本發明涉及家禽遺傳育種與繁殖，具體涉及一種與雞腸炎沙門氏菌感染相關生物標記物及其應用。

背景技術：

1、腸炎沙門氏菌(salmonella?enterica?serovar?enteritidis,s.enteritidis)是一種常見的人畜共患革蘭氏陰性食源性病原菌，無宿主特異性但具有侵害性，主要寄生在動物和人類的腸道內。腸炎沙門氏菌感染會在腸道中定殖并侵犯腸上皮細胞，可能導致腸道壁的損傷，表現為腹瀉、食欲減退、體重下降等癥狀，甚至引起敗血癥等嚴重并發癥，從而干擾雞的免疫系統，使其對其他病原的抵抗力下降，增加感染其他病原的風險。腸炎沙門氏菌感染后導致雞死亡率升高，降低生長速度；影響蛋的生產性能，甚至造成雞肉產品的質量下降。而且腸炎沙門氏菌是一個重要的食源性病原體，人類通過食用受感染的禽肉或雞蛋可能會感染沙門氏菌，引發食物中毒，對畜牧業和人類健康危害極大。傳統的防治腸炎沙門氏菌的方法，如注射抗生素、疫苗等無法從根本上解決畜禽的染病問題，但腸炎沙門氏菌感染受遺傳調控，解析雞對腸炎沙門氏菌感染的調控機制，進而提高雞對腸炎沙門氏菌感染的遺傳抗性，是防控腸炎沙門氏菌感染的有效途徑。

2、宿主的遺傳背景對腸炎沙門氏菌的抗性有著深遠的影響，在生產性能和生活力方面經歷了高強度選擇后，雞的品種和品系中仍保留對腸炎沙門氏菌的免疫應答和抗病性方面的差異，為從遺傳上提高家禽抗病性提供了可能。鑒定對腸炎沙門氏菌具有抗性的雞，有利于降低禽產品(如雞肉、雞蛋)中沙門氏菌的污染，減少腸炎沙門氏菌在人群中的傳播，保障消費者的食品安全，確保養殖業的健康運行和可持續發展。

3、個體轉錄因子特征的變化能夠反映動物機體對腸炎沙門氏菌感染的反應，將轉錄因子與生物表型聯系，可以為發現新的生物標志物提供線索。盲腸是腸炎沙門氏菌的首要入侵部位，盲腸組織特征的變化可以在一定程度上反映動物是否感染腸炎沙門氏菌，其中，轉錄因子可作為反映腸炎沙門氏菌感染的潛在生物標志物。因此，了解動物的轉錄因子與腸炎沙門氏菌感染之間的關系對雞的遺傳育種與繁殖具有重要意義。然而，至今尚未報道與雞對腸炎沙門氏菌感染抗性相關的生物標記物。

技術實現思路

1、針對上述現有技術，本發明的目的是提供一種與雞腸炎沙門氏菌感染相關生物標記物及其應用。本發明的生物標記物可以實現對雞對腸炎沙門氏菌的感染抗性進行鑒定，其敏感性高、特異性強，有望成為腸炎沙門氏菌感染抗性鑒定的一種新手段。

2、為實現上述目的，本發明采用如下技術方案：

3、本發明的第一方面，提供runx2作為靶標在制備鑒定畜禽對腸炎沙門氏菌感染抗性的產品中的應用。

4、上述應用中，runx2的氨基酸序列如seq?id?no.1所示；具體如下：

5、masnslfssvtpcqqnffwdpstsrrfsppssslqpgkmsevspvvvaqqqqqqqqqqqqeaavprlrphdnrtmveiiadhpaelvrtdspnflcsvlpshwrcnktlpvafkvvalgevpdgtvvtvmagndenysaelrnasavmknqvarfndlrfvgrsgrgksftltitvltnppqvatyhraikvtvdgpreprrhrqklddskpslfperlsdlgriphpsmrvgvptqsprpslnsapspfnpqgqsqitdprqaqssppwsydqsypsylsqmtspsihsttplsstrgtglpaitdvprrlsgaselgpfsdprqftsissltesrfsnprmhypatftytppvtsgmslgmsatthyhtylpppypgssqnqsgpfqtsstpylyygtssgsyqfpmvpggdrspsrmlppctttsngstllnpnlpnqsdgveadgshsssptvlnssgrmdesvwrpy。

6、上述應用中，優選的，所述畜禽為雞。

7、本發明的第二方面，提供runx2基因作為靶基因在如下(1)或(2)中的應用：

8、(1)制備鑒定畜禽對腸炎沙門氏菌感染抗性的產品；

9、(2)培育抗腸炎沙門氏菌感染的畜禽品種。

10、上述應用中，runx2基因的核苷酸序列如seq?id?no.2所示；具體如下：

11、atggcatcaaacagcctcttcagctccgtgacaccatgtcagcaaaacttcttttgggatcccagcaccagccggaggttcagccccccctccagcagcctgcagcccggcaagatgagcgaggtcagcccggtcgtagtggcccaacagcagcagcagcagcaacagcaacagcagcaagaagccgccgtgccccggctgcggccgcacgataaccgcaccatggtggagatcatcgccgaccacccggccgagttggtccgcaccgacagccccaacttcctgtgctccgtgctgccctcgcactggcgctgcaataagaccctcccggtggccttcaaggtggtggccttaggagaagtgcccgatgggaccgtggtcaccgtgatggctgggaacgacgagaactactccgcggagctgcgaaatgcttctgctgtgatgaagaaccaggtggccagattcaatgacctgcgattcgtgggcaggagtggcagagggaagagctttactttgacaataactgtcctgacaaatcccccccaagtcgctacataccacagagccataaaggtgacggtggatgggccgagggagccaagaaggcacagacagaagcttgatgactctaaacctagtttgttccctgaacgcctcagtgatttagggcgcattcctcatcccagtatgagagtaggggtcccgacccagagcccacggccctctctgaactctgcaccaagtccttttaatccacaaggacagagtcagattacagaccccaggcaggcgcagtcgtccccgccgtggtcctatgatcagtcgtacccgtcctacttgagccagatgacttcgccgtccattcactccacgactcccctgtcctccacccgaggcacaggacttccagccatcaccgacgtgccccgacgcctctcaggtgcttccgagctgggcccattttcagatcccaggcagttcacaagcatttcatccctcactgagagccgcttctccaacccacgaatgcactatccagccacctttacctatacaccgcccgtcacctcaggcatgtcactgggtatgtccgcaaccactcactaccacacctacctgccaccaccctaccccggctcctcccaaaaccaaagtggacctttccagaccagcagcactccatatctctactatggcacttcgtcgggatcgtaccagttccccatggtgccgggaggggaccgctccccttccaggatgcttcctccgtgcaccaccacgtccaacggcagcacgctgctaaacccaaacttgcccaaccagagtgacggtgtggaggcggatggcagccacagcagctccccaactgttttgaattctagtggcaggatggatgagtccgtttggaggccgtactga。

12、本發明研究發現：runx2在對腸炎沙門氏菌易感和抗性的雞中差異性表達，且在易感雞中的表達量顯著高于抗性雞，因此，可以通過檢測runx2基因的表達量來對雞的腸炎沙門氏菌的感染抗性進行鑒定，以及抗腸炎沙門氏菌感染的抗病品種選育。

13、本發明的第三方面，提供檢測runx2的試劑在制備鑒定畜禽對腸炎沙門氏菌感染抗性的產品中的應用。

14、優選的，所述試劑為檢測盲腸t細胞中runx2含量的試劑。例如：檢測runx2含量的elisa試劑盒、western?blot試劑盒、免疫組織化學試劑(ihc)等。

15、本發明的第四方面，提供檢測runx2基因的試劑盒在如下(1)或(2)中的應用：

16、(1)制備鑒定畜禽對腸炎沙門氏菌感染抗性的產品；

17、(2)培育抗腸炎沙門氏菌感染的畜禽品種。

18、優選的，所述檢測runx2基因的試劑盒為熒光定量pcr試劑盒。

19、本發明的第五方面，提供一種鑒定雞對腸炎沙門氏菌感染抗性的方法，包括以下步驟：

20、檢測待測雞中runx2基因的表達量，runx2基因表達量低的雞對腸炎沙門氏菌感染的抗性高于runx2基因表達量高的雞。

21、本發明的有益效果：

22、本發明首次研究發現：runx2轉錄因子在腸炎沙門氏菌感染后盲腸t細胞中含量有顯著差異，runx2在易感組中的表達量遠遠高于抗性組，表明是腸炎沙門氏菌感染后的易感基因，若雞表現出腹瀉、食欲不振等典型腸炎癥狀，并且檢測到runx2表達水平顯著升高，這可能是易感染腸炎沙門氏菌的雞的標志；若雞未表現出相應癥狀且runx2表達水平未著升高，表明該雞對腸炎沙門氏菌存在抗性，通過單細胞轉錄組學技術可以在分子水平上實現對雞對感染腸炎沙門氏菌的抗性進行鑒定，為培育抗腸炎沙門氏菌感染的家禽品種提供了技術上的支持。