1.一種敲除豬胚胎p66shc基因的方法,其特征在于:所述方法包括以下操作步驟,
(1)設計 Oligo DNA 序列
在p66shc基因的表達 DNA 區域中設計一對 20bp 左右的 oligo DNA,可以通過在線工具設計;按照得分優先選擇1-3對的Oligo合成;另外,需在位點上下游各設計一條引物,用于后續PCR或測序檢測陽性克隆,引物能擴增約300bp的DNA片段,上游引物距突變位點約100bp,下游引物距突變位點約200bp;將設計后的序列送到值得信賴的公司合成,純化級別為PAGE,準備進行下面的實驗;
(2)Oligo的連接
將合成的 2 條單鏈 Oligo DNA 稀釋至 1μg/μl后,退火形成雙鏈 DNA,再與載體連接;pGLKO(Genloci公司購買)是線性載體,無需酶切處理,可直接用于 T4 DNA連接酶連接反應;
(3)構建好的質粒轉化與擴增
將上述產物按照常規分子克隆技術方法轉化到大腸桿菌感受態細胞,篩選陽性克隆,挑取陽性克隆擴增培養后,大量提取質粒,得到構建好的包含敲除p66shc基因的CRISPR-Cas9系統的表達質粒,保存備用;
(4)質粒轉染細胞驗證敲除效率
首先解凍培養293T細胞,待生長培養傳代2次后,進行轉染操作;共轉染前提,稀釋至質粒濃度為1μg/μl,轉染前48小時,接種細胞至備用生產慢病毒的孔板或是培養皿中,轉染時,細胞匯合度約為70%-80%為最佳感染狀態,活力≥95%以上;以轉染時間為起始點,一次收獲時間為24h后收獲上清,保存于4℃下,如長期保存則在-84℃下;接種適量靶細胞,加入上述收集的含有質粒的病毒顆粒溶液,混勻;將靶細胞有限稀釋后,分到96孔板中進行單克隆培養,待細胞長好后,取 1000 個左右的細胞,提基因組;然后使用T7核酸內切酶初步篩選陽性克隆,并且對篩選后的陽性克隆進行測序分析,并對堿基缺失結果進行比對分析,從而可以驗證該p66shc基因CRISPR-Cas9系統的有效性;
(5)p66shc基因的CRISPR-Cas9系統構建
設計好上述質粒上Cas9的引物,試劑盒mMESSAGEmMACHINE Ultra Kit (Ambion)其擴增上述得到的Cas9 mRNA,同時用設計好的引物利用試劑盒MEGAshortscript (Ambion)擴增gRNA的序列;得到PCR產物后分別用1.5% 凝膠進行電泳,辨認其得到的片段大小;得到p66shc基因的CRISPR-Cas9系統mRNA 后,保存備用;
(6)豬p66shc基因敲除胚胎生產
把構建好的豬胚胎,在受精后17h進行胞質注射上述p66shc基因的CRISPR-Cas9系統mRNA,按照濃度為10ng/ul,其每個胚胎注射的總量為3 ul;在培養后,利用后續的系統檢驗該基因的敲除效果,評價其敲除效率;
(7)p66shc基因敲除結果驗證
PCR克隆囊胚后的p66shc基因DNA序列(一般產物在0.5-1K為好),其引物設計注意得到的產物的突變位點不要位于中間比較好,利用T7內切酶酶切后,凝膠電泳分析,確認其是不是已經敲除;同時,還可以結合利用PCR產物測序后對比分析得出結論。