本發明涉及智能醫療,尤其涉及一種ras野生型轉移性結直腸癌患者的分類方法和系統。
背景技術:
1、結直腸癌(colorectal?cancer,crc)是一種常見的消化道惡性腫瘤,在世界范圍內有著較高的發病例和死亡率。轉移性結直腸癌(metastatic?colorectal?cancer,mcrc)亦成為臨床診療中的難點和重點。
2、抗表皮生長因子受體(抗egfr)單克隆抗體聯合化療是ras野生型轉移性結直腸癌(ras野生型mcrc)患者的一線標準治療。
3、然而,藥物靶點基因的多樣性對藥效具有一定影響,不同基因型對于不同的抗egfr靶向藥有著不同的敏感性(有效性),為了保障轉移性結直腸癌轉化治療給藥的準確性,減少不必要的經濟成本,篩選出抗egfr靶向藥轉化治療的敏感人群至關重要。
4、基于此,本技術提出一種ras野生型轉移性結直腸癌患者的分類方法和系統。
技術實現思路
1、本說明書提供一種ras野生型轉移性結直腸癌患者的分類方法和系統,通過將所述感興趣區域、所述目標基因特征輸入至融合模型中,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的關于所述待測藥物的敏感性預測結果,以輔助引導用戶的注意力。
2、本技術提供的一種ras野生型轉移性結直腸癌患者的分類方法采用如下的技術方案,包括:
3、獲取ras野生型轉移性結直腸癌患者的基本信息,所述基本信息包括ct影像組學數據和基因數據;
4、提取所述ct影像組學數據中的感興趣區域;
5、對所述基因數據進行篩選,得到與待測藥物的信息相關聯的目標基因特征;
6、將所述感興趣區域、所述目標基因特征輸入至融合模型中,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的關于所述待測藥物的敏感性預測結果。
7、可選的,所述提取所述ct影像組學數據中的感興趣區域,包括:
8、對所述ct影像組學數據進行重采樣,調整所述ct影像組學數據的體素;
9、對重采樣后的ct影像組學數據進行標準化處理,得到預處理后的所述ct影響組學數據;
10、對預處理后的所述ct影像組學數據進行勾勒,識別并提取勾勒出的區域,作為感興趣區域。
11、可選的,所述將所述感興趣區域、所述目標基因特征輸入至融合模型中,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的對待測藥物的敏感性預測結果,包括:
12、通過第一分類模型對所述感興趣區域中進行特征提取,得到第一分類概率;
13、通過第二分類模型對所述目標基因特征進行預測,得到第二分類概率;
14、融合所述第一分類概率和所述第二分類概率,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的對待測藥物的敏感性預測結果。
15、可選的,所述對所述感興趣區域中進行特征提取,得到第一分類概率,包括:
16、對所述感興趣區域中進行局部特征提取,得到微環境特征;
17、對所述微環境特征進行全局平均池化,將所述微環境特征轉化為一維特征向量;
18、將所述一維特征向量映射到分類標簽空間,得到所述第一分類概率。
19、可選的,所述對所述基因數據進行篩選和分類,得到第二分類概率,包括:
20、將所述目標基因特征輸入隨機森林模型,得到每一決策樹的預測結果;
21、將出現次數最多的所述預測結果作為所述第二分類概率。
22、可選的,所述融合所述第一分類概率和所述第二分類概率,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的對待測藥物的敏感性預測結果,包括:
23、將所述第一分類概率和所述第二分類概率進行加權平均;
24、根據加權平均后的結果確定敏感性標簽,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的對待測藥物的敏感性預測結果。
25、可選的,所述第一分類概率的權重與所述第二分類概率的權重比為3:7。
26、本技術提供的一種ras野生型轉移性結直腸癌患者的分類系統采用如下的技術方案,包括:
27、獲取模塊,用于獲取ras野生型轉移性結直腸癌患者的基本信息,所述基本信息包括ct影像組學數據和基因數據;
28、提取模塊,用于提取所述ct影像組學數據中的感興趣區域;
29、篩選模塊,用于對所述基因數據進行篩選,得到與待測藥物的信息相關聯的目標基因特征;
30、融合模塊,用于將所述感興趣區域、所述目標基因特征輸入至融合模型中,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的關于所述待測藥物的敏感性預測結果。
31、可選的,所述提取模塊,包括:
32、調整子模塊,用于對所述ct影像組學數據進行重采樣,調整所述ct影像組學數據的體素;
33、標準化子模塊,用于對重采樣后的ct影像組學數據進行標準化處理,得到預處理后的所述ct影響組學數據;
34、識別子模塊,用于對預處理后的所述ct影像組學數據進行勾勒,識別并提取勾勒出的區域,作為感興趣區域。
35、可選的,所述融合模塊,包括:
36、特征提取子模塊,用于通過第一分類模型對所述感興趣區域中進行特征提取,得到第一分類概率;
37、分類預測子模塊,用于通過第二分類模型對所述目標基因特征進行預測,得到第二分類概率;
38、融合子模塊,用于融合所述第一分類概率和所述第二分類概率,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的對待測藥物的敏感性預測結果。
39、可選的,所述特征提取子模塊,包括:
40、局部提取單元,用于對所述感興趣區域中進行局部特征提取,得到微環境特征;
41、池化單元,用于對所述微環境特征進行全局平均池化,將所述微環境特征轉化為一維特征向量;
42、映射單元,用于將所述一維特征向量映射到分類標簽空間,得到所述第一分類概率。
43、可選的,所述分類預測子模塊,包括:
44、輸入單元,用于將所述目標基因特征輸入隨機森林模型,得到每一決策樹的預測結果;
45、匯總單元,用于將出現次數最多的所述預測結果作為所述第二分類概率。
46、可選的,所述融合子模塊,包括:
47、第一融合單元,用于將所述第一分類概率和所述第二分類概率進行加權平均;
48、第二融合單元,用于根據加權平均后的結果確定敏感性標簽,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的對待測藥物的敏感性預測結果。
49、可選的,所述第一分類概率的權重與所述第二分類概率的權重比為3:7。
50、本說明書還提供一種電子設備,其中,該電子設備包括:
51、處理器;以及,
52、存儲計算機可執行指令的存儲器,所述可執行指令在被執行時使所述處理器執行上述任一項方法。
53、本說明書還提供一種計算機可讀存儲介質,其中,所述計算機可讀存儲介質存儲一個或多個程序,所述一個或多個程序當被處理器執行時,實現上述任一項方法。
54、本技術中,通過獲取ras野生型轉移性結直腸癌患者的基本信息,所述基本信息包括ct影像組學數據和基因數據;提取所述ct影像組學數據中的感興趣區域;對所述基因數據進行篩選,得到與待測藥物的信息相關聯的目標基因特征;將所述感興趣區域、所述目標基因特征輸入至融合模型中,得到所述ras野生型轉移性結直腸癌患者的關于所述待測藥物的敏感性預測結果,篩選出對待測藥物轉化治療敏感的人群,以便于輔助醫生決策,實現精準用藥。