專利名稱：與谷子株高基因緊密連鎖的分子標記SIsv0115的制作方法
技術領域：
本發明屬于分子生物學領域，涉及一種分子標記，具體地，涉及一種與谷子株高基 因緊密連鎖的分子標記。本發明還涉及該分子標記的引物、該分子標記在谷子株高基因定 位或谷子遺傳育種中的用途、一種谷子株高基因定位方法、以及一種谷子育種方法。
背景技術：
谷子(Setaria italica L. Beauv.)是起源于我國的重要糧食作物，主要在我國的 北方種植，在國家糧食生產和糧食安全中占有較為重要的地位。谷子是二倍體自花授粉作 物，其基因組較小，約470Mb，這些特性使其很適合作為基因組研究的對象。目前，遺傳連鎖圖譜的構建已成為基因定位、圖位克隆以及基因組結構與功能研 究的重要基礎。而分子標記又是構建遺傳連鎖圖譜的基礎。株高作為關系到作物高產和穩 產的重要農藝性狀，直接關系到品種的株型、抗倒伏性、區域布局和產量構成性狀。因此，迫 切需要發現與谷子株高基因緊密連鎖的分子標記。

發明內容
本發明人依據全基因組序列，經過大量的實驗和不懈的努力，提供了一種與谷子 (Setaria italica L. Beauv.)株高基因緊密連鎖的分子標記SIsvO 115，并由此提供了下述 發明本發明的一個方面涉及一種與谷子株高基因緊密連鎖的分子標記SIsv0115，其核 苷酸序列如seq id n0:1所示。其中加邊框部分為引物設計區段688bp
權利要求
1. 一種與谷子株高基因緊密連鎖的分子標記，其核苷酸序列如SEQ ID NO :1所示；或 者其為含有SEQ ID NO :1所示核苷酸序列的DNA片段。
2. 一種重組載體，其含有權利要求1所述的分子標記。
3. —種重組細胞，其含有權利要求2所述的重組載體。
4.權利要求1所述的分子標記的引物，其核苷酸序列如SEQIDNO 2和SEQ ID NO 3 所示。
5.權利要求1所述的分子標記的制備方法，包括下述步驟使用非矮株型的谷子的基因組DNA作為模板，以權利要求4所述的引物進行PCR擴增； 優選地，還包括將PCR擴增的產物進行純化的步驟；具體地，所述非矮株型的谷子為張谷1 號、張雜谷3號、或張雜谷3號自交產生的F2代中的非矮株型。
6.權利要求1所述的分子標記的檢測方法，包括下述步驟(1)根據權利要求1的分子標記的核苷酸序列設計引物；(2)以被檢測谷子的基因組DNA作為模板進行擴增；(3)判斷擴增產物中是否存在該分子標記。
7.權利要求1所述的分子標記在谷子株高基因定位或檢測中的用途。
8. 一種谷子株高基因定位的方法，包括使用權利要求1所述的分子標記的步驟。
9.權利要求1所述的分子標記在谷子輔助育種中的用途。
10. 一種谷子輔助育種方法，包括檢測權利要求1所述的分子標記的步驟。
全文摘要
本發明屬于分子生物學領域，涉及一種分子標記，具體地，涉及一種與谷子株高基因緊密連鎖的分子標記，其核苷酸序列如SEQ IDNO1所示，或者其為谷子基因組中含有SEQ ID NO1所示核苷酸序列的DNA片段。本發明還涉及該分子標記的引物、該分子標記在谷子株高基因定位或谷子遺傳育種中的用途、一種谷子株高基因定位方法、以及一種谷子育種方法。本發明發現了與谷子株高基因緊密連鎖的分子標記SIsv0115，將谷子基因組DNA序列與谷子株高基因聯系起來，更有利于谷子分子標記輔助育種體系的建立。
文檔編號C12N1/21GK102002497SQ20101055330
公開日2011年4月6日 申請日期2010年11月22日 優先權日2010年11月22日
發明者全志武, 夏秋菊, 張耕耘, 彭小華 申請人:深圳華大基因科技有限公司