權(quán)利要求1所述的rpa-pfago檢測系統(tǒng)、緩沖液、醋酸鎂、pfago酶、mncl2、buffer、水。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的使用方法包括如下步驟:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于,步驟(2)所述擴(kuò)增體系以50μl計(jì),包括29.5μl緩沖液、初始濃度為10μm的權(quán)利要求1所述的rpa特異性引物對的上下游引物各2μl、2μl樣品dna、2~5μl初始濃度為280mm的醋酸鎂、水補(bǔ)足至50μl。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于,所述擴(kuò)增的溫度為30~45℃,所述擴(kuò)增的時(shí)間為10~40min。
8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于,步驟(3)所述pfago酶切反應(yīng)體系以25μl計(jì),所述rpa產(chǎn)物的使用量為1~10μl;所述gdna1-1的濃度為1~100μm;所述gdna1-2的濃度為1~100μm;所述探針的濃度為1~100μm;所述mncl2的使用量為1~6μl;pfago酶的使用量為1~6μl。
9.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于,所述pfago酶切反應(yīng)的溫度為90~100℃,所述pfago酶切反應(yīng)的時(shí)間為25~35min。
10.根據(jù)權(quán)利要求5所述的試劑盒,其特征在于,所述熒光的激發(fā)波長為470nm或525nm。