本發明涉及植物病毒學和分子生物學,具體涉及一種含有黃瓜花葉病毒fny分離物突變型rna1的質粒載體及其應用。
背景技術:
1、在農業生產中植物病毒病危害植物的程度僅次于真菌性病害,現已發現700多種植物病毒病,危害147種作物,僅蔬菜上就發現80多種(郭萬卓等,2010)。由于植物沒有完整的免疫系統且缺少有效防治藥劑和措施,植物病毒病的防治較為困難,一旦流行暴發,就會造成慘重損失。
2、通過對交叉保護研究的不斷深入,弱毒疫苗防治技術越來越受到人們的關注,并不斷發展突破。一種病毒通常存在多種株系,在侵染植物后不表現或只表現輕微病毒病癥狀的株系,稱為弱毒株系。在病毒的弱毒株系預先侵染植物后,誘導植物自身的免疫系統,而當再次受到同種病毒侵染時就會刺激“免疫”,免受強毒株系的侵害(婁虎等,2017)。
3、在研制弱毒疫苗的過程中,為實現安全、高效和穩定的交叉保護防治效果,對新構建的疫苗需要有如下要求:一是所創制的弱毒疫苗應為弱致病性,接種到植物中不會產生明顯癥狀,不會對植物的生長狀況產生影響;二是創制弱毒疫苗的基礎載體應具有廣寄主特性,對各種植物都應具備一定的侵染能力,且能夠抵御多種病毒的強毒株系的再侵染;三是弱毒疫苗預先接種后,應在一定期限內具備良好的遺傳穩定性,能夠維持疫苗長時間的免疫效果。
4、黃瓜花葉病毒(cucumber?mosaic?virus,cmv)是目前已知的寄主范圍最廣的植物病毒之一。黃瓜花葉病毒由三個基因組rna1、rna2、rna3以及亞基因組rna4和rna4a組成(sivakumaran?et?al.,2002)。其中,rna1編碼一種稱為1a的蛋白質。蛋白1a的序列是高度保守的,有兩個功能結構域,n端結構域具有甲基轉移酶活性,用于向基因組和亞基因組rna的5'末端添加帽結構,而1a蛋白的c端結構域是一種假定的解旋酶,其功能是“解開”病毒復制過程中產生的雙鏈rna。rna2編碼2a和2b蛋白,2a蛋白具有rna依賴性rna聚合酶(rdrp)活性,并與1a蛋白一起參與病毒復制過程(palukaitis?et?al.,1992;rozanov?et?al.,1992);2b蛋白從rna2的3′部分中的亞基因組rna鏈稱為rna4a翻譯而來,cmv2b蛋白參與長距離病毒運動、全身癥狀的表達和基因沉默的抑制。rna3編碼亞基因組rna4表達3a蛋白和外殼蛋白(cp),3a蛋白與病毒在宿主中的細胞間運動和長距離運輸有關,因此它也被稱為運動蛋白(mp)。cp是唯一與病毒顆粒相關的蛋白質,也是蚜蟲媒介傳播的唯一決定因素(nagano?et?al.,2001;llamas?et?al.,2006)。
5、黃瓜花葉病毒寄主范圍廣泛、分離物資源豐富,三分體基因組賦予多位點突變和假重組選擇,具備開發弱毒疫苗載體的良好潛力。前期研究中主要針對黃瓜花葉病毒rna2進行突變改造,構建得到遺傳穩定、交叉保護效果良好的cmv為骨架的弱毒疫苗,但是,針對黃瓜花葉病毒rna1構建的弱毒疫苗載體還很少見有報道。
技術實現思路
1、針對上述現有技術,本發明的目的是提供一種含有黃瓜花葉病毒fny分離物rna1的突變型質粒載體及其應用。本發明對黃瓜花葉病毒fny分離物的rna1進行了結構改造,使其具有弱毒性;將其作為疫苗載體,至少可以容納200bp的外源片段并保持遺傳穩定性,為開發多價弱毒疫苗提供了基礎。
2、為實現上述目的,本發明采用如下技術方案:
3、本發明的第一方面,提供一種含有黃瓜花葉病毒fny分離物突變型rna1的質粒載體,將其命名為pccfr1-3um2,所述質粒載體含有cmvfny分離物突變型rna1。
4、所述cmvfny分離物突變型rna1是在rna1的3079-3080位核苷酸之間插入多克隆酶切位點ggatccgtcgaccccggg(bamh?i、sali、sma?i);cmvfny分離物突變型rna1的核苷酸序列如seq?id?no.1所示。
5、本發明的第二方面,提供上述質粒載體pccfr1-3um2的制備方法,包括以下步驟:
6、以cmvfny?rna1侵染性克隆質粒pcb301-cmvfny-r1為模板,利用seq?id?no.2和seqid?no.3所示的引物進行反向pcr擴增,獲得線性化載體;利用bamhi酶切與連接技術,最終獲得質粒載體pccfr1-3um2。
7、優選的,反向pcr擴增的條件為:95℃預變性3min;95℃變性15s,54℃退火15s,72℃延伸4min,30個循環;72℃徹底延伸5min;4℃保存。
8、本發明的第三方面,提供上述質粒載體pccfr1-3um2在構建植物病毒弱毒疫苗中的應用。
9、本發明的第四方面,提供上述質粒載體pccfr1-3um2作為弱毒疫苗在防治黃瓜花葉病毒病中的應用。
10、本發明的第五方面,提供一種植物弱毒疫苗,包括:質粒載體pccfr1-3um2、野生型cmvfnyrna2和野生型cmvfny?rna3。
11、優選的,質粒載體pccfr1-3um2、野生型cmvfnyrna2和野生型cmvfny?rna3的濃度比為1:1:1。
12、本發明的有益效果:
13、(1)本發明保留了黃瓜花葉病毒1a蛋白編碼序列,在rna1的3079-3080位核苷酸之間插入多克隆酶切位點ggatccgtcgaccccggg(bamhi、sali、smai),獲得一種黃瓜花葉病毒的弱毒突變體,該質粒與含有cmvfny分離物的rna2和rna3的質粒混合接種,可以預防cmv強毒株系的侵染,可作為抗黃瓜花葉病毒的弱毒疫苗。
14、(2)本發明獲得的黃瓜花葉病毒的弱毒疫苗載體pccfr1-3um2作為多價弱毒疫苗構建的基礎載體,至少可以容納200bp外源片段并保持遺傳穩定性,為構建多價弱毒疫苗提供更多病毒種類的選擇。
15、(3)對于獲得的黃瓜花葉病毒弱毒突變體,本發明可以作為多價弱毒疫苗構建的基礎載體,利用引入的多克隆酶切位點,插入其他重要的植物病毒序列,得到兼抗黃cmv及其他病毒的多價弱毒疫苗。基于獲得rna1的弱毒疫苗載體,既可以單獨使用;也可以根據需要和基于rna2的弱毒疫苗載體混合使用,提高疫苗的防治靶標病毒的范圍。
1.一種含有黃瓜花葉病毒fny分離物突變型rna1的質粒載體,其特征在于,所述質粒載體含有cmvfny分離物突變型rna1,所述cmvfny分離物突變型rna1的核苷酸序列如seq?idno.1所示。
2.權利要求1所述的質粒載體的制備方法,其特征在于,包括以下步驟:
3.根據權利要求2所述的制備方法,其特征在于,反向pcr擴增的條件為:95℃預變性3min;95℃變性15s,54℃退火15s,72℃延伸4min,30個循環;72℃徹底延伸5min;4℃保存。
4.權利要求1所述的質粒載體在構建植物病毒弱毒疫苗中的應用。
5.權利要求1所述的質粒載體作為弱毒疫苗在防治黃瓜花葉病毒病中的應用。
6.一種植物弱毒疫苗,其特征在于,包括:權利要求1所述的質粒載體、野生型cmvfnyrna2和野生型cmvfny?rna3。
7.根據權利要求6所述的植物弱毒疫苗,其特征在于,質粒載體、野生型cmvfnyrna2和野生型cmvfny?rna3的濃度比為1:1:1。