麻豆精品无码国产在线播放,国产亚洲精品成人AA片新蒲金,国模无码大尺度一区二区三区,神马免费午夜福利剧场

一種基于KAN網絡的lncRNA-疾病關聯預測方法

文檔序號:41775150發布日期:2025-04-29 18:49閱讀:來源:國知局

技術特征:

1.一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,包括以下步驟:

2.根據權利要求1所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,在步驟s1中,使用m×n的關聯網絡來表示lncrna-disease的關聯信息,其中,m表示lncrna的數量,n表示disease的數量;

3.根據權利要求2所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,lncrna序列相似性lsseq的計算過程中,使用smith-waterman序列比對算法來評估lncrna之間的序列相似性;計算序列相似性的公式如下:

4.根據權利要求3所述的基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,lncrna功能相似性lsfunc的計算過程中,采用公式表示為:

5.根據權利要求4所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,lncrna高斯相互作用譜核相似性lsgipk的計算過程中,lncrna之間的gipk核相似性計算公式如下:

6.根據權利要求5所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,疾病語義相似性dssem的計算過程中,使用疾病本體do來衡量相關疾病之間的語義相似性,表示為有向無環圖,通過利用do中疾病的層次結構,基于有向無環圖計算語義相似性,計算公式表示為:

7.根據權利要求6所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,疾病高斯相互作用譜核相似性dsgipk的計算過程中,計算公式表示為:

8.根據權利要求7所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,在步驟s2中,transformer特征提取器包括三層編碼層,在其中一個編碼層的第h個注意頭中,包含三個線性變換矩陣:query矩陣、key矩陣和value矩陣,具體的線性變換為:

9.根據權利要求8所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,在步驟s3中,graphsage特征提取器包括三層graphsage計算層組成,通過鄰居采樣和聚合機制實現特征提取;其中,對于每個lncrna和疾病節點,隨機采樣其鄰居節點集合,并計算其特征的均值,表示為:

10.根據權利要求9所述的一種基于kan網絡的lncrna-疾病關聯預測方法,其特征在于,在融合全局序列化特征和拓撲結構特征得到綜合的lncrna-disease關聯對特征信息的步驟中,其融合方式表示為:


技術總結
本發明適用于lncRNA與疾病關聯預測領域,具體提供了一種基于KAN網絡的lncRNA?疾病關聯預測方法,包括以下步驟:融合lncRNA?disease關聯網絡信息、lncRNA和疾病的多種相似性信息構建綜合的異構網絡;構建基于多頭注意力機制的Transformer特征提取器,用于捕獲來自lncRNA和disease節點的全局序列化特征;構建基于異構圖網絡的GraphSAGE特征提取器,用于捕獲lncRNA和disease節點的拓撲結構特征;融合全局序列化特征和拓撲結構特征得到綜合的lncRNA?disease關聯對特征信息;構建一個用于預測lncRNA和疾病之間關聯分數的KAN網絡。該方法結合Transformer提取全局序列特征、GraphSAGE挖掘異構網絡拓撲信息,并通過KAN網絡建模非線性關系,充分挖掘了lncRNA和疾病的多層次信息,提高了lncRNA和疾病之間關聯預測的精準性。

技術研發人員:關志豪,張筱丹,金秀,涂立靜,張耀武
受保護的技術使用者:安徽農業大學
技術研發日:
技術公布日:2025/4/28
當前第2頁1 2 
網友詢問留言 已有0條留言
  • 還沒有人留言評論。精彩留言會獲得點贊!
1
主站蜘蛛池模板: 神木县| 彭山县| 巴楚县| 淳安县| 济宁市| 珲春市| 凤庆县| 神农架林区| 犍为县| 阳曲县| 新蔡县| 长武县| 九台市| 玉树县| 东港市| 鹤壁市| 砚山县| 宣威市| 遵化市| 慈溪市| 磐安县| 平顶山市| 商水县| 喀什市| 乌拉特前旗| 蓬安县| 丰都县| 拉萨市| 通道| 高阳县| 孙吴县| 明光市| 德州市| 丹江口市| 邳州市| 新余市| 宜阳县| 兴仁县| 花垣县| 孟津县| 沙河市|