本發明屬于生物工程,具體涉及木薯memyb基因、受ga誘導myb轉錄因子功能驗證的方法。
背景技術:
1、木薯(manihot?esculenta?crantz)是世界三大薯類作物之一,起源于熱帶美洲,因其適應性強,耐旱、耐貧瘠等優勢而被廣泛栽培于熱帶和部分亞熱帶地區,是熱帶濕地低收入農戶的主要食糧。自2008年國家木薯產業技術體系成立以來,越來越多的科研工作者致力于木薯研究。木薯全產業鏈的研究包含木薯種質資源、木薯遺傳育種、木薯栽培、木薯采后加工等方面。而關鍵基因的發掘對木薯育種乃至全產業鏈的研究有重要意義。myb轉錄因子是植物代謝網絡中最重要的轉錄調控因子之一,控制植物的生長發育、信號轉導、次生代謝以及在生物和非生物脅迫中也產生重要作用。gamyb是一個受赤霉素ga調控的編碼一個r2r3-myb?dna結合結構域的myb類轉錄因子,在植物生長發育過程中起著重要作用,是ga信號應答途徑中首個被鑒定出來的正向作用的因子。ga是一類重要的植物激素,其在植物開花誘導、果實發育以及次生代謝產物的合成等過程起著重要作用。本研究提供一種受ga調控的myb轉錄因子,對木薯次生代謝物如花青素、類胡蘿卜素等的合成調控有著重要作用。
2、基因功能驗證一般采用本底遺傳轉化的方式,但是存在周期長的缺陷,甚至有一些植物自身遺傳轉化體系尚未成熟。
技術實現思路
1、針對現有技術存在的不足,本發明提供一種受ga誘導myb轉錄因子功能驗證的方法,通過在真核酵母種驗證基因功能,具有快速、可靠的優點,為進一步深入研究基因的功能奠定基礎。
2、為實現上述目的,采用以下技術方案:提供一種受ga誘導myb轉錄因子功能驗證的方法,包括以下步驟:
3、步驟s1.megamyb基因的克隆;通過pcr方法擴增獲得含有堿基序列1533bp片段的木薯megamyb基因;
4、步驟s2.megamyb基因的亞細胞定位;
5、步驟s3.megamyb基因的酵母自激活驗證;
6、步驟s4.megamyb基因的ga誘導功能驗證;
7、其中,步驟s4具體方法包括:
8、s4-1.采用同源重組方法,將megamyb基因構建到酵母表達載體pdr196中,構建好的重組載體分別命名為pdr196-megamyb,將重組質粒轉化至酵母菌株w303;
9、s4-2.pdr196-megamyb酵母表達載體ga3誘導表達。
10、優選地,步驟s1中,采用pcr的方法,sc9木薯葉片cdna為模板,設計特異引物擴增megamyb基因,全長擴增引物的正向引物megamyb-f為atgagcaaaatgacaaatgg,反向引物megamyb-r為ctagcattcgctatcaatat。
11、優選地,步驟s2中,megamyb基因的亞細胞定位引物的正向引物megamyb-gfp-f為
12、agtggtctctgtccagtcctatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-gfp-r為
13、ggtctcagcagaccacaagtctagcattcgctatcaatat。
14、優選地,步驟s3中,megamyb基因的酵母自激活引物的正向引物megamyb-bd-f為
15、atggaggccgaattcatgagcaaaatgacaaat,
16、反向引物megamyb-bd-r為
17、cgacggatccccgggctagcattcgctatcaatat。
18、優選地,步驟s4-1具體方法包括:
19、s4-1-1.制備w303感受態細胞
20、保存的w303菌種在固體培養基ypda上劃線,30℃培養3天,挑取單菌落接種至ypda液體培養基中,od600達到0.4~0.5后,3000g離心5分鐘,棄去上清,用10ml溶液a重懸菌體,3000g離心5分鐘,棄去上清;在沉淀中加入1ml1*te/liac進行重懸,即獲得酵母感受態細胞,按50μl分裝于無菌凍存管備用;
21、s4-1-2.轉化w303
22、配置預混液,取360μl預混液加入感受態細胞w303中,高速混勻,使酵母細胞完全懸浮于液體中;置于30℃水浴熱激45~60分鐘,每10-15分鐘混勻一次,結束后3000g離心3分鐘,棄上清,用0.9%nacl重懸后涂于sd+葡萄糖固體板上,30℃倒置培養2~3天。
23、優選地,步驟s4-2具體方法為:挑選陽性克隆加入到sd/-ura液體培養基中,30℃,220rpm搖動培養過夜,調整至od600至1.0,依次稀釋10倍,100倍,1000倍,分別取5μl點在sd/-ura+10mm?ga3平板上,待吸收完全后30℃培養箱中培養3天;以正常培養作為對照,比較轉pdr196-megamyb和pdr196空載體質粒的酵母菌株的生長情況;說明megamyb在能在ga3條件下生長比對照好。
24、優選地,megamyb基因的酵母功能驗證引物的正向引物megamyb-pdr196-f為
25、atataccccagcctcgatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-pdr196-r為
26、cgataagcttgatatcctagcattcgctatcaat。
27、本發明另一目的在于提供一種木薯megamyb基因,采用pcr方法擴增得到其核苷酸序列如seq?id?no:1所示的木薯megamyb基因。
28、本發明具有以下的有益效果:
29、1.本發明通過pcr方法,設計全長擴增引物擴增獲得含有堿基序列1533bp片段的木薯megamyb基因。
30、2.本發明通過設計megamyb的亞細胞定位引物,megamyb定位在細胞核中。
31、3.本發明通過設計megamyb的自激活引物,采用酵母自激活驗證方法,顯示與pgbkt7(bd)-megamyb對pgadt7(ad)無激活功能,與空ad/bd一致,不存在互作關系,即megamyb無自激活活性。
32、4.本發明通過設計megamyb的酵母功能驗證引物,采用ga誘導功能驗證方法,以正常培養作為對照,比較轉pdr196-megamyb和pdr196空載體質粒的酵母菌株的生長情況。結果顯示pdr196-megamyb在ga3條件下生長比對照好,megamyb能受ga誘導。
1.一種受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于,包括以下步驟:
2.根據權利要求1所述的受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于:步驟s1中,設計特異引物擴增megamyb基因,全長擴增引物的正向引物megamyb-f為atgagcaaaatgacaaatgg,反向引物megamyb-r為ctagcattcgctatcaatat。
3.根據權利要求1所述的受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于:步驟s2中,megamyb基因的亞細胞定位引物的正向引物megamyb-gfp-f為agtggtctctgtccagtcctatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-gfp-r為ggtctcagcagaccacaagtctagcattcgctatcaatat。
4.根據權利要求1所述的受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于:步驟s3中,megamyb基因的酵母自激活引物的正向引物megamyb-bd-f為atggaggccgaattcatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-bd-r為cgacggatccccgggctagcattcgctatcaatat。
5.根據權利要求1所述的受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于,步驟s4-1具體方法包括:
6.根據權利要求1所述的受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于,步驟s4-2具體方法為:挑選陽性克隆加入到sd/-ura液體培養基中,30℃,220rpm搖動培養過夜,調整至od600至1.0,依次稀釋10倍,100倍,1000倍,分別取5μl點在sd/-ura+10mm?ga3平板上,待吸收完全后30℃培養箱中培養3天;以正常培養作為對照,比較轉pdr196-megamyb和pdr196空載體質粒的酵母菌株的生長情況;說明megamyb在能在ga3條件下生長比對照好。
7.根據權利要求6所述的受ga誘導的木薯myb轉錄因子功能驗證方法,其特征在于:megamyb基因的酵母功能驗證引物的正向引物megamyb-pdr196-f為atataccccagcctcgatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-pdr196-r為cgataagcttgatatcctagcattcgctatcaat。
8.一種木薯megamyb基因,其特征在于:采用權利要求1的pcr方法擴增得到其核苷酸序列如seq?id?no:1所示的木薯megamyb基因。