本發明屬于生物技術領域,具體涉及gbp蛋白及其編碼基因在調控植物產量中的應用。
背景技術:
隨著人口數目的持續增加、耕地大面積的縮水和鹽漬化以及淡水資源的短缺問題的加劇,使得環境脅迫更加嚴峻,這樣就勢必影響全球的農業生產(rosegrantandcline,2003)。而高等植物本身植根于土壤之中,幾乎無自主性移動能力,主要依賴根從土壤中吸收養料和水分來維持生活周期。而且根的發育直接受各種環境因子的炮轟,因此對作物根系發育的研究會直接影響其產量。并且在多細胞植物的胚后發育過程中,幼苗的地上和地下部分的末端出現兩類干細胞群即莖頂端分生組織(sam)和根分生組織(rm),這些干細胞在一定的時空條件下進行分裂,其子細胞除了自我更新外也作為各種組織和器官的細胞來源,維持了植物整個世代的生長發育(weigelandjürgens,2002;laux,2003)。
技術實現要素:
本發明的一個目的是提供gbp蛋白的新用途。
所述gbp蛋白是如下a)或b)或c)或d)的蛋白質:
a)氨基酸序列是序列2所示的蛋白質;
b)在序列2所示的蛋白質的n端和/或c端連接標簽得到的融合蛋白質;
c)將序列2所示的氨基酸序列經過一個或幾個氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有相同功能的蛋白質;
d)與序列2所示的氨基酸序列具有75%或75%以上的同源性且具有相同功能的蛋白質。
本發明提供了gbp蛋白在調控植物根長和/或分蘗數和/或種子數和/或產量中的應用。
本發明的另一個目的是提供與gbp蛋白相關的生物材料的新用途。
本發明提供了與gbp蛋白相關的生物材料在調控植物根長和/或分蘗數和/或種子數和/或產量中的應用;
所述與gbp蛋白相關的生物材料為下述a1)至a12)中的任一種:
a1)編碼gbp蛋白的核酸分子;
a2)含有a1)所述核酸分子的表達盒;
a3)含有a1)所述核酸分子的重組載體;
a4)含有a2)所述表達盒的重組載體;
a5)含有a1)所述核酸分子的重組微生物;
a6)含有a2)所述表達盒的重組微生物;
a7)含有a3)所述重組載體的重組微生物;
a8)含有a4)所述重組載體的重組微生物;
a9)含有a1)所述核酸分子的轉基因植物細胞系;
a10)含有a2)所述表達盒的轉基因植物細胞系;
a11)含有a3)所述重組載體的轉基因植物細胞系;
a12)含有a4)所述重組載體的轉基因植物細胞系。
上述應用中,a1)所述核酸分子為如下1)或2)或3)所示的基因:
1)其編碼序列是序列1所示的cdna分子或dna分子;
2)與1)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且編碼gbp蛋白的cdna分子或基因組dna分子;
3)在嚴格條件下與1)或2)限定的核苷酸序列雜交,且編碼gbp蛋白的cdna分子或基因組dna分子。
上述應用中,所述調控為提高或降低。
本發明還有一個目的是提供gbp蛋白或與gbp蛋白相關的生物材料的新用途。
本發明提供了gbp蛋白或與gbp蛋白相關的生物材料在培育根長變長和/或分蘗數增加和/或種子數增加和/或產量提高的轉基因植物中的應用。
本發明還提供了gbp蛋白或與gbp蛋白相關的生物材料在培育根長變短和/或分蘗數減少和/或種子數減少和/或產量降低的植物中的應用。
本發明還提供了gbp蛋白或與gbp蛋白相關的生物材料在植物育種中的應用。
本發明還有一個目的是提供一種培育根長變長和/或分蘗數增加和/或種子數增加和/或產量提高的轉基因植物的方法。
本發明提供的培育根長變長和/或分蘗數增加和/或種子數增加和/或產量提高的轉基因植物的方法包括提高受體植物中gbp蛋白的含量和/或活性,得到轉基因植物的步驟;所述轉基因植物的根長和/或分蘗數和/或種子數和/或產量高于受體植物。
上述方法中,所述提高受體植物中gbp蛋白的表達量和/或活性的方法為在受體植物中過表達gbp蛋白;所述過表達的方法為將gbp蛋白的編碼基因導入受體植物。
上述方法中,所述gbp蛋白的編碼基因的核苷酸序列是序列1所示的dna分子。
在本發明的具體實施例中,所述gbp蛋白的編碼基因是通過重組載體pmdc32-35s::gbp導入受體植物。所述重組載體pmdc32-35s::gbp為將序列1所示的gbp基因重組到pmdc32載體的attr1(aaacaagtttgtacaaaaaa)和attr2(tttcttgtacaaagtgg)之間,且保持pmdc32載體的其他序列不變后得到的載體。重組載體pmdc32-35s::gbp表達gbp蛋白。
本發明的最后一個目的是提供一種培育根長變短和/或分蘗數減少和/或種子數減少和/或產量降低的植物的方法。
本發明提供的培育根長變短和/或分蘗數減少和/或種子數減少和/或產量降低的植物的方法包括降低植物中gbp蛋白的含量和/或活性,從而減小植物的根長和/或分蘗數和/或種子數和/或產量。
上述方法中,所述根長為主根長,所述分蘗數為單株分蘗數,所述種子數為單株種子數。
上述方法中,所述植物為單子葉植物或雙子葉植物,所述單子葉植物具體可為禾本科植物;所述禾本科植物具體可為水稻;所述水稻具體可為gbp突變體或野生型水稻日本晴。
本發明首先從野生型水稻日本晴中上克隆到gbp基因,然后獲得了gbp基因突變的水稻gbp突變體,并且發現和野生型日本晴nip相比,gbp突變體根系萎縮,單株分蘗數、種子數和產量均有所降低,最后構建了超表達載體pmdc32-35s::gbp,并將超表達載體pmdc32-35s::gbp轉入野生型水稻日本晴中,得到t3代轉gbp水稻純合株系。通過實驗證明:和野生型nip相比,t3代轉gbp水稻純合株系oe8、oe10和oe13根系更加發達,單株分蘗數、種子數和產量均高于野生型nip。證明gbp在水稻根系生長以及產量生產方面發揮正向調節作用。
附圖說明
圖1為水稻gbp基因表達量下降后根系萎縮,表達量上調后根系發達。
圖2為水稻gbp基因表達量下降后分蘗數降低,表達量上調后分蘗數增加。
圖3為統計了水稻gbp基因表達量下降后單株種子數降低,表達量上調后單株種子數增加。
圖4為統計了水稻gbp基因表達量下降后單株分蘗數降低,表達量上調后單株分蘗數增加。
圖5為野生型日本晴nip和gbp突變體中gbp基因表達量檢測。
圖6為水稻gbp基因表達量下降后根長變短,表達量上調后根長變長。
圖7為水稻gbp基因表達量下降后主根長變短,表達量上調后主根長變長。
具體實施方式
下述實施例中所使用的實驗方法如無特殊說明,均為常規方法。
下述實施例中所用的材料、試劑等,如無特殊說明,均可從商業途徑得到。
下述實施例中的定量試驗,均設置三次重復實驗,結果取平均值。
實施例1、水稻gbp基因的克隆
1、rna的提取
提取野生型水稻日本晴葉片的rna。
2、cdna的獲得
以步驟1獲得的rna為模板,反轉錄得到cdna。
3、pcr擴增
以步驟2獲得的cdna為模板,采用引物5′-caccatggcgacgatgtctcgccgc-3′和5′-aacgttgaaccggaaaagcatg-3′進行pcr擴增,得到pcr擴增產物。
4、測序
將pcr擴增產物進行1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測并送交測序。測序結果表明:pcr擴增得到大小為1296bp的擴增產物,其核苷酸序列如序列表中序列1所示,并將序列1所示的基因命名為gbp基因,gbp基因編碼序列表中序列2所示的蛋白質,將序列2所示的氨基酸序列命名為gbp蛋白。
實施例2、gbp突變體的獲得及其性狀檢測
一、gbp突變體的獲得
1、gbp突變體的獲得
將突變體種子(購買于韓國水稻基因沉默突變體公司,種子編號為pfg2b_30061)在30度培養箱中暗培養4天,移到營養液中培養10天,然后再移植到大田中,待一個月后取材提取dna,鑒定純合體,得到突變體植株,將其命名為gbp突變體。
對gbp突變體進行測序。測序結果表明:gbp突變體和野生型水稻日本晴的基因組序列相比,gbp突變體僅是在序列1所示的gbp基因第275-439位插入一段t-dna序列,其余序列與野生型日本晴全部相同。
2、gbp基因表達量檢測
提取野生型日本晴nip和gbp突變體的根的rna,然后反轉錄形成cdna。以獲得的cdna為模板,采用引物gbp-f1:5′-gcgcactcggctctgcgttc-3′和gbp-f2:5′-acatcgcacaacctgaaggatggaa-3′進行pcr半定量,并以ostubulin-rt-f:tcttccaccctgagcagctc和ostubulin-rt-r:aaccttggagaccagtgcag作為內參引物。
結果如圖5所示。從圖中可以看出,內參基因tubulin在野生型日本晴nip和gbp突變體中均能正常轉錄表達,而用引物gbp-f1和gbp-f2均只能在野生型日本晴nip中有擴增條帶,gbp突變體中無擴增產物,說明由于t-dna插入導致gbp突變體中的gbp基因不能正常轉錄表達。
3、gbp純合突變體的獲得
采用如下引物:gbp-f1:5′-gcgcactcggctctgcgttc-3′、gbp-f2:5′-acatcgcacaacctgaaggatggaa-3′和gbp-f3:5′-aacgctgatcaattccacag-3′對gbp突變體進行pcr鑒定,得到gbp純合突變體。
若引物gbp-f1和gbp-f2未擴增出大小為1425bp的條帶,且引物gbp-f2和gbp-f3擴增出大小為498bp的條帶的gbp突變體為gbp純合突變體。
二、gbp突變體的性狀檢測
分別將步驟一中獲得的gbp純合突變體植株(gbp)和野生型水稻日本晴(nip)種子在30℃黑暗培養箱中萌發四天,然后移植到營養液中,生長兩周,再將苗種植于水稻大田,六個月的正常生長,得到gbp純合突變體植株(gbp)和野生型水稻日本晴(nip)。實驗重復3次,結果取平均值。比較gbp純合突變體植株(gbp)和野生型水稻日本晴(nip)的根系生長情況,并統計單株分蘗數和種子數。
結果如圖1、圖2、圖3、圖4、圖6和圖7所示。從圖中可以看出:在正常條件下,和野生型日本晴nip相比,gbp突變體根系萎縮,主根長變短,單株分蘗數和種子數均低于野生型日本晴nip,在產量上有很大程度的降低。表明gbp在水稻根系生長以及產量生產方面發揮正向調節作用。
實施例3、轉gbp水稻的獲得及其性狀檢測
一、轉gbp水稻的獲得
1、重組載體pmdc32-35s::gbp的構建
利用gateway方法將實施例1中克隆得到的序列1所示的gbp基因連入pentrtm/sd/d-topo載體(invitrogen,貨號為1711243),得到重組載體pentrtm/sd/d-topo-gbp,并對其進行測序驗證。經過測序表明:克隆的gbp基因沒有任何點突。
將重組載體pentrtm/sd/d-topo-gbp、pmdc32載體(biovectorntcc)和重組酶(invitrogen)混勻,于22℃,過夜反應,使序列1所示的gbp基因重組到pmdc32載體的attr1(aaacaagtttgtacaaaaaa)和attr2(tttcttgtacaaagtgg)之間,得到重組載體pmdc32-35s::gbp。重組載體pmdc32-35s::gbp表達gbp蛋白。
2、重組菌的獲得
將重組載體pmdc32-35s::gbp轉入農桿菌eha105(biovectorntcc)中,得到重組菌pmdc32-35s::gbp/eha105。
3、轉gbp水稻的獲得
(1)用75%乙醇和2.5%次氯酸鈉消毒野生型nip水稻種子,然后均勻的鋪在誘導培養基上28℃避光培養28天,誘導愈傷組織。
(2)將誘導28天的愈傷組織來回猛搖幾次,從脫離的愈傷組織中挑選光滑、黃色并且較硬的大小在2-3mm的胚性愈傷,之后放在ms培養基上,28℃避光培養7天。
(3)刮取已活化3天的步驟2中獲得的重組菌pmdc32-35s::gbp/eha105,放入nbco液體培養基中,打散混勻,調od600至0.125。再將胚性愈傷放入上述nbco培養基中,靜止15-20分鐘,倒去菌液吸干均勻的鋪在已加濾紙的nbco共培養基中。于22℃避光培養3天。
(4)共培養愈傷用滅菌水洗三次,后用植物羧芐為500mg/l的滅菌水浸泡15分鐘,吸干放入選擇培養基中。
(5)挑取新長出的愈傷放入預分化培養基中,暗培養一周
(6)將(5)中暗培養的愈傷放入分化培養基,光照培養直到產生葉綠素;
(7)將產生葉綠素的陽性愈傷轉移到生根壯苗培養基中,28℃光照培養,直到長成陽性幼苗;
(8)將陽性幼苗移植到大田,收到的種子即為t1代;
(9)將t1代的種子用潮霉素篩選,將有抗性的小苗移植到水稻田,然后單株收種子即為t2代;
(10)將單株收到的t2代的種子分別用潮霉素篩選,查看種子萌發比例,全部萌發的即為轉基因純和株系。然后將全部萌發的t2代的苗轉移到大田,收種子即為t3代轉gbp水稻純合株系。
4、pcr鑒定
用引物gbp-f1:5′-gcgcactcggctctgcgttc-3′和gbp-f2:5′-acatcgcacaacctgaaggatggaa-3′對t3代轉gbp水稻純合株系進行pcr半定量鑒定。結果如圖5所示。t3代轉gbp水稻純合株系oe8、oe10和oe13中均高表達gbp基因。
二、轉gbp水稻的性狀檢測
分別將步驟一中獲得的陽性t3代轉gbp水稻純合株系oe8、oe10和oe13及野生型水稻日本晴(nip)種子在30℃黑暗培養箱中萌發四天,然后移植到營養液中,生長兩周,再將苗種植于水稻田,六個月的正常生長,每個不同品種的水稻取10株進行統計,實驗重復3次,結果取平均值。比較t3代轉gbp水稻純合株系和野生型水稻日本晴(nip)的根系生長情況,并統計單株分蘗數和種子數。
結果如圖1、圖2、圖3、圖4、圖6和圖7所示。從圖中可以看出:在正常條件下,和野生型日本晴nip相比,t3代轉gbp水稻純合株系oe8、oe10和oe13根系更加發達,主根長變長,單株分蘗數和種子數均高于野生型日本晴nip,在產量上有很大程度的提高。上述結果表明,gbp在水稻根系生長以及產量生產方面發揮正向調節作用。
序列表
<110>河北師范大學
<120>gbp蛋白及其編碼基因在調控植物產量中的應用
<160>2
<210>1
<211>1296bp
<212>dna
<213>人工序列
<220>
<223>
<400>1
atggcgacgatgtctcgccgcgcactcggctctgcgttcgcgggattcacgcggacacca60
gctatgactccgacggccaccttgccttcctcgtgcgcgtccccggcgcgtctcctgcgg120
tggcgccggagcgcgggtgtaggcgcccggcggttcgcgtccggccgcaacgcgcggatt180
agcatgagcctccgcgccggcatcgtcggcctgcccaacgtcggcaagtccacactcttc240
aatgccattgttgaaaatgggaaggcacaagctgcaaactttcccttctgcaccataaac300
cccaacgttggtgttgtggctatcccagatgctcgcttgcatgtgctctcaaaattaagc360
aagtctaaggagacaatcccaacatccatagagcttgtggatattgcaggtctcgtcaaa420
ggagcaagcaaaggagagggactaggaaaccaatttctttcgaacatccgtgaggttgat480
tccatccttcaggttgtgcgatgttttgaagatgatgatattgttcatgtgagtgggaaa540
gttgatcccaaatcagatattgatgtaattaatctggagcttatattttctgatcttgac600
cagatagagaaaagactggataagcttaaaaagagcaaaactaaagaccagcaagtaaag660
gtcaaggaacaagcagagaggactggattggaaaaaattcagactgtacttatggatgga720
aaacctgctagatctgttgatttggctgaccatgagaaagaagctatccaacatctttgt780
ctactaactatgaaacctgtcatttatgttgccaacgtaactgaatctgatcttgctgaa840
cctggtaacaaccctcatgtcaaagaggtagccaaactagcaacagacttggaatctggc900
atggttacaatatcagctcaggttgaggctgaacttgctgaactgccattagaagagaga960
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tggactattcttgcaggcatgactgcacctcaagcagcaggagttattcacagtgacttt1140
cagaaaggcttcattagagctgaaactgtatcatatgatgattttgtcgcggcgggttct1200
cttggagttgcaagggagaagggattgttgaggttggaagggaaggattacatcgtgcag1260
gaaggcgatgtcatgcttttccggttcaacgtttga1296
<210>2
<211>431
<212>prt
<213>人工序列
<220>
<223>
<400>2
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202530
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