本發(fā)明屬于植物基因工程,尤其涉及一種基于rna病毒誘導的葉菜類蔬菜沉默體系及其構(gòu)建方法和應用。
背景技術(shù):
1、病毒誘導的基因沉默技術(shù)(virus-induced?gene?silencing,vigs)是一種快速驗證植物基因功能的方法。vigs能夠特異性結(jié)合并降解轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mrna,引起目的基因沉默,對沉默個體進行分析即可確定基因的功能。vigs一般在整個植株水平引起基因沉默,該方法無需進行植物穩(wěn)定遺傳轉(zhuǎn)化,且不改變基因組dna序列,但可以產(chǎn)生與突變體相似的表型特征,是一種快速有效解析基因功能的方法。
2、上海青(brassica?rapa?subsp.chinensis)又稱小白菜,隸屬于十字花科蕓薹屬,富含抗壞血酸,硫代葡萄糖苷、蘿卜硫素等營養(yǎng)物質(zhì),具有較高的營養(yǎng)價值。芥菜(brassicajuncea(l.)czern.)隸屬于十字花科蕓薹屬,富含維生素,且具有利肺豁痰,消腫散結(jié)等功效。目前并沒有關于以上海青和芥菜為研究對象,通過vigs系統(tǒng)對其內(nèi)源pds基因進行沉默的報道。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、有鑒于此,本發(fā)明的目的在于提供一種基于rna病毒誘導的葉菜類蔬菜vigs沉默體系,將沉默體系導入上海青和芥菜葉片,應用vigs技術(shù)沉默了內(nèi)源pds基因。
2、為了實現(xiàn)上述發(fā)明目的,本發(fā)明提供了以下技術(shù)方案:
3、一種基于rna病毒誘導的葉菜類蔬菜vigs沉默體系,包括載體ptrv1和含有目的基因片段的重組載體ptrv2,所述目的基因片段包括brpds、bjupds-g和bjupds-c中的任意一種。
4、優(yōu)選的,所述目的基因片段brpds的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,所述目的基因片段bjupds-g的核苷酸序列如seq?id?no.2所示,所述目的基因片段bjupds-c的核苷酸序列如seq?id?no.3所示。
5、優(yōu)選的,brpds片段的克隆方法包括:提取上海青總rna,反轉(zhuǎn)錄得到cdna第一鏈,以此鏈為模板,以seq?id?no.10和seq?id?no.11所示的核苷酸序列為引物,擴增獲得帶有同源臂的brpds片段;bjupds-g片段的克隆方法包括:提取抱子芥總rna,反轉(zhuǎn)錄得到cdna第一鏈,以此鏈為模板,以seq?id?no.12和seq?id?no.13所示的核苷酸序列為引物,擴增獲得帶有同源臂的bjupds-g片段;bjupds-c片段的克隆方法包括:提取結(jié)球芥總rna,反轉(zhuǎn)錄得到cdna第一鏈,以此鏈為模板,以seq?id?no.14和seq?id?no.15所示的核苷酸序列為引物,擴增獲得帶有同源臂的bjupds-c片段。
6、本發(fā)明的另一目的在于提供所述的葉菜類蔬菜vigs沉默體系在沉默葉類蔬菜pds基因中的應用,將含有目的基因片段的重組載體ptrv2轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5α感受態(tài)細胞制備重組質(zhì)粒,將重組質(zhì)粒和載體ptrv1分別轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌gv3101感受態(tài)細胞,獲得含載體ptrv1的菌液和含重組載體ptrv2的菌液,將含載體ptrv1的菌液和含重組載體ptrv2的菌液混合獲得侵染液,將侵染液注射到葉菜類蔬菜葉片。
7、優(yōu)選的,所述葉類蔬菜為上海青、抱子芥和結(jié)球芥。
8、優(yōu)選的,所述侵染液含有連接brpds片段的重組載體ptrv2時,注射到上海青葉片;所述侵染液含有連接bjupds-g片段的重組載體ptrv2時,注射到抱子芥葉片;所述侵染液含有連接bjupds-c片段的重組載體ptrv2時,注射到結(jié)球芥葉片。
9、優(yōu)選的,注射到上海青葉片時,所述侵染液od600=0.3~1.0;注射到抱子芥葉片時,所述侵染液od600=0.5~0.8;注射到結(jié)球芥葉片時,所述侵染液od600=0.5~1.0。
10、優(yōu)選的,含載體ptrv1的菌液和含重組載體ptrv2的菌液按體積比1:1混合。
11、優(yōu)選的,所述葉菜類蔬菜為6片真葉期。
12、本發(fā)明的另一目的在于提供一種檢測葉類蔬菜pds基因的試劑盒,所述試劑盒包括:檢測上海青brpds基因的引物組,所述引物組的核苷酸序列如seq?id?no.20和seq?idno.21所示;檢測抱子芥bjupds-g基因的引物組,所述引物組的核苷酸序列如seq?id?no.24和seq?id?no.25所示;檢測結(jié)球芥bjupds-c基因的引物組,所述引物組的核苷酸序列如seqidno.26和seq?id?no.27所示。
13、相對于現(xiàn)有技術(shù),本發(fā)明具有如下有益效果:
14、本發(fā)明提供了一種基于rna病毒誘導的葉菜類蔬菜vigs沉默體系,通過構(gòu)建ptrv2-brpds、ptrv2-bjupds-g和ptrv2-brpds-c沉默表達載體,將沉默表達載體導入上海青和芥菜葉片,成功地應用vigs技術(shù)沉默了內(nèi)源pds基因,導致上海青和芥菜植株產(chǎn)生不同程度的白化表型,為研究上海青和芥菜基因功能提供了技術(shù)支持,有助于加快上海青和芥菜功能基因研究的速度。
1.一種基于rna病毒誘導的葉菜類蔬菜vigs沉默體系,其特征在于,包括載體ptrv1和含有目的基因片段的重組載體ptrv2,所述目的基因片段包括brpds、bjupds-g和bjupds-c中的任意一種。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的葉菜類蔬菜vigs沉默體系,其特征在于,所述目的基因片段brpds的核苷酸序列如seq?id?no.1所示,所述目的基因片段bjupds-g的核苷酸序列如seqid?no.2所示,所述目的基因片段bjupds-c的核苷酸序列如seq?id?no.3所示。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的葉菜類蔬菜vigs沉默體系,其特征在于,brpds片段的克隆方法包括:提取上海青總rna,反轉(zhuǎn)錄得到cdna第一鏈,以此鏈為模板,以seq?id?no.10和seqid?no.11所示的核苷酸序列為引物,擴增獲得帶有同源臂的brpds片段;
4.權(quán)利要求1~3任意一項所述的葉菜類蔬菜vigs沉默體系在沉默葉類蔬菜pds基因中的應用,其特征在于,將含有目的基因片段的重組載體ptrv2轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5α感受態(tài)細胞制備重組質(zhì)粒,將重組質(zhì)粒和載體ptrv1分別轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌gv3101感受態(tài)細胞,獲得含載體ptrv1的菌液和含重組載體ptrv2的菌液,將含載體ptrv1的菌液和含重組載體ptrv2的菌液混合獲得侵染液,將侵染液注射到葉菜類蔬菜葉片。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應用,其特征在于,所述葉類蔬菜為上海青、抱子芥和結(jié)球芥。
6.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應用,其特征在于,所述侵染液含有連接brpds片段的重組載體ptrv2時,注射到上海青葉片;所述侵染液含有連接bjupds-g片段的重組載體ptrv2時,注射到抱子芥葉片;所述侵染液含有連接bjupds-c片段的重組載體ptrv2時,注射到結(jié)球芥葉片。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的應用,其特征在于,注射到上海青葉片時,所述侵染液od600=0.3~1.0;注射到抱子芥葉片時,所述侵染液od600=0.5~0.8;注射到結(jié)球芥葉片時,所述侵染液od600=0.5~1.0。
8.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應用,其特征在于,含載體ptrv1的菌液和含重組載體ptrv2的菌液按體積比1:1混合。
9.根據(jù)權(quán)利要求4所述的應用,其特征在于,所述葉菜類蔬菜為6片真葉期。
10.一種檢測葉類蔬菜pds基因的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括: