一種金針菇f3菌種的ssr標記指紋圖譜與應用的制作方法
【專利摘要】本發明涉及一種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜與應用，該指紋圖譜由6對基于金針菇基因組序列開發的SSR標記的特異等位片段組合而成。應用包括：對金針菇菌種進行SSR標記擴增，將得到的帶型與指紋圖譜對照，與該指紋圖譜一致即為F3菌種。本發明與常規形態學檢測、拮抗試驗、出菇試驗相比，具有檢測時間短、準確性高、可重復性好的優點，在收集的我國24個主栽金針菇菌種中具有F3菌種的專一性。
【專利說明】—種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜與應用

【技術領域】
[0001]本發明屬于金針菇菌種的檢測領域，特別涉及一種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜與應用。

【背景技術】
[0002]金針燕[Flammulina velutipes (Fr.) Sing.]又名金燕、樸燕、構菌、青杠菌、毛柄金錢菌，在分類上屬于傘菌目白蘑科小火焰菌屬。金針菇分布廣泛，營養豐富，是一種經濟價值很高的食用菌和藥用菌，也是市場上十分走俏的天然保健食品之一。金針菇是中國主要栽培食用菌和現代工廠化生產主要食用菌之一，2013年國內工廠化日生產量達到2700噸。
[0003]優質菌種在金針菇單產和質量中的貢獻率舉足輕重，這決定了金針菇菌種在金針菇產業中的重要地位。1999年我國簽署了《國際植物新品種保護法》，這不僅要求我們尊重其它國家的品種知識產權，同時也要加強保護我們國家自己的品種知識產權，為了建立食用菌新品種登記制度來真正保護我國的品種產權，必須首先建立成熟的品種鑒定技術，為新品種登記奠定基礎。尤其日本2004年4月I日開始實行《種苗法修正案》，對我國食用菌尤其是金針菇的生產構成了極大的威脅。就國內而言，金針菇栽培菌種“同種異名，異種同名”的現象，不僅給菇農帶來了極大的損失，影響了他們的栽培積極性，也極大地影響了中國金針菇產業的發展；而且，隨著大規模的工廠化栽培方式的出現，對金針菇栽培菌株質量的要求越來越高，需要發展更為簡便、快速、準確的菌株鑒定技術，以保證每批次的用種都準確無誤。
[0004]面對這種局勢，就需要我們進一步加快菌種鑒定技術的研究，在金針菇的研究中建立更為有效的菌種鑒定體系。


【發明內容】

[0005]本發明所要解決的技術問題是提供一種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜及其構建方法與應用，該指紋圖譜與常規形態學檢測、拮抗試驗、出菇試驗相比，具有檢測時間短，準確性高，重復性好的優點。
[0006]本發明的一種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜，該指紋圖譜由6對SSR標記組成，是基于金針菇基因組簡單重復序列片段開發SSR引物，擴增帶型好，重復性高的SSR引物，標記詳細信息如表1。
[0007]表1 SSR標記詳細信息列表
[0008]

【權利要求】
1.一種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜，其特征在于:該指紋圖譜由6對基于金針菇基因組序列開發的SSR標記的特異等位片段組合而成，6對SSR標記在金針菇F3菌種上擴增的等位片段信息具體為: Fv_fp0001的等位片段的數量為2，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為700bp ;等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為680bp ； Fv_fp0002的等位片段的數量1，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為1300bp, Fv_fp0003的等位片段的數量為1，等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為680bp ； Fv_fp0004的等位片段的數量2，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為1250bp ;等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為1200bp ； Fv_fp0005的等位片段的數量4，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為IlOObp,等位片段2相對于50bp DNA ladder的分子量為800bp ;等位片段3相對于50bpDNA ladder的分子量為530bp ;等位片段4相對于50bp DNA ladder的分子量為500bp ； Fv_fp0006的等位片段的數量為2，等位片段I相對于50bp DNA ladder的分子量為400bp ;等位片段3相對于50bp DNA ladder的分子量為360bp。
2.根據權利要求1所述的一種金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜，其特征在于:所述6對SSR標記等位片段的特異編號組合為:(1+2) 12 (1+2) (1+2+3+4) (1+3)。
3.—種如權利要 求1所述的金針菇F3菌種的SSR標記指紋圖譜的應用，其特征在于:應用于鑒定金針菇F3菌種的特異等位變異組合以及鑒定金針菇F3菌種相對于其他國審金針菇品種的特異性。
【文檔編號】C12Q1/04GK104131086SQ201410318267
【公開日】2014年11月5日 申請日期:2014年7月4日 優先權日:2014年7月4日
【發明者】尚曉冬, 陸歡, 王瑞娟, 章爐軍, 徐珍, 張丹, 譚琦 申請人:上海市農業科學院